Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12375
• Subject: XM_024447219.1
• Aligned Length: 1101
• Identities: 976
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGTATGTGACAACCTTAATCTCCCCTTTAGGGATGAGGGCTTCGATGCCATCATCTCCATAGGAGTCATACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCATTTTTCTACAAAACAAAGAAGAATCAGAGCAATAAAAGAAATGGCCAGGGTCTTAGTTCCCGGAGGCCAAC  148
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGGCCAGGGTCTTAGTTCCCGGAGGCCAAC  31

Query  149  TGATGATTTACGTTTGGGCAATGGAACAAAAGAACCGTCGCTTTGAGAAGCAAGACGTGCTTGTTCCATGGAAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  TGATGATTTACGTTTGGGCAATGGAACAAAAGAACCGTCACTTTGAGAAGCAAGACGTGCTTGTTCCATGGAAC  105

Query  223  AGGGCCCTGTGTTCCCAGCTCTTCTCAGAGTCCAGCCAGTCTGGGAGGAAGAGGCAGTGTGGATACCCAGAAAG  296
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  AGGGCTCTGTGTTCCCAGCTCTTCTCAGAGTCCAGCCAGTCTGGGAGGAAGAGGCAGTGTGGATACCCAGAAAG  179

Query  297  AGGCCATCCCTACCATCCTCCTTGCTCTGAGTGTAGCTGTTCTGTTTGTTTTAAAGAGCAGGGTGGTTCAAAAC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  180  AGGCCATCCCTACCATCCTCCTTGCTCTGAGTGTAGCTGTTCTGTTTGTTTTAAAGAGCAGTGTGGTTCAAAAC  253

Query  371  GGTCCCACAGTGTGGGCTATGAACCTGCTATGGCAAGAACCTGTTTTGCAAATATTTCTAAGGAAGGCGAGGAA  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  GGTCCCACAGCGTGGGCTATGAACCTGCTATGGCAAGAACCTGTTTTGCAAATATTTCTAAGGAAGGCGAGGAA  327

Query  445  GAATATGGATTTTACAGCACATTAGGAAAATCGTTTCGTTCCTGGTTTTTCTCCAGATCTTTGGATGAATCGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  GAATATGGATTTTACAGCACATTAGGAAAATCGTTTCGTTCCTGGTTTTTCTCCAGATCTTTGGATGAATCGAC  401

Query  519  TCTGAGGAAGCAAATTGAAAGAGTAAGACCCTTGAAAAACACAGAAGTTTGGGCCAGTAGCACTGTAACAGTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  TCTGAGGAAGCAAATTGAAAGAGTAAGACCCTTGAAAAACACAGAAGTTTGGGCCAGTAGCACTGTAACAGTCC  475

Query  593  AGCCTTCCAGACACTCTAGTCTAGACTTTGATCACCAAGAGCCATTTTCAACAAAAGAGCAAAGTTTAGATGAG  666
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  476  AGCCTTCCAGACACTCTAGTTTAGACTTTGATCACCAAGAGCCATTTTCAACAAAAGGGCAAAGTTTAGATGAG  549

Query  667  GAAGTGTTTGTGGAATCTTCTTCTGGAAAACACTTGGAGTGGCTGAGAGCACCAGGCACTCTGAAACATTTAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  GAAGTGTTTGTGGAATCTTCTTCTGGAAAACACTTGGAGTGGCTGAGAGCACCAGGCACTCTGAAACATTTAAA  623

Query  741  TGGAGACCATCAAGGGGAAATGAGGAGAAATGGAGGGGGAAATTTTCTGGATAGCACTAATACTGGTGTGAATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  TGGAGACCATCAAGGGGAAATGAGGAGAAATGGAGGGGGAAATTTTCTGGATAGCACTAATACTGGTGTGAATT  697

Query  815  GTGTGGATGCAGGCAACATAGAAGATGATAATCCTTCTGCTAGTAAAATATTGAGAAGGATTTCTGCAGTCGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  698  GTGTGGATGCAGGCAACATAGAAGATGATAATCCTTCTGCTAGTAAAATATTGAGAAGGATTTCTGCAGTTGAT  771

Query  889  TCCACAGATTTCAACCCAGATGATACAATGTCTGTCGAAGATCCACAGACTGATGTTTTGGACTCCACAGCCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  TCCACAGATTTCAACCCAGATGATACAATGTCTGTCGAAGATCCACAGACTGATGTTTTGGACTCCACAGCCTT  845

Query  963  TATGCGCTACTACCATGTGTTTCGAGAAGGGGAGCTCTGCAGTCTGCTCAAGGAGAATGTGTCAGAGCTCCGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  TATGCGCTACTACCATGTGTTTCGAGAAGGGGAGCTCTGCAGTCTGCTCAAGGAGAATGTGTCAGAGCTCCGTA  919

Query 1037  TCCTGAGTTCTGGGAATGATCATGGTAACTGGTGTATCATTGCAGAGAAAAAGGGAGGTTGTGAT  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  920  TCCTGAGTTCTGGGAATGATCATGGTAACTGGTGTATCATTGCAGAGAAAAAGAGAGGTTGTGAT  984