Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12329
• Subject: NM_020367.6
• Aligned Length: 1015
• Identities: 690
• Gaps: 320

Alignment

Query    1  ---------------------ATGTTTCACAAAGCAGAAGAATTATTTTCTAAAACAACAAACAATGAAGTGGA  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGGAAGCGAATCCAGAGATGTTTCACAAAGCAGAAGAATTATTTTCTAAAACAACAAACAATGAAGTGGA  74

Query   54  TGACATGGACACGTCAGATACCCAGTGGGGCTGGTTTTACTTGGCAGAATGTGGGAAGTGGCACATGTTTCAGC  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACATGGACACGTCAGATACCCAGTGGGGCTGGTTTTACTTGGCAGAATGTGGGAAGTGGCACATGTTTCAGC  148

Query  128  CGGATACCAACAGTCAGTGTTCAGTTAGCAGTGAAGATATCGAAAAAAGCTTCAAAACAAACCCTTGTGGCTCC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGATACCAACAGTCAGTGTTCAGTTAGCAGTGAAGATATCGAAAAAAGCTTCAAAACAAACCCTTGTGGCTCC  222

Query  202  ATTTCTTTTACTACTTCCAAATTCAGCTACAAGATAGACTTTGCAGAAATGAAGCAAATGAATCTCACCACTGG  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCTTTTACTACTTCCAAATTCAGCTACAAGATAGACTTTGCAGAAATGAAGCAAATGAATCTCACCACTGG  296

Query  276  AAAGCAGCGCTTAATAAAAAGAGCCCCCTTTTCTATCAGTGCTTTCAGTTACATCTGTGAAAACGAGGCCATCC  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGCAGCGCTTAATAAAAAGAGCCCCCTTTTCTATCAGTGCTTTCAGTTACATCTGTGAAAACGAGGCCATCC  370

Query  350  CTATGCCACCACACTGGGAGAATGTGAATACTCAAGTACCATATCAGCTTATTCCTCTGCACAATCAAACACAT  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTATGCCACCACACTGGGAGAATGTGAATACTCAAGTACCATATCAGCTTATTCCTCTGCACAATCAAACACAT  444

Query  424  GAATATAATGAAGTTGCTAATCTCTTTGGGAAGACGATGGATCGCAACCGAATTAAAAGAATTCAGAGAATTCA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATATAATGAAGTTGCTAATCTCTTTGGGAAGACGATGGATCGCAACCGAATTAAAAGAATTCAGAGAATTCA  518

Query  498  AAACCTAGATTTGTGGGAGTTCTTTTGCAGGAAAAAGGCTCAGCTCAAGAAAAAAAGAGGTGTGCCTCAGATTA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACCTAGATTTGTGGGAGTTCTTTTGCAGGAAAAAGGCTCAGCTCAAGAAAAAAAGAGGTGTGCCTCAGATTA  592

Query  572  ATGAACAAATGCTGTTTCATGGTACCAGCAGTGAATTTGTGGAAGCAATCTGCATTCATAACTTTGATTGGAGA  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAACAAATGCTGTTTCATGGTACCAGCAGTGAATTTGTGGAAGCAATCTGCATTCATAACTTTGATTGGAGA  666

Query  646  ATAAATGGTATACATGGTGCTGTCTTTGGAAAAGATAACATGT--------GGAAGCTG---------------  696
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||.|.|        .||.||||               
Sbjct  667  ATAAATGGTATACATGGTGCTGTCTTTGGAAAAG-GAACCTATTTTGCTAGAGATGCTGCTTATTCCAGTCGTT  739

Query  697  --------------------------------------------------------------------------  696
                                                                                      
Sbjct  740  TCTGCAAAGATGACATAAAGCATGGGAACACATTCCAAATTCATGGTGTCAGCTTGCAACAGCGGCATCTGTTT  813

Query  697  --------------------------------------------------------------------------  696
                                                                                      
Sbjct  814  AGAACATATAAATCTATGTTTCTTGCTCGAGTGCTAATTGGAGATTACATAAACGGAGACTCCAAATACATGCG  887

Query  697  --------------------------------------------------------------------------  696
                                                                                      
Sbjct  888  ACCTCCTTCCAAAGACGGGAGCTATGTGAATTTATATGACAGCTGTGTGGATGATACCTGGAACCCAAAGATCT  961

Query  697  -----------------------------------------------------  696
                                                                 
Sbjct  962  TTGTGGTTTTTGATGCCAACCAAATCTATCCTGAGTACTTGATAGACTTTCAT  1014