Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12131
• Subject: XM_011537506.2
• Aligned Length: 1316
• Identities: 1142
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCTTCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTCCCTGGGCGGTGCAGGCTGTGGAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCTTCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTCCCTGGGCGGTGCAGGCTGTGGAGCA  74

Query   75  CGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTGGCTGCCATGCAGAGCCGGCAGTGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTGGCTGCCATGCAGAGCCGGCAGTGGG  148

Query  149  TCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGAAAACTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGAAAACTGCA  222

Query  223  ATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTTGAAATTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTTGAAATTTT  296

Query  297  CCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCTGCAGGGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCTGCAGGGGG  370

Query  371  ATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTGCAATAAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTGCAATAAAG  444

Query  445  GAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATGCAACATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATGCAACATCA  518

Query  519  AAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGAGGAAGAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGAGGAAGAGA  592

Query  593  TAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGGTGGAGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGGTGGAGGAA  666

Query  667  GAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATGCTGATTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATGCTGATTGA  740

Query  741  CTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCACTTTATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCACTTTATAA  814

Query  815  AGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGCCTACAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGCCTACAATG  888

Query  889  TTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTGCAAGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTGCAAGTGGA  962

Query  963  GACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAAGCTAAGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAAGCTAAGAA  1036

Query 1037  AG----GT-GTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACA--CTGTTAATGATTG----CATTTGGCT  1099
            ||    || |||||||.|.|||                    || |  |||.|..||||||    .|||   ||
Sbjct 1037  AGCATTGTCGTGGAAGTTCTCC--------------------GA-ATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATT---CT  1086

Query 1100  TGCTGTGGGGGCATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCA---  1170
            |..|         ||.||.||||          ||      ||.||..|||       |.||| |||||.|   
Sbjct 1087  TTTT---------TCACTAGCGG----------CG------GTTTTTCTTT-------TATGT-CTTGTTATAA  1127

Query 1171  ------AGCACA----CCCCTCGTGTC-CAGGTTCCTCATGG---GCAGTGCTCGGGGTGACAAAGAA------  1224
                  |.|.||    .||||..|.|| .|.|.|.|.|||||   |||      .|||..||||||||      
Sbjct 1128  AGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCACATGGAAAGCA------AGGGGAACAAAGAAATCCTG  1195

Query 1225  -----GGCAACAGAACAGC--CCTC---------------------------------  1242
                 ||     |||.|.|  |||.                                 
Sbjct 1196  ATCTTGG-----GAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGAGTATTTTTCTCTT  1248