Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12222
• Subject: NM_001308018.1
• Aligned Length: 984
• Identities: 849
• Gaps: 135

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGTTGATCCAGGTATGCCTGTATTTTTACTGTAAATTTCTGTGGCGCTGCCTGAAATTTGTAATGAGGAAGCT  74

Query   1  -------------------------------------------------------------ATGAAAATCGAAA  13
                                                                        |||||||||||||
Sbjct  75  AACTGGAAGATGTGAACTACAACGGATCTGTTATAATACCAAGCCGGGAGCTTCTAGAACCATGAAAATCGAAA  148

Query  14  CATCACTGAGGGATTCTAAAAGTAAGCTGTTGCAGACTTCTGTGAGTGTTCACCCCGACGCTATTGAAAAAACT  87
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CATCACTGAGGGATTCTAAAAGTAAGCTGTTGCAGACTTCTGTGAGTGTTCACCCCGACGCTATTGAAAAAACT  222

Query  88  ATAGAAGATATCATGGAACTGAAAAAAATTAATCCTGACGTAAATCCACAGCTGGGAATCTCTCTTCAGGCTTG  161
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ATAGAAGATATCATGGAACTGAAAAAAATTAATCCTGACGTAAATCCACAGCTGGGAATCTCTCTTCAGGCTTG  296

Query 162  CCTTCTGCAAATCGTTGGGTACAGGAACCTTATTGCAGATGTGGAAAAACTGCGTAGAGAGGCCTATGATTCTG  235
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CCTTCTGCAAATCGTTGGGTACAGGAACCTTATTGCAGATGTGGAAAAACTGCGTAGAGAGGCCTATGATTCTG  370

Query 236  ATAATCCCCAACATGAAGAAATGCTTTTGAAGTTATGGAAATTCTTGAAGCCCAATACTCCACTGGAATCTCGG  309
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATAATCCCCAACATGAAGAAATGCTTTTGAAGTTATGGAAATTCTTGAAGCCCAATACTCCACTGGAATCTCGG  444

Query 310  ATTTCTAAGCAGTGGTGTGAAATTGGTTTCCAAGGTGATGATCCTAAAACAGACTTTCGAGGAATGGGACTTCT  383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATTTCTAAGCAGTGGTGTGAAATTGGTTTCCAAGGTGATGATCCTAAAACAGACTTTCGAGGAATGGGACTTCT  518

Query 384  GGGACTGTACAATTTGCAGTATTTCGCGGAAAGGGATGCCACAGCAGCTCAGCAGGTCCTGTCTGACTCTCTTC  457
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GGGACTGTACAATTTGCAGTATTTCGCGGAAAGGGATGCCACAGCAGCTCAGCAGGTCCTGTCTGACTCTCTTC  592

Query 458  ATCCGAAATGCAGGGATATCACTAAAGAAGAAATAAGCAAATTCAGCAAAGCAGAATGGGAGAAGAAAAGGATG  531
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ATCCGAAATGCAGGGATATCACTAAAGAAGAAATAAGCAAATTCAGCAAAGCAGAATGGGAGAAGAAAAGGATG  666

Query 532  GATAAGGCAATTGGGTACTCATTTGCAATTGTGGGCATCAATATAACTGACCTGGCATATAATCTACTGGTCAG  605
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GATAAGGCAATTGGGTACTCATTTGCAATTGTGGGCATCAATATAACTGACCTGGCATATAATCTACTGGTCAG  740

Query 606  CGGAGCTCTAAAAACCCATTTCTACAATATCGCCCCAGAAGCTCCAACATTGTCTCACTTTCAGCAAACATTCT  679
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  CGGAGCTCTAAAAACCCATTTCTACAATATCGCCCCAGAAGCTCCAACATTGTCTCACTTTCAGCAAACATTCT  814

Query 680  GCTATTTGATGCATGAATTTCATAAGTTTTGGATCGAAGAGGACCCCATGGACATAATGGAATTTAATCGTGTG  753
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  GCTATTTGATGCATGAATTTCATAAGTTTTGGATCGAAGAGGACCCCATGGACATAATGGAATTTAATCGTGTG  888

Query 754  AGGGAGAAATTCCGCAAGAGGATCATCAAACAGCTGCAGAACCCAGACATGGCGCTGTGCCCACATTTTGCTGC  827
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  AGGGAGAAATTCCGCAAGAGGATCATCAAACAGCTGCAGAACCCAGACATGGCGCTGTGCCCACATTTTGCTGC  962

Query 828  CTCGGAAGGTTTAATCAACATG  849
           ||||||||||||||||||||||
Sbjct 963  CTCGGAAGGTTTAATCAACATG  984