Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12238
• Subject: NM_029945.3
• Aligned Length: 827
• Identities: 656
• Gaps: 96

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MAFPHLQQPSFLLASLKADSINKPFAQRCQDLVKVIEDFPAKELHAVFPWLVESIFGSLDGVLVGWNLRCLQGR  74

Query   1  ------------------MMKLVYKLQAEDYKFDFPVSYLPGPVKASIQECILPDSPLYHNKVQFTPTGGLGLN  56
                             |||||||||||||.||||||.|||||||||||..|||||||||||||.||||||||
Sbjct  75  VNPVEYSTAMEFLDPSGPMMKLVYKLQAEDYNFDFPVSCLPGPVKASIQENVLPDSPLYHNKVQFPPTGGLGLN  148

Query  57  LALNPFEYYIFFFALSLITQKPLPVSLHVRTSDCAYFILVDRYLSWFLPTEGSVPPPLSSSPGGTSPSPPPRTP  130
           |||||||||.|.||||||.|||....|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||.||||
Sbjct 149  LALNPFEYYMFYFALSLISQKPMSMTLHVRTSDCAYFTLVDRYLSWFLPTEGSVPPPLCSSPGGSSPSPAPRTP  222

Query 131  AIPFASYGLHHTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSETLLQVFVEMWLHHYSLEMYQKMQSPHAKLEVLHYRL  204
           |.||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AMPFASYGL-HTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSETLLQVFVEMWLHHYSLEMYQKMQSPHAKLEVLHYRL  295

Query 205  SVSSALYSPAQPSLQALHAYQESFTPTEEHVLVVRLLLKHLHAFANSLKPEQASPSAHSHATSPLEEFKRAAVP  278
           .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  TVSSALHSPAQPSLQALHAYQESFTPTEEHVLVVRLLLKHLHAFANSLKPDQASPSAHSHATSPLEEFKRAAVP  369

Query 279  RFVQQKLYLFLQHCFGHWPLDASFRAVLEMWLSYLQPWRYAPDKQAPGSDSQPRCVSEKWAPFVQENLLMYTKL  352
           ||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 370  RFVQQKLYVFLQHCFGHWPLDATFRAVLEMWLSYLQPWRYAPEKQAQGSDPQPRCVSEKWAPFIQENLLMYTKL  443

Query 353  FVGFLNRALRTDLVSPKHALMVFRVAKVFAQPNLAEMIQKGEQLFLEPELVIPHRQHRLFTAPTFTGSFLSPWP  426
           ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|   |||||||
Sbjct 444  FVSFLNRALRTDLVSPKNALMVFRVAKVFAQPNLAEMIQKGEQLFLEPELIIPHRQHRLFTVTT---SFLSPWP  514

Query 427  PAVTDASFKVKSHVYSLEGQDCKYTPMFGPEARTLVLRLAQLITQAKHTAKSISDQCAESPAGHSFLSWLGFSS  500
           |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||..|||.|.||||||.|..
Sbjct 515  PVVTDASFKVKSHVYSLEGQDCKYTPMFGPEIRTLVLRLAQLITQAKQTAKSISDQYVESPTGRSFLSWLTFGL  588

Query 501  MDTNGSYTANDLDEMGQDSVRKTDEYLEKALEYLRQIFRLSEAQLRQFTLALGTTQDENGKKQLPDCIVGEDGL  574
           .|||..|.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||.|.|||||...|||||.|||||||||.||
Sbjct 589  TDTNSCYPANDLDEIGQDSIRKTDEYLEKALEYLRQIFRLSEAQLAQLTLALGSARDENGKQQLPDCIVGEEGL  662

Query 575  ILTPLGRYQIINGLRRFEIEYQGDPELQPIRSYEIASLVRTLFRLSSAINHRFAGQMAALCSRDDFLGSFCRYH  648
           ||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 663  ILTPLGRYQIINGLRRFEIEYQGDLELQPIRSYEITSLVRALFRLSSAINRRFAGQMAALCSRNDFLGSFCRYH  736

Query 649  LTEPGLASRHLLSPVGRRQVAGHTRGPRLSLRFLGSYRTLVSLLLAFFVASLFCVGPLPCTLLLTLGYVLYASA  722
           ||||.|..||||||||||||....||||||||||||||||..||.|||||||||.|||.|.|||.|||||||.|
Sbjct 737  LTEPALSNRHLLSPVGRRQVTNPARGPRLSLRFLGSYRTLLLLLMAFFVASLFCIGPLSCSLLLVLGYVLYAIA  810

Query 723  MTLLTERGKLHQP  735
           ||||||||||||.
Sbjct 811  MTLLTERGKLHQL  823