Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12338
• Subject: XM_005264439.4
• Aligned Length: 2217
• Identities: 1511
• Gaps: 705

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCATCAGCATGTACGCACGGGCCGGGATTGATGACATGTCCATGGAGAACAAGCCCCTGTATCAGATGCGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGCTGTCGGAGGCTTTTGTCATCAAAGCATGCCTCCGGCTTCTTGGGGGAACACAGTCCCGGTGGTCAGAGGT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCTGCAGGGGAGGCCTCTCTCTGGAACGCCTACCCAACTCCATCGCCTCCCGCTTCCGCCTGACAGAGAGGGAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAGGAAGTGATCACCTGTTTTGAGAGGGCCTCCTGGATCGCTCAGGTGTTCCTGCAGGAATTGGAGAAGACCAC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AAATAACAGCACGTCGAGGCATCTGAAAGGCTGTCACCCGCTTGACTATGAGCTCACCTACTTCCTGGAAGCTG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CCCTCCAGAGCGCCTATGTGAAAAACCTGAAGAAGGGGAACATCGTGAAGGGCATGAGAGAGCTCCGGGAGGTG  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  CTGCGGACTGTGGAGACCAAAGCAACTCAGAACTTCAAAGTGATGGCGGCCAAGCACCTGGCGGGGGTCCTGCT  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  GCACTCCCTGAGTGAGGAGTGCTACTGGAGCCCCCTGTCCCACCCTCTGCCTGAGTTCATGGGCAAGGAGGAGA  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  GTTCTTTCGCCACTCAGGCCCTGCGGAAACCTCACCTCTATGAAGGAGACAACCTCTACTGCCCCAAGGACAAC  666

Query    1  ---------------------------------------ATGGCAACTCGAGATGTGGTGCTGAGCCGGGTGCC  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCGAGGAAGCCCTCCTGCTCCTCCTCATCAGCGAATCCATGGCAACTCGAGATGTGGTGCTGAGCCGGGTGCC  740

Query   36  GGAGCAGGAGGAGGACCGGACAGTGAGCTTGCAGAATGCCGCAGCCATCTATGACCTCCTGAGCATCACGTTGG  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGCAGGAGGAGGACCGGACAGTGAGCTTGCAGAATGCCGCAGCCATCTATGACCTCCTGAGCATCACGTTGG  814

Query  110  GCAGAAGGGGACAGTACGTCATGCTCTCGGAGTGCCTGGAGCGAGCCATGAAGTTTGCGTTTGGAGAATTTCAC  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGAAGGGGACAGTACGTCATGCTCTCGGAGTGCCTGGAGCGAGCCATGAAGTTTGCGTTTGGAGAATTTCAC  888

Query  184  CTTTGGTACCAGGTGGCCCTCTCCATGGTGGCTTGTGGGAAGTCAGCCTACGCTGTGTCCCTGCTGCGGGAGTG  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTGGTACCAGGTGGCCCTCTCCATGGTGGCTTGTGGGAAGTCAGCCTACGCTGTGTCCCTGCTGCGGGAGTG  962

Query  258  TGTGAAGTTGCGGCCCTCGGACCCCACCGTGCCCCTGATGGCCGCGAAGGTCTGCATCGGGTCCCTTCGCTGGC  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGAAGTTGCGGCCCTCGGACCCCACCGTGCCCCTGATGGCCGCGAAGGTCTGCATCGGGTCCCTTCGCTGGC  1036

Query  332  TAGAGGAAGCAGAGCACTTTGCCATGATGGTGATCAGCCTCGGAGAGGAAGCCGGGGAGTTCCTCCCCAAGGGC  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGAGGAAGCAGAGCACTTTGCCATGATGGTGATCAGCCTCGGAGAGGAAGCCGGGGAGTTCCTCCCCAAGGGC  1110

Query  406  TACCTGGCTCTGGGTCTCACCTATAGCCTGCAGGCCACCGACGCCACCCTGAAGTCCAAGCAAGATGAATTGCA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACCTGGCTCTGGGTCTCACCTATAGCCTGCAGGCCACCGACGCCACCCTGAAGTCCAAGCAAGATGAATTGCA  1184

Query  480  CCGGAAGGCACTGCAGACGCTGGAGAGGGCTCAGCAGCTGGCGCCCAGTGACCCCCAGGTCATCCTCTATGTCT  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGGAAGGCACTGCAGACGCTGGAGAGGGCTCAGCAGCTGGCGCCCAGTGACCCCCAGGTCATCCTCTATGTCT  1258

