Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12312
• Subject: XM_011248927.2
• Aligned Length: 1509
• Identities: 1309
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGCAGGTGATTGT  14
                                                                        .|.|||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCGCAGTGTTTAAGGACCAGGCCTTTCTTCCCAGGGTGTGTCTCCTGCCCATTCTGCTTCAGGTGATTGT  74

Query   15  GATGTCAGCTACGATGGATGTGGACCTGTTCTCTCAGTATTTCAATGGCGCCCCCGTCCTCTACCTAGAGGGTC  88
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  GATGTCAGCTACCATGGATGTCGACCTGTTTTCTCAGTACTTCAATAGAGCCCCTGTCCTTTACCTTGAGGGTC  148

Query   89  GGCAGCATCCGATCCAGGTGTTTTACACCAAACAGCCTCAGAATGATTACCTGCACGCCGCGCTTGTCTCCGTC  162
            ||||||||||.||||||.|.||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct  149  GGCAGCATCCAATCCAGATCTTCTATACCAAACAGCCTCAGCAGGATTACCTGCATGCAGCCCTTGTCTCAGTC  222

Query  163  TTCCAGATCCACCAGGAAGCCCCTTCTTCACAGGACATCCTGGTGTTCCTCACTGGGCAGGAGGAGATCGAAGC  236
            ||||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCAGATCCACCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAAGACATCCTGGTGTTCCTCACTGGTCAGGAGGAGATCGAAGC  296

Query  237  CATGAGCAAGACGTGCCGAGACATTGCAAAGCACCTCCCAGACGGCTGCCCTGCGATGCTGGTCCTTCCTCTGT  310
            .|||||||||||.|||.|||||||.||||.||||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  AATGAGCAAGACCTGCAGAGACATCGCAAGGCACCTCCCAGATGGCTGCCCTTCAATGCTCGTCCTTCCTCTGT  370

Query  311  ACGCCTCCCTGCCCTATGCACAGCAGCTCCGAGTCTTCCAAGGGGCCCCAAAGGGCTATCGCAAAGTGATCATT  384
            |||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGCCTCCCTGCCCTATTCGCAGCAGCTTCGAGTCTTTCAAGGGGCCCCAAAGGGCTATCGCAAAGTGATCATT  444

Query  385  TCAACCAACATCGCTGAAACCTCCATAACCATTACAGGAATAAAATATGTAGTTGACACGGGCATGGTTAAAGC  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAACCAACATCGCTGAAACCTCCATAACCATTACAGGAATAAAATATGTAGTTGACACGGGCATGGTTAAAGC  518

Query  459  AAAGAAGTATAACCCTGACAGTGGTCTTGAGGTGTTAGCAGTGCAGCGGGTATCGAAGACGCAGGCTTGGCAGC  532
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.|||.|.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  AAAGAAGTATAACCCTGACAGTGGTCTTGAGGTACTAGCTGTACAGAGAGTATCAAAGACCCAGGCCTGGCAGC  592

Query  533  GCACAGGGAGGGCTGGCAGAGAGGACAGTGGCATCTGCTACCGGCTCTACACGGAGGACGAGTTTGAGAAGTTT  606
            |||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  GCACAGGCAGGGCTGGGCGAGAGGACAGTGGCATCTGCTACCGACTCTACACTGAGGACGAGTTTGAGAAGTTC  666

Query  607  GATAAGATGACCGTGCCAGAGATCCAGAGGTGTAACCTGGCCAGTGTGATGCTTCAGCTTCTAGCAATGAAAGT  680
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAAGATGACGGTGCCAGAGATCCAGAGGTGTAACCTGGCCAGTGTAATACTTCAGCTCCTAGCAATGAAAGT  740

Query  681  CCCAAATGTGCTCACCTTTGACTTCATGTCGAAGCCATCTCCAGATCACATTCAGGCGGCCATTGCCCAACTGG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCCAAATGTGCTCACCTTTGACTTCATGTCCAAACCTTCTCCAGATCACATTGAGGCGGCCATTGCCCAGCTGG  814

