Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12261
• Subject: NM_018179.4
• Aligned Length: 3811
• Identities: 3304
• Gaps: 497

Alignment

Query    1  ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCA  74

Query   75  ACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAA  148

Query  149  ATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATT  222

Query  223  GAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGT  296

Query  297  AAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTA  370

Query  371  AACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTA  444

Query  445  CTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGA  518

Query  519  TGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATG  592

Query  593  ATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGT  666

Query  667  GATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCAC  740

Query  741  TGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTG  814

Query  815  GTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTT  888

Query  889  TGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGG  962

Query  963  AGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTG  1036

Query 1037  ATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAG  1110

Query 1111  GTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGG  1184

Query 1185  TGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAA  1258

Query 1259  GTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCT  1332

Query 1333  TCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGA  1406

Query 1407  GAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGG  1480

Query 1481  TCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCT  1554

Query 1555  C---CAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGA  1625
            |   ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGA  1628

Query 1626  AAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTA  1702

Query 1700  AACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAAC  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAAC  1776

Query 1774  CAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAA  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAA  1850

Query 1848  GACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAAC  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAAC  1924

Query 1922  TACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACAT  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACAT  1998

Query 1996  CCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAA  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAA  2072

Query 2070  TGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTC  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTC  2146

Query 2144  CTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACT  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACT  2220

Query 2218  CCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTAC  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTAC  2294

Query 2292  TCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTG  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTG  2368

Query 2366  CAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTT  2439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTT  2442

Query 2440  GAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCC  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCC  2516

Query 2514  AAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTG  2587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTG  2590

Query 2588  CACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCT  2661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCT  2664

Query 2662  TTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAAT  2735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAAT  2738

Query 2736  TTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACA  2809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACA  2812

Query 2810  AAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGAT  2883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGAT  2886

Query 2884  TCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCA  2957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCA  2960

Query 2958  CACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTC  3031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTC  3034

Query 3032  TTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACC  3105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACC  3108

Query 3106  GTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCA  3179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCA  3182

Query 3180  GGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTG  3253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTG  3256

Query 3254  TTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATA--GTAAGAGATT---------------------TTTCTTGTA---TATGG  3301
            ||||||||||||||||||||||||  ||.|.|| ||                     |.|.|||||   .||||
Sbjct 3257  TTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTGTTACAG-TTCGAGTGCCTCAAACAACCACATATGTTGTAAACAATGG  3329

Query 3302  -----CCCCAAGAT--ACATG-----------------------------------------------------  3315
                 |||...|||  |||.|                                                     
Sbjct 3330  ACTAACCCTGGGATCAACAGGACCTCAGCTCACAGTGCATCACCGACCACCACAAGTGCATACTGAGCCCCCAC  3403

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3404  GCCCCGTGCACCCAGCACCCTTACCAGAAGCTCCACAACCACAGCGTCTGCCCCCAGAAGCTGCCAGCACATCT  3477

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3478  CTGCCTCAGAAGCCACACTTGAAGTTAGCACGCGTTCAGAGTCAAAATGGCATAGTACTGTCATGGAGTGTCCT  3551

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3552  GGAGGTGGATCGAAGCTGTGCCACTGTTGATAGCTACCATCTCTATGCTTACCATGAGGAACCCAGTGCCACTG  3625

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3626  TGCCCTCACAATGGAAAAAGATTGGGGAAGTCAAGGCACTTCCCTTGCCCATGGCATGTACTCTCACCCAGTTT  3699

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3700  GTATCTGGTAGCAAATACTACTTTGCAGTACGAGCCAAGGATATTTATGGACGTTTTGGGCCTTTCTGTGATCC  3773

Query 3316  -------------------------------------  3315
                                                 
Sbjct 3774  TCAGTCAACAGATGTGATCTCTTCTACCCAGAGCAGT  3810