Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12238
• Subject: XM_006522722.2
• Aligned Length: 2495
• Identities: 1882
• Gaps: 316

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGTTCCCTCACCTACAACAGCCTAGTTTCCTTCTGGCTAGCCTGAAAGCTGACTCTATAAATAAGCCCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGCACAACGTTGCCAAGATTTGGTGAAAGTCATTGAGGATTTTCCAGCCAAGGAATTGCATGCCGTCTTCCCAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGCTGGTGGAAAGCATCTTTGGCAGCCTGGATGGTGTCCTTGTTGGTTGGAATCTCCGATGCCTACAGGGACGT  222

Query    1  ------------------------------------------------------ATGATGAAGTTGGTTTATAA  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGAACCCTGTGGAGTACAGCACAGCGATGGAATTTCTAGACCCAAGTGGTCCAATGATGAAGTTGGTTTATAA  296

Query   21  GCTTCAAGCTGAAGACTATAAGTTCGACTTTCCTGTCTCCT-ACTTGCCTGGTCCTGTGAAGGCGTCCATCCAG  93
            .||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||| .||| |||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  297  ACTTCAAGCTGAAGACTATAACTTTGATTTTCCTGTCTCCTGTCTT-CCTGGCCCTGTGAAGGCATCCATTCAA  369

Query   94  GAG--TGCATCCTCCCTGACAGTCCTCTGTACCACAACAAGGTCCAGTTCACCCCTACTGGGGGCCTTGGTCTG  165
            |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct  370  GAGAATG--TCCTCCCTGACAGTCCTCTGTACCACAACAAAGTCCAGTTTCCCCCGACCGGAGGCCTTGGCCTG  441

Query  166  AACTTGGCCCTGAATCCGTTCGAGTATTACATATTCTTCTTTGCCTTGAGCCTCATCACTCAGAAGCCACTTCC  239
            |||.|||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||.||||||.||||||||||||.||||.||||||.|..|
Sbjct  442  AACCTGGCCCTCAATCCATTTGAATACTATATGTTCTACTTTGCTTTGAGCCTCATCTCTCAAAAGCCAATGTC  515

Query  240  TGTGTCCCTCCACGTCCGTACTTCAGACTGTGCCTATTTCATCCTGGTGGACAGGTACCTGTCATGGTTCCTGC  313
            |.||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  516  TATGACCCTCCATGTCCGTACTTCGGACTGTGCCTATTTCACCCTGGTGGATAGGTACCTATCATGGTTCCTAC  589

Query  314  CCACCGAAGGCAGTGTGCCCCCACCACTCTCCTCCAGCCCAGGGGGGACCAGCCCCTCACCACCTCCCAGGACA  387
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.||..||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  590  CCACTGAAGGCAGCGTACCTCCACCACTCTGCTCCAGTCCAGGAGGCTCCAGCCCCTCACCAGCTCCCAGAACA  663

Query  388  CCAGCCATACCCTTTGCTTCCTATGGCCTCCACCACACTAGCCTCCTAAAGCGACACATCTCTCATCAGACATC  461
            ||||||||.||||||||.|||||||||||   |||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  CCAGCCATGCCCTTTGCCTCCTATGGCCT---CCACACTAGCCTCTTGAAGCGACACATCTCTCATCAGACATC  734

Query  462  TGTGAATGCAGACCCCGCCTCCCACGAGATCTGGAGGTCAGAAACTCTGCTCCAGGTTTTTGTTGAAATGTGGC  535
            |||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  735  TGTGAATGCAGACCCTGCATCCCATGAGATCTGGCGGTCAGAAACTCTCCTCCAGGTTTTTGTGGAAATGTGGC  808

Query  536  TTCATCACTATTCCTTGGAGATGTATCAAAAAATGCAGTCCCCTCATGCCAAGCTGGAGGTTCTGCACTACCGA  609
            |||||||.||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct  809  TTCATCATTACTCCCTGGAGATGTACCAAAAAATGCAGTCCCCTCATGCCAAGTTGGAGGTTCTACACTACCGA  882

Query  610  CTCAGTGTCTCCAGCGCCCTCTACAGCCCCGCCCAACCCAGCCTCCAGGCCCTCCACGCCTACCAAGAGTCGTT  683
            ||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  883  CTCACTGTCTCCAGCGCCCTCCACAGCCCTGCCCAACCCAGCCTCCAGGCCCTCCACGCCTACCAAGAGTCCTT  956