Query  755  ACCTGTTAGGTGCTCTTGAACATAAGGATGACCAGCTTACCCTGACTCCAATGGGAAGAAAGATGGCAGCATTT  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  ACCTGTTAGGTGCTCTTGAACATAAGGATGACCAGCTTACCCTGACTCCAATTGGAAGAAAGATGGCAGCATTC  888

Query  829  CCTTTAGAACCCAAATTTGCCAAAACCATCCTCATGTCCCCCAAATTCCACTGTACAGAGGAGATCCTGACCAT  902
            ||||||||.||||.||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CCTTTAGAGCCCAGATTTGCCAAAACTATCCTCCTGTCCTCCAAATTCCACTGTACCGAAGAGATTCTGACCAT  962

Query  903  TGTCTCCCTGCTGTCTGTGGACAGCGTCCTCCACAACCCTCCTTCCCGGCGAGAGGAAGTGCAAGGGGTCCGCA  976
            .|||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||.|||||.||||.||.|||||..|.|||||.|
Sbjct  963  AGTCTCCCTGCTATCTGTGGACAGTGTCCTTTACAACCCTCCTGCCCGGAGAGATGAGGTGCAGAGTGTCCGGA  1036

Query  977  AGAAGTTCATATCCAGCGAGGGGGATCACATGACCCTGCTCAATATCTATCGGACCTTCAAAAACCTAGGCGGA  1050
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.
Sbjct 1037  AGAAATTCATATCCAGTGAGGGGGATCACATCACCCTGCTCAATATCTATCGGACCTTCAAAAACATCGGTGGG  1110

Query 1051  AATAAGGATTGGTGCAAAGAGAATTTTGTCAACAGCAAGAATATGACGCTGGTAGCAGAAGTCAGAGCACAGCT  1124
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATAAGGACTGGTGCAAAGAGAATTTTGTCAACAGCAAGAATATGCTGCTAGTAGCTGAAGTCAGAGCACAGCT  1184

Query 1125  GAGGGACATCTGCTTAAAGATGTCAATGCCAATCGCATCATCCCGAGGAGACGTGGAGAGTGTCCGCCGCTGCC  1198
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||...|||||.|||||.|||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1185  GAGAGAAATCTGCTTAAAGATGTCAATGCCAATCATGTCATCTCGAGGGGACATGGAGAGTGTCCGCCGTTGCA  1258

Query 1199  TGGCTCACAGCCTCTTCATGAGCACCGCCGAGCTTCAGCCAGATGGCACCTATGCCACCACGGACACCCACCAG  1272
            ||||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259  TGGCTCACAGCCTCTTTATGAATACTGCTGAACTCCAGACAGATGGCACCTATGCCACCACGGACACACATCAG  1332

Query 1273  CCAGTGGCCATCCACCCGTCGTCTGTCCTCTTCCACTGCAAGCCGGCCTGCGTCGTGTACACTGAGCTGCTCTA  1346
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||...||||||||
Sbjct 1333  CCAGTGGCCATCCACCCATCATCTGTCCTCTTCCACTGCAAGCCTGCCTGCGTGGTCTACACTTCACTGCTCTA  1406

Query 1347  CACCAACAAGTGCTACATGCGGGACCTCTGCGTCATAGATGCACAGTGGCTGTACGAGGCTGCCCCTGAGTACT  1420
            |||||||||.|||||||||||.||||||||.||..|.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  CACCAACAAATGCTACATGCGTGACCTCTGTGTGGTGGATGCCGAGTGGCTCTACGAGGCTGCCCCTGACTACT  1480

Query 1421  TTAGGAGGAAGCTGAGAACCGCCAGAAAC  1449
            |.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  TCAGGAGGAAGCTGAGAACGGCCAGAAAC  1509