Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12376
• Subject: NM_020856.4
• Aligned Length: 3243
• Identities: 2694
• Gaps: 549

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGAGGAGGAAGCAGCAGGCGCCCCGGCGCGCAGCAGCCTATGTTTCCGAAGAGTTAAAGGCTGCTGCCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGTGGACGAAGGTTTAGACCCAGAGGAGCATACGGCAGATGGAGAGCCCTCGGCCAAGTACATGTGCCCGGAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGAGCTCGCCAGGGCCTGCCCCAGCTACCAGAACTCCCCGGCCGCCGAGTTTTCCTGCCATGAAATGGACAGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAGTCACACATCAGTGAGACCAGTGACCGAATGGCTGACTTTGAAAGCGGCTCCATCAAGAACGAAGAGGAGAC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CAAGGAGGTCACGGTCCCACTGGAAGACACGACTGTGTCGGATAGCCTGGAGCAGATGAAGGCCGTGTACAACA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  ACTTCCTCTCCAACTCCTACTGGTCCAACCTCAACCTCAACCTGCACCAGCCCTCCTCGGAGAAGAACAACGGC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  AGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGTGGCAGCGGGAGCTTCGACTGGCACCAGAGCGCCATGGC  518

Query    1  -------------------------------ATGCTCCCGGAGCCCAGCCTCTTCAGCACCGTGCAGCTGTACC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAGACGCTGCAGCAGGTGTCACAGAGCCGCATGCTCCCGGAGCCCAGCCTCTTCAGCACCGTGCAGCTGTACC  592

Query   44  GGCAGAGCAGCAAGCTCTATGGCTCCATCTTCACGGGGGCCAGCAAGTTCCGCTGTAAGGACTGCAGCGCTGCC  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCAGAGCAGCAAGCTCTATGGCTCCATCTTCACGGGGGCCAGCAAGTTCCGCTGTAAGGACTGCAGCGCTGCC  666

Query  118  TACGACACCCTGGTGGAGTTGACGGTGCACATGAACGAGACGGGGCATTACCGCGACGACAACCATGAGACCGA  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACGACACCCTGGTGGAGTTGACGGTGCACATGAACGAGACGGGGCATTACCGCGACGACAACCATGAGACCGA  740

Query  192  TAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGCTCCTTGCTGGAAATGGAAGGGAAGGAAGACGCCC  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGCTCCTTGCTGGAAATGGAAGGGAAGGAAGACGCCC  814

Query  266  AGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAGTCCCTGCAGGATTTGAGTGTCCATATGATCAAA  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAGTCCCTGCAGGATTTGAGTGTCCATATGATCAAA  888

Query  340  ACAAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTGAAGGAACCCGTCACTCCTGTCGCCGCCAAAATCATCCCTGCCACTCG  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTGAAGGAACCCGTCACTCCTGTCGCCGCCAAAATCATCCCTGCCACTCG  962

Query  414  GAAGAAAGCTTCCCTGGAGCTGGAGCTCCCCAGCTCCCCAGATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCATCT  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGAAAGCTTCCCTGGAGCTGGAGCTCCCCAGCTCCCCAGATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCATCT  1036

Query  488  CAGACACCAACGATGCACTTCAGAAGAACTCCAACCCTTACATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAAT  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGACACCAACGATGCACTTCAGAAGAACTCCAACCCTTACATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAAT  1110

Query  562  GGGGCCAGCTATGCATGGCACTTTGAGGCCCGGAAGTCGCAGATCCTGAAGTGCATGGAGTGTGGGAGCTCGCA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGGCCAGCTATGCATGGCACTTTGAGGCCCGGAAGTCGCAGATCCTGAAGTGCATGGAGTGTGGGAGCTCGCA  1184

Query  636  TGACACCCTGCAGGAGCTCACTGCCCACATGATGGTCACTGGCCACTTCATCAAGGTCACCAACTCTGCTATGA  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACACCCTGCAGGAGCTCACTGCCCACATGATGGTCACTGGCCACTTCATCAAGGTCACCAACTCTGCTATGA  1258

Query  710  AAAAGGGGAAGCCCATTGTGGAGACGCCTGTCACACCTACCATCACAACCCTGCTGGATGAGAAGGTCCAGTCC  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAGGGGAAGCCCATTGTGGAGACGCCTGTCACACCTACCATCACAACCCTGCTGGATGAGAAGGTCCAGTCC  1332

