Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12070
• Subject: NR_161381.1
• Aligned Length: 1219
• Identities: 1094
• Gaps: 122

Alignment

Query    1  --------------------ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGG  54
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GTCTGCCTCCAGGCTTTGTCATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGG  74

Query   55  ATCTTGAAAGGGGTAAATCTTCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGA  128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTTGAAAGGGGTAAATCTTCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGA  148

Query  129  GGCAGTGAGCGCCCTGTGTTGGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGA  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCAGTGAGCGCCCTGTGTTGGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGA  222

Query  203  AGCACTTCAGCACCGAGGATGGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGC  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCACTTCAGCACCGAGGATGGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGC  296

Query  277  CTCGCCCAGGCCGACGGCACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAA  350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCGCCCAGGCCGACGGCACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAA  370

Query  351  GGACACATCCTCTGACCCACTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAAGACCCAGCAC  424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACACATCCTCTGACCCACTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAAGACCCAGCAC  444

Query  425  ACCCCCATGTGGTTGCCACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCT  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCCCCATGTGGTTGCCACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCT  518

Query  499  GTTTTCAGGGCCAAGAACGTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGGGACCAGGACATACAGTT  572
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGTTCAGGGCCAAGAACGTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGGGACCAGGACATACAGTT  592

Query  573  TCTCCCAGGATCACAGAAGCTTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCC  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTCCCAGGATCACAGAAGCTTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCC  666

Query  647  AGCGCCGGCCAGTCCTAGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCATGACCCTCACTCCGGGAGGCAAC  720
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  667  AGCGCCGGCCAGTCCTAGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCATGACCCTCACTCCGGGAGGCAAG  740

Query  721  TCAGTGATTGTGGGAAACACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAGGGCGTCTACTGGGCTGTCT  794
            |.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGA-TGATTGTGGGAAACACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAGGGCGTCTACTGGGCTGTCT  813

Query  795  GAAGGGGCTGGCAGGCAGTGTGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGG  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GAAGGGGCTGGCAGGCAGTGTGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGG  887

Query  869  ACAGAGTCTTGAGGATACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATA-----------------------  919
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  888  ACAGAGTCTTGAGGATACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATAAGGTTTATCTCAAGTCTCAATTG  961

Query  920  ----------------------------------AGGATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCC  959
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AACTGCCTCCTCTTGTCAGGCAGGGACAACTGGGAGGATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCC  1035

Query  960  CCTAGAAGACACAGAGACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CCTAGAAGACACAGAGACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGG  1109

Query 1034  AGCAGCCCCAAGGAGCTCTCCAAACGAGACGGAGAAAGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCC---------  1098
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1110  AGCAGCCCCAAGGAGCTCTCCAAACGAGACGGAGAAAGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCCTGACGCCCC  1183

Query 1099  -----------------------------------  1098
                                               
Sbjct 1184  TGTGCCCACTTTGTAAATAAACTGCTGAACACCCA  1218