Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12245
• Subject: NM_001322031.1
• Aligned Length: 1067
• Identities: 784
• Gaps: 268

Alignment

Query    1  ATGGATGAGCTGGTACACGACTTAGCCTCAGCCTTGGAGCAGACATCTGAGCAGAATAAGCTTGGTGAACTGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGAGCTGGTACACGACTTAGCCTCAGCCTTGGAGCAGACATCTGAGCAGAATAAGCTTGGTGAACTGTG  74

Query   75  GGAGGAGATGGCGCTGAGCCCCCGACAGCAGAGGCGGCAGCTTCGGAAACGCCGAGGTCGGAAGCGTCGTTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGATGGCGCTGAGCCCCCGACAGCAGAGGCGGCAGCTTCGGAAACGCCGAGGTCGGAAGCGTCGTTCTG  148

Query  149  ACTTCACTCACCTGGCAGAGCATACCTGCTGCTACAGCGAGGCCTCTGAGTCAAGTCTGGATGAGGCCACTAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTTCACTCACCTGGCAGAGCATACCTGCTGCTACAGCGAGGCCTCTGAGTCAAGTCTGGATGAGGCCACTAAG  222

Query  223  GACTGTCGAGAAGTGGCTCCGGTGACCAATTTTAGTGACTCTGATGACACAATGGTAGCCAAACGACACCCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTGTCGAGAAGTGGCTCCGGTGACCAATTTTAGTGACTCTGATGACACAATGGTAGCCAAACGACACCCAGC  296

Query  297  TCTCAATGCCATTGTCAAGAGTAAGCAACATTCTTGGCATGAATCTGACTCCTTTACTGAAAATGCACCTTGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTCAATGCCATTGTCAAGAGTAAGCAACATTCTTGGCATGAATCTGACTCCTTTACTGAAAATGCACCTTGTC  370

Query  371  GACCACTCAGGCGCAGGCGGAAGGTGAAGCGAGTGACATCAGAGGTGGCTGCTAGCCTTCAGCAGAAGCTGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACCACTCAGGCGCAGGCGGAAGGTGAAGCGAGTGACATCAGAGGTGGCTGCTAGCCTTCAGCAGAAGCTGAAG  444

Query  445  GTGTCAGATTGGAGCTATGAGAGAGGCTGCAGGTTCAAGTCTGCTAAGAAGCAGCGTCTGTCCCGCTGGAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGTCAGATTGGAGCTATGAGAGAGGCTGCAGGTTCAAGTCTGCTAAGAAGCAGCGTCTGTCCCGCTGGAAGGA  518

Query  519  GAATACTCCCTGGACCTCATCAGGCCACGGATTGTGTGAATCAGCAGAAAATAGGACTTTCCTAAGCAAAACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATACTCCCTGGACCTCATCAGGCCACGGATTGTGTGAATCAGCAGAAAATAGGACTTTCCTAAGCAAAACAG  592

Query  593  GAAGGAAAGAAAGGATGGAGTGTGAAACAGATGAACAAAAACAGGGCTCTGATGAGAACATGTCAGAATGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGGAAAGAAAGGATGGAGTGTGAAACAGATGAACAAAAACAGGGCTCTGATGAGAACATGTCAGAATGTGAA  666

Query  667  ACCAGCAGTGTGTGTAGCAGCAGTGACACTGGGCTCTTTACCAATGATGAAGGGCGACAAGGTGATGACGAACA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|.
Sbjct  667  ACCAGCAGTGTGTGTAGCAGCAGTGACACTGGGCTCTTTACCAATGATGAAGGGCGACAAGGTAATGTCGATCC  740

Query  741  GAG---TG----ATTGGTTC------TATGAAGGAGAATGTGTCCCAGGATTCACTGTCCCTAATCTTCTGCCC  801
            .||   ||    .|||||||      ||||.|    |||          |||     |...|||||.|..|   
Sbjct  741  CAGCTTTGGGACCTTGGTTCCGTGTTTATGGA----AAT----------ATT-----TGAATAATCATAGG---  792

Query  802  AAGTGGGCTCCTGA-TCATTGTTCTGAAGTAGAAAGAATGGATTCTGGATTGGATAAATTTTCTGATTCCACAT  874
             ||        ||| ||||         |.||||  .||||                                 
Sbjct  793  -AG--------TGACTCAT---------GGAGAA--TATGG---------------------------------  813

Query  875  TCCTTTTACCTTCTCGGCCAGCTCAAAGAGGGTACCATACTCGCTTGAATCGTCTACCTGGAGCTGCAGCTCGA  948
                                                                                      
Sbjct  814  --------------------------------------------------------------------------  813

Query  949  TGCCTCAGAAAGGGGCGAAGAAGGCTGGTTGGGAAGGTGATACCTCTCACAGTTAGCTTGGCTCAGTGGGGAGA  1022
                                                                                      
Sbjct  814  --------------------------------------------------------------------------  813

Query 1023  TAATATTCCCTATGGGAGTTGTGTATCCTAT  1053
                                           
Sbjct  814  -------------------------------  813