Query  784  GTGCCCCTGGCAGCCACCACCTTCACGTCCCCCTCCAATACACCTGCCAGCATCTCCCCAAAACTGAATGTGGA  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGCCCCTGGCAGCCACCACCTTCACGTCCCCCTCCAATACACCTGCCAGCATCTCCCCAAAACTGAATGTGGA  1406

Query  858  GGTCAAGAAGGAAGTCGACAAGGAGAAAGCGGTCACTGACGAGAAACCTAAGCAAAAAGACAAGCCTGGCGAAG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTCAAGAAGGAAGTCGACAAGGAGAAAGCGGTCACTGACGAGAAACCTAAGCAAAAAGACAAGCCTGGCGAAG  1480

Query  932  AAGAGGAGAAGTGTGACATCTCTTCCAAATACCATTACTTGACTGAAAATGACTTAGAAGAGAGTCCCAAGGGG  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGAGGAGAAGTGTGACATCTCTTCCAAATACCATTACTTGACTGAAAATGACTTAGAAGAGAGTCCCAAGGGG  1554

Query 1006  GGGCTTGATATCCTCAAATCCTTGGAAAACACAGTGACATCCGCAATCAACAAGGCCCAGAACGGCACTCCTAG  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGCTTGATATCCTCAAATCCTTGGAAAACACAGTGACATCCGCAATCAACAAGGCCCAGAACGGCACTCCTAG  1628

Query 1080  CTGGGGGGGCTATCCCAGCATCCATGCCGCCTACCAACTTCCCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGCTCGTCGG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGGGGGGGCTATCCCAGCATCCATGCCGCCTACCAACTTCCCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGCTCGTCGG  1702

Query 1154  GGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGTGAGATTGTCTCCCCGACGAAAAACCAGACCCTGGTC  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGTGAGATTGTCTCCCCGACGAAAAACCAGACCCTGGTC  1776

Query 1228  TCTCCACCCAGCAGCCAGACGTCCCCCATGCCCAAGACAAACTTTCATGCCATGGAGGAGCTGGTGAAAAAGGT  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTCCACCCAGCAGCCAGACGTCCCCCATGCCCAAGACAAACTTTCATGCCATGGAGGAGCTGGTGAAAAAGGT  1850

Query 1302  CACTGAGAAAGTTGCCAAAGTGGAGGAGAAGATGAAGGAGCCGGATGGGAAGCTTTCCCCGCCCAAGCGGGCCA  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACTGAGAAAGTTGCCAAAGTGGAGGAGAAGATGAAGGAGCCGGATGGGAAGCTTTCCCCGCCCAAGCGGGCCA  1924

Query 1376  CTCCCTCCCCATGTAGCAGCGAAGTCGGGGAACCCATCAAGATGGAGGCATCCAGCGATGGGGGCTTCCGCAGC  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCCCTCCCCATGTAGCAGCGAAGTCGGGGAACCCATCAAGATGGAGGCATCCAGCGATGGGGGCTTCCGCAGC  1998

Query 1450  CAGGAGAACAGCCCCAGCCCCCCGCGGGATGGGTGCAAGGATGGGAGCCCCCTCGCTGAGCCGGTGGAGAATGG  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGGAGAACAGCCCCAGCCCCCCGCGGGATGGGTGCAAGGATGGGAGCCCCCTCGCTGAGCCGGTGGAGAATGG  2072

Query 1524  CAAGGAGCTGGTGAAGCCCCTAGCCAGCAGTTTGAGTGGCAGCACGGCCATCATCACCGACCACCCGCCTGAAC  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAAGGAGCTGGTGAAGCCCCTAGCCAGCAGTTTGAGTGGCAGCACGGCCATCATCACCGACCACCCGCCTGAAC  2146

Query 1598  AGCCTTTTGTTAACCCTTTGAGCGCCCTGCAGTCAGTCATGAACATTCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCC  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCCTTTTGTTAACCCTTTGAGCGCCCTGCAGTCAGTCATGAACATTCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCC  2220

Query 1672  CTGCCTGCCCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAAGATGAGCAACAGCCTGGCGGAGAAGGCTGCTGTGGCCAC  1745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCCTGCCCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAAGATGAGCAACAGCCTGGCGGAGAAGGCTGCTGTGGCCAC  2294

Query 1746  CCCGCCGCCCCTGCAