Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12070
• Subject: NM_018093.3
• Aligned Length: 1155
• Identities: 1097
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGGATCTTGAAAGGGGTAAATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGGATCTTGAAAGGGGTAAATCT  74

Query   75  TCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCCCTGTGTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCCCTGTGTT  148

Query  149  GGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAGGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAGGAT  222

Query  223  GGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCCCAGGCCGACGGCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCCCAGGCCGACGGCAC  296

Query  297  CCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACCCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACCCAC  370

Query  371  TCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAAGACCCAGCACACCCCCATGTGGTTGCCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAAGACCCAGCACACCCCCATGTGGTTGCCACA  444

Query  445  GGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTTTTCAGGGCCAAGAACGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTGTTCAGGGCCAAGAACGT  518

Query  519  GCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGGGACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAGAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGGGACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAGAAGC  592

Query  593  TTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCCAGCGCCGGCCAGTCCTAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCCAGCGCCGGCCAGTCCTAGAG  666

Query  667  ACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCATGACCCTCACTCCGGGAGGCAACTCAGTGATTGTGGGAAACAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCATGACCCTCACTCCGGGAGGCAACTCAGTGATTGTGGGAAACAC  740

Query  741  TCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAGGGCGTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGCAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAGGGCGTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGCAGTG  814

Query  815  TGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTTGAGGATACAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTTGAGGATACAC  888

Query  889  AGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATA-------------------------------------------  919
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  889  AGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATAAGGTTTATCTCAAGTCTCAATTGAACTGCCTCCTCTTGTCAGG  962

Query  920  --------------AGGATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGACACAGAGACAG  979
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGGGACAACTGGGAGGATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGACACAGAGACAG  1036

Query  980  ATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGCTCTC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGCTCTC  1110

Query 1054  CAAACGAGACGGAGAAAGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCC  1098
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAAACGAGACGGAGAAAGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCC  1155