Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12202
- Subject:
- NM_001330367.2
- Aligned Length:
- 1328
- Identities:
- 1117
- Gaps:
- 208
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------ATGCCAATGTGGAA-------------- 14
||| ||||||
Sbjct 1 ATGGATGATGATGATTTTGGTGGTTTTGAGGCTGCGGAGACTTTTGATG-----GTGGAAGTGGTGAAACCCAA 69
Query 15 -----------------------------------TAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA 53
|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 ACAACATCTCCTGCTATTCCTTGGGCTGCCTTTCCTGCAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA 143
Query 54 GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA 217
Query 128 ATACACATGCAGCAAATAGCATTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCAT 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 ATACACATGCAGCAAATAGCATTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCAT 291
Query 202 CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC 365
Query 276 TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG 439
Query 350 TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA 513
Query 424 GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA 587
Query 498 ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTAC 571
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATA--------- 652
Query 572 TGCAGTCTTCAGTTAAGCAACAAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACAC 645
Sbjct 653 -------------------------------------------------------------------------- 652
Query 646 AAGTGTGAGGAGTTGCTAAATGCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 -------------------------AGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA 701
Query 720 AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG 775
Query 794 AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAATGAAGGATGCAGTTTTA 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 776 AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAGTGAAGGATGCAGTTTTA 849
Query 868 AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA 923
Query 942 TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA 997
Query 1016 CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA 1071
Query 1090 GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT 1145
Query 1164 GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA 1215