Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12261
• Subject: NM_181352.2
• Aligned Length: 1278
• Identities: 1093
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  --------MDSLEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEAVYKVKEELLKTDVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIK  66
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MHQDQRFRMDSLEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEAVYKVKEELLKTDVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIK  74

Query   67  DKEEVNGIEEICFDPEGSKAEWKETPCILSVNVKNKQDDDLNCEPLSPHNITPEPVSKLPAEPVSGDPAPGDLD  140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DKEEVNGIEEICFDPEGSKAEWKETPCILSVNVKNKQDDDLNCEPLSPHNITPEPVSKLPAEPVSGDPAPGDLD  148

Query  141  AGDPASGVLASGDSTSGDPTSSEPSSSDAASGDATSGDAPSGDVSPGDATSGDATADDLSSGDPTSSDPIPGEP  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGDPASGVLASGDSTSGDPTSSEPSSSDAASGDATSGDAPSGDVSPGDATSGDATADDLSSGDPTSSDPIPGEP  222

Query  215  VPVEPISGDCAADDIASSEITSVDLASGAPASTDPASDDLASGDLSSSELASDDLATGELASDELTSESTFDRT  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  VPVEPISGDCAADDIASSEITSVDLASGAPASTDPASDDLASGDLSSSELASDDLATGELASDELTSESTFDRT  296

Query  289  FEPKSVPVCEPVPEIDNIEPSSNKDDDFLEKNGADEKLEQIQSKDSLDEKNKADNNIDANEETLETDDTTICSD  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  FEPKSVPVCEPVPEIDNIEPSSNKDDDFLEKNGADEKLEQIQSKDSLDEKNKADNNIDANEETLETDDTTICSD  370

Query  363  RPPENEKKVEEDIITELALGEDAISSSMEIDQGEKNEDETSADLVETINENVIEDNKSENILENTDSMETDEII  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RPPENEKKVEEDIITELALGEDAISSSMEIDQGEKNEDETSADLVETINENVIEDNKSENILENTDSMETDEII  444

Query  437  PILEKLAPSEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMESSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISGEKDESEV  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  PILEKLAPSEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMESSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISGEKDESEV  518

Query  511  ISQNETCSP-EVESNEKDNRPEEEEQVIHEDDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNVQSKRRRYMEEEYEAEFQVK  583
            ||||||||| |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ISQNETCSPAEVESNEKDNKPEEEEQVIHEDDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNVQSKRRRYMEEEYEAEFQVK  592

Query  584  ITAKGDINQKLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFEAAKE  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ITAKGDINQKLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFEAAKE  666

Query  658  DLKKRHEHPPNPPVSPGKTVNDVNSNNNMSYRNAGTVRQMLESKRNVSESAPPSFQTPVNTVSSTNLVTPPAVV  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  DLKKRHEHPPNPPVSPGKTVNDVNSNNNMSYRNAGTVRQMLESKRNVSESAPPSFQTPVNTVSSTNLVTPPAVV  740

Query  732  SSQPKLQTPVTSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLV  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  SSQPKLQTPVTSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLV  814

Query  806  TNQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNPTASAAPLGTTLAVQAVPTAHS  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TNQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNPTASAAPLGTTLAVQAVPTAHS  888

Query  880  IVQATRTSLPTVGPSGLYSPSTNRGPIQMKIPISAFSTSSAAEQNSNTTPRIENQTNKTIDASVSKKAADSTSQ  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  IVQATRTSLPTVGPSGLYSPSTNRGPIQMKIPISAFSTSSAAEQNSNTTPRIENQTNKTIDASVSKKAADSTSQ  962

Query  954  CGKATGSDSSGVIDLTMDDEESGASQDPKKLNHTPVSTMSSSQPVSRPLQPIQPAPPLQPSGVPTSGPSQTTIH  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGKATGSDSSGVIDLTMDDEESGASQDPKKLNHTPVSTMSSSQPVSRPLQPIQPAPPLQPSGVPTSGPSQTTIH  1036

Query 1028  LLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSKRFFLYMA  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||........
Sbjct 1037  LLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQT  1110

Query 1102  PRYM----------------------------------------------------------------------  1105
            ..|.                                                                      
Sbjct 1111  TTYVVNNGLTLGSTGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNG  1184

Query 1106  --------------------------------------------------------------------------  1105
                                                                                      
Sbjct 1185  IVLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYG  1258

Query 1106  --------------------  1105
                                
Sbjct 1259  RFGPFCDPQSTDVISSTQSS  1278