Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12118
- Subject:
- XM_005247565.2
- Aligned Length:
- 1576
- Identities:
- 1302
- Gaps:
- 218
Alignment
Query 1 ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC 74
|||| || |..||| ||||.||..|||| ||.|.| ||||
Sbjct 1 ATGG-TG-----GTCACC---CAGCTGAATCTGG--AGTTTT--------------------GCTT-------- 35
Query 75 CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATG-GA-GCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGAC 146
||||..|| |||||.|| || ||| |||| |||.|||| |.||
Sbjct 36 --TCAGGGCA--------------------AGAAGCTGCGAGGCT-TCAG-----CTGTGAGC-------TTAC 74
Query 147 CC---CCAAGCCAC-TGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCGCCTG-------GTCCATAGGCCTTCAGGTGAC 209
|| || |||| |||.|.|| .||||| .|.|| ||.|||.||| |
Sbjct 75 CCGGTCC---CCACATGGGGTCT-----------------TGCCTGAATCTTTCTTCA----CCATCATGTG-C 123
Query 210 CA--------TGCCC-TTCATGTTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGG------GCCGGCATGCTTCTG--GACTA 266
|| ||||| ||| |||.|.|| ||..|||.|..| ||||||.||.|..|| .||.|
Sbjct 124 CAGGTCGTGGTGCCCATTC-----TGCTGTCC--GGCTTGTGCATGATGACAGCCGGCCTGGTGATGAACACCA 190
Query 267 TTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGTGAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGG 340
|| ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 TT--CAACACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGTGAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGG 262
Query 341 GGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGACTCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGAG 414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 GGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGACTCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGAG 336
Query 415 CAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTGT 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 CAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTGT 410
Query 489 GGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGCA 562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 GGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGCA 484
Query 563 GTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAAG 636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 GTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAAG 558
Query 637 CTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTCT 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTCT 632
Query 711 GGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTTG 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 GGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTTG 706
Query 785 CGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTGG 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 CGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTGG 780
Query 859 TTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGCA 932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGCA 854
Query 933 GTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGCC 1006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 GTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGCC 928
Query 1007 GAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAAC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 GAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAAC 1002
Query 1081 CCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAGG 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 CCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAGG 1076
Query 1155 CCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTGC 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTGC 1150
Query 1229 TCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTGG 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 TCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTGG 1224
Query 1303 CACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTACTGGCCT 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..| ||
Sbjct 1225 CACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAG-CT 1297
Query 1377 CC-TGG--CACTCTGCTTTTTCACTGACTGGCTACTAAGAGCAAGG-------------CAGAGCTGGGTGGCA 1434
|| ||| |||.||||| .||| |.|.||| |||| ||| |.||| |||.
Sbjct 1298 CCGTGGGCCACACTGCT-----GCTG------TGCCAAG---AAGGTGTACAGCCTCCCCAG-GATGG--GGCC 1354
Query 1435 TCTCAGAAC---TGGCATCTGGACCTCCCTAAC---------TGGGCCCCGCTG----------GTCCCATTTG 1486
||..|.||| | ||||||.| ||| ||| | |.||..|||| .|||..||||
Sbjct 1355 TCATACAACCCTT--CATCTGCA-CTC---AACATTTAATCGT-GTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTG 1421
Query 1487 CTCAT----------------- 1491
.|..|
Sbjct 1422 TTTGTTAGCAAAAACCTCTATT 1443