Query  554  CGCTGCAGCTGGCCCTCGTCCGACAGATCTCCAGTGCCATGGAGCAGCTGCAGGAGGCCCTGAAGGTACGCAAG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCTGCAGCTGGCCCTCGTCCGACAGATCTCCAGTGCCATGGAGCAGCTGCAGGAGGCCCTGAAGGTACGCAAG  1332

Query  628  GATGATGCCCACGCCCTCCACCTGCTGGCACTGCTCTTCTCTGCCCAGAAGCACCACCAGCATGCCCTGGATGT  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGATGCCCACGCCCTCCACCTGCTGGCACTGCTCTTCTCTGCCCAGAAGCACCACCAGCATGCCCTGGATGT  1406

Query  702  TGTCAACATGGCCATCACCGAGCACCCTGGGAACTTCAACCTGATGTTCACCAAGGTGAAGCTGGAGCAGGTGC  775
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTCAACATGGCCATCACCGAGCACCCTGAGAACTTCAACCTGATGTTCACCAAGGTGAAGCTGGAGCAGGTGC  1480

Query  776  TGAAAGGCCCAGAGGAAGCCCTCGTGACCTGCAGACAAGTGCTGAGGCTGTGGCAGACCCTGTACAGCTTCTCC  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAAAGGCCCAGAGGAAGCCCTCGTGACCTGCAGACAAGTGCTGAGGCTGTGGCAGACCCTGTACAGCTTCTCC  1554

Query  850  CAGCTGGGAGGCCTAGAAAAGGATGGCAGCTTCGGTGAGGGCCTCACCATGAAGAAGCAGAGTGGCATGCACCT  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCTGGGAGGCCTAGAAAAGGATGGCAGCTTCGGTGAGGGCCTCACCATGAAGAAGCAGAGTGGCATGCACCT  1628

Query  924  GACTTTGCCTGATGCCCATGATGCAGACTCTGGCTCCCGGCGGGCTTCGTCCATCGCCGCCTCCCGGCTGGAGG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACTTTGCCTGATGCCCATGATGCAGACTCTGGCTCCCGGCGGGCTTCGTCCATCGCCGCCTCCCGGCTGGAGG  1702

Query  998  AGGCCATGTCAGAGCTGACTATGCCCTCTTCGGTCCTGAAGCAGGGCCCCATGCAGCTGTGGACCACGCTGGAA  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGCCATGTCAGAGCTGACTATGCCCTCTTCGGTCCTGAAGCAGGGCCCCATGCAGCTGTGGACCACGCTGGAA  1776

Query 1072  CAGATCTGGCTGCAGGCTGCTGAGCTGTTCATGGAGCAGCAGCACCTCAAGGAAGCAGGTTTCTGCATCCAGGA  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGATCTGGCTGCAGGCTGCTGAGCTGTTCATGGAGCAGCAGCACCTCAAGGAAGCAGGTTTCTGCATCCAGGA  1850

Query 1146  GGCGGCGGGCCTCTTCCCCACTTCTCACTCAGTACTCTATATGCGGGGCCGGCTGGCTGAGGTGAAGGGCAACC  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCGGCGGGCCTCTTCCCCACTTCTCACTCAGTACTCTATATGCGGGGCCGGCTGGCTGAGGTGAAGGGCAACC  1924

Query 1220  TGGAGGAGGCCAAGCAGCTGTACAAGGAGGCGCTCACGGTGAACCCAGATGGCGTGCGCATCATGCATAGCCTG  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGAGGAGGCCAAGCAGCTGTACAAGGAGGCGCTCACGGTGAACCCAGATGGCGTGCGCATCATGCATAGCCTG  1998

Query 1294  GGTCTGATGCTGAGTCGGCTGGGCCACAAGAGCTTGGCCCAGAAGGTGCTTCGTGATGCCGTGGAGAGGCAGAG  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGTCTGATGCTGAGTCGGCTGGGCCACAAGAGCTTGGCCCAGAAGGTGCTTCGTGATGCCGTGGAGAGGCAGAG  2072

Query 1368  TACGTGCCACGAGGCGTGGCAGGGCCTGGGCGAGGTGCTGCAGGCCCAGGGCCAGAACGAGGCTGCCGTTGACT  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TACGTGCCACGAGGCGTGGCAGGGCCTGGGCGAGGTGCTGCAGGCCCAGGGCCAGAACGAGGCTGCCGTTGACT  2146

Query 1442  GCTTCCTCACCGCCCTTGAGCTGGAGGCCAGCAGCCCTGTACTGCCCTTCTCCATCATCCCCAGAGAGCTC  1512
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCTTCCTCACCGCCCTTGAGCTGGAGGCCAGCAGCCCTGTACTGCCCTTCTCCATCATCCCCAGAGAGCTC  2217