Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12070
• Subject: NM_134139.1
• Aligned Length: 1160
• Identities: 947
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGGATCTTGAAAGGGGTAAATCT  74
            ||||||.||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGCGACTGCCTCGGCTCGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACTGAGACCGGCATCCTGAAAGGGGTGAACCT  74

Query   75  TCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCA---CGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCCCTGT  145
            ||||||.|||||.|||||.||.||||   ||.||   ||||||||||||||.|||||||||||||..||.||||
Sbjct   75  TCAGCGGAAACATGCGGCAAATTTCACACCGTCC---GGACAGCCGCGGCGGGAGGAGGCAGTGAATGCTCTGT  145

Query  146  GTTGGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAG  219
            |.||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||.||||||||.||.||||.|.||||.|...|.|||
Sbjct  146  GCTGGGGCACTGGCGGCGAGACCCAAATCTTGGTGGGCTGTGCGGACAGAACCGTGAGGTACTTTAATGCTGAG  219

Query  220  GATGGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCCCAGGCCGACGG  293
            ||.||.|.|||||.|.|.||||||.|||||||.||||||||.||||.||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  220  GAGGGTACATTCCTGAGCCAGAGATACTGCCCAGGCGGGGAAGGCACGTTCCGAGGTCTCGCCCAGGCGGATGG  293

Query  294  CACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACC  367
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||..|||.||.|||||.||..|.||||||||||
Sbjct  294  CACCCTTATCACATGTGTGGATTCTGGGATCCTCAGAGTCTGGTGTGAAAATGACAAAGAGGCGTCCTCTGACC  367

Query  368  CACTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAAGA-CCCAGCACACCCCCATGTGGTTGC  440
            |||||.|||||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||..|.|||||||||||
Sbjct  368  CACTCTTGGAACTGAAGGTGGGTCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAAGATCCCA-CACATACACATGTGGTTGC  440

Query  441  CACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTTTTCAGGGCCAAGA  514
            ||||.||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  441  CACATGTGGGAAAGAAAATGCTTTGAAAGTATGGGACCTACAGGGGTCTGAGGAGCCTGTATTCAGGGCCAAAA  514

Query  515  ACGTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGGGACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAG  588
            |.|||||||||||.|||||.||..|.||.|||||.||.||||||||.||.|.||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  515  ATGTGCGGAATGATTGGCTTGATCTCCGAGTTCCTATTTGGGACCAAGATACACAGTTCCTCCCTGGGTCACAG  588

Query  589  AAGCTTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCCAGCGCCGGCCAGTCCT  662
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  AAACTTGTCACATGCACAGGGTACCACCAGGTCCGTGTCTATGATCCAGTCTCCCCCCAGCGCCGGCCAGTCCT  662

Query  663  AGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCATGACCCTCACTCCGGGAGGCAACTCAGTGATTGTGGGAA  736
            ||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|..|||||.||.||.||.||.||.|
Sbjct  663  AGAGGCCACCTATGGAGAGTACCCACTGACAGCTATGACCCTTACTCCTGAGGGCAATTCCGTCATCGTAGGGA  736

Query  737  ACACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAGGGCGTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGC  810
            ||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  737  ACACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGATTTTCGGCAAGGGCGTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTTGCAGGT  810

Query  811  AGTGTGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTTGAGGAT  884
            |||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  AGTGTTCGTGGGCTGCAGTGTCACCCTTCAAAGCCCCTATTAGCCTCATGTGGCTTGGACAGAGTCTTGAGGAT  884

Query  885  ACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATA---------------------------------------  919
            |||||||||||..||||||||.||.||.|||||||                                       
Sbjct  885  ACACAGGATCCGCAATCCACGTGGGCTAGAGCATAAGGTTTATCTCAAGTCTCAACTGAACTGCCTTCTCCTGT  958

Query  920  ------------------AGGATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGACACAGAG  975
                              ||||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||.|||..|||||||||||||
Sbjct  959  CAGGCCGGGATAACTGGGAGGATGAGCCCCAAGAACCTCAAGAGCCCAACCAAGTACCCTCAGAAGACACAGAG  1032

Query  976  ACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGC  1049
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||.|||.|.|||||.||
Sbjct 1033  ACAGATGAACTTTGGGCCTCTTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAAGCTCCCAGATTTGGACCAGACACAAGGTGC  1106

Query 1050  TCTCCAAACGAGACGG-AGAAAGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCC  1098
            |||||||   |||.|| ||||| ||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1107  TCTCCAA---AGAAGGAAGAAA-AAGAAGCGGCCTGGATCCACCAGTCCT  1152