Query  684  CACGCCTACTGAGGAGCATGTGTTGGTGGTGCGCCTGCTGCTGAAGCACCTGCACGCCTTTGCCAACAGCCTGA  757
            ||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  957  CACGCCTACTGAAGAGCACGTGCTGGTGGTACGCCTGCTGCTGAAGCACCTGCATGCCTTTGCCAACAGCCTGA  1030

Query  758  AGCCAGAGCAGGCCTCACCCTCCGCCCACTCCCACGCCACCAGCCCCCTGGAGGAGTTCAAACGGGCTGCTGTC  831
            |||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1031  AGCCAGATCAGGCTTCGCCATCTGCACACTCCCATGCCACCAGTCCGCTGGAGGAATTCAAACGGGCCGCAGTG  1104

Query  832  CCGAGGTTCGTCCAGCAGAAACTCTACCTCTTCTTGCAGCATTGCTTTGGCCACTGGCCCCTGGACGCATCGTT  905
            ||..|.||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||
Sbjct 1105  CCTCGCTTTGTCCAGCAGAAGCTGTACGTCTTCCTGCAGCACTGTTTTGGCCACTGGCCTCTGGATGCAACCTT  1178

Query  906  CAGAGCTGTCCTGGAGATGTGGCTGAGCTACCTGCAGCCGTGGCGGTACGCGCCTGACAAGCAGGCTCCGGGCA  979
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||.||.|||||||.|||||
Sbjct 1179  CAGAGCTGTCTTGGAGATGTGGCTGAGCTACCTGCAGCCATGGAGGTATGCCCCTGAGAAACAGGCTCAGGGCA  1252

Query  980  GCGACTCCCAGCCCCGGTGTGTGTCGGAGAAATGGGCACCCTTTGTCCAGGAGAACCTGCTGATGTACACCAAG  1053
            ||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  GCGATCCCCAGCCACGGTGTGTGTCAGAGAAGTGGGCACCCTTCATCCAGGAAAACCTGCTGATGTACACCAAG  1326

Query 1054  TTGTTTGTGGGCTTTCTGAACCGCGCGCTCCGCACAGACCTGGTCAGCCCCAAGCACGCGCTCATGGTGTTCCG  1127
            .||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||
Sbjct 1327  CTGTTTGTGAGCTTTCTGAACCGTGCCCTACGCACAGACCTTGTCAGCCCCAAGAATGCACTCATGGTCTTCCG  1400

Query 1128  AGTGGCCAAAGTCTTTGCCCAGCCCAACCTGGCTGAGATGATTCAGAAAGGTGAGCAGCTATTCCTGGAGCCAG  1201
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1401  AGTGGCTAAGGTCTTTGCCCAGCCCAACCTGGCTGAGATGATCCAGAAAGGTGAGCAGCTGTTCCTGGAGCCGG  1474

Query 1202  AGCTGGTCATCCCCCACCGCCAGCACCGACTCTTCACGGCCCCCACATTCACTGGGAGCTTCCTGTCACCCTGG  1275
            ||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||.|.|.||||         .||||||||||||||.|||
Sbjct 1475  AGCTCATCATCCCCCACCGCCAACACCGGCTCTTCACAGTCACCAC---------CAGCTTCCTGTCACCATGG  1539

Query 1276  CCACCAGCGGTCACTGATGCCTCCTTCAAGGTGAAGAGCCACGTCTACAGCCTGGAGGGCCAGGACTGCAAGTA  1349
            ||.||.|..||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1540  CCCCCTGTTGTGACAGATGCCTCCTTCAAGGTGAAGAGCCATGTCTATAGCCTAGAGGGCCAAGACTGCAAATA  1613

Query 1350  CACCCCGATGTTTGGGCCCGAGGCCCGCACCCTGGTCCTGCGCCTCGCTCAGCTCATCACACAGGCCAAACACA  1423
            .|||||.||||||||.||.||...|||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1614  TACCCCAATGTTTGGTCCTGAAATCCGAACCCTGGTCTTGCGCCTTGCTCAGCTCATCACACAGGCCAAGCAGA  1687

Query 1424  CAGCCAAGTCCATCTCCGACCAGTGTGCGGAGAGCCCGGCTGGCCACTCCTTCCTCTCATGGCTGGGCTTTAGC  1497
            |.||||||||||||||.||.||||.||.|||.|||||..||||||.|||||||||.|||||||||..||||.||
Sbjct 1688  CTGCCAAGTCCATCTCTGATCAGTATGTGGAAAGCCCAACTGGCCGCTCCTTCCTGTCATGGCTGACCTTTGGC  1761

Query 1498  TCCATGGACACCAATGGCTCCTACACAGCCAACGACCTGGACGAGATGGGGCAAGACAGTGTCCGGAAGACAGA  1571
            ..||..|||||.|||.|||.||||.|||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||..||||.||||||||
Sbjct 1762  CTCACAGACACAAATAGCTGCTACCCAGCCAATGACCTGGATGAAATAGGTCAGGACAGCATCCGCAAGACAGA  1835

Query 1572  TGAATACCTGGAGAAGGCCCTGGAGTACCTGCGCCAGATATTCCGGCTCAGCGAAGCGCAGCTCAGG--CAGTT  1643
            .||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||  ||  |||.|
Sbjct 1836  CGAGTACTTAGAAAAGGCCCTGGAGTACCTGCGCCAGATATTCCGGCTCAGCGAAGCCCAGCT--GGCCCAGCT  1907

Query 1644  CACACTCGCCTTGGGCACCACCCAGGATGAGAATGGAAAAAAGCAACTCCCCGACTGCATCGTGGGTGAGGACG  1717
            |||.||.|||.||||.|...|.|.|||.||||||||.||..||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1908  CACGCTTGCCCTGGGGAGTGCTCGGGACGAGAATGGGAAGCAGCAGCTCCCAGATTGCATTGTGGGGGAAGAAG  1981

Query 1718  GACTCATCCTTACGCCCCTGGGGCGGTACCAGATCATCAATGGGCTGCGAAGGTTTGAAATTGAGTACCAGGGG  1791
            |||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1982  GACTCATCCTTACACCCTTGGGCCGCTACCAGATCATTAATGGTCTGCGAAGGTTCGAGATTGAGTACCAGGGA  2055

Query 1792  GACCCGGAGCTGCAGCCCATCCGGAGCTATGAGATCGCCAGCTTGGTCCGCACACTCTTTAGGCTGTCGTCTGC  1865
            |||...|||||||||||||||||||||||.||.|||.||||..|||||||..|||||||..|||||||.|||||
Sbjct 2056  GACTTAGAGCTGCAGCCCATCCGGAGCTACGAAATCACCAGTCTGGTCCGTGCACTCTTCCGGCTGTCCTCTGC  2129

Query 1866  CATCAACCACAGATTTGCAGGACAGATGGCGGCTCTGTGTTCCCGGGATGACTTCCTCGGCAGCTTCTGTCGCT  1939
            ||||||||..|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2130  CATCAACCGTAGATTTGCAGGCCAGATGGCAGCTCTGTGCTCCCGGAATGACTTCCTTGGCAGCTTCTGTCGCT  2203

Query 1940  ACCACCTCACAGAACCTGGGCTGGCCAGCAGGCACCTGCTGAGCCCTGTGGGGCGGAGGCAGGTGGCCGGCCAC  2013
            ||||||||||.||.||||...||..||.|||.||.||||||||||||||.||||||||||||||         |
Sbjct 2204  ACCACCTCACTGAGCCTGCCTTGAGCAACAGACATCTGCTGAGCCCTGTAGGGCGGAGGCAGGT---------C  2268

Query 2014  ACC---------CGCGGCCCCAGGCTCAGCCTGCGCTTCCTGGGCAGTTACCGGACGCTGGTCTCGCTGCTGCT  2078
            |||         ||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||..|||.|||.|
Sbjct 2269  ACCAATCCTGCACGGGGCCCCAGGCTCAGCCTCCGTTTCCTGGGCAGTTACCGGACACTGCTCCTGCTCCTGAT  2342

Query 2079  GGCCTTCTTCGTGGCCTCTCTGTTCTGCGTCGGGCCCCTCCCATGCACGCTGCTGCTCACCCTGGGCTATGTCC  2152
            |||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||..|.|||.|..||||.||...|||.||.||.||||
Sbjct 2343  GGCCTTCTTTGTGGCTTCTCTGTTCTGCATTGGGCCCCTGTCCTGCTCCTTGCTCCTGGTCCTAGGATACGTCC  2416

Query 2153  TCTACGCCTCTGCCATGACACTGCTGACCGAGCGGGGGAAGCTGCACCAGCCC  2205
            ||||.|||...||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 2417  TCTATGCCATAGCTATGACACTGCTCACTGAACGGGGGAAGCTGCACCAGCTC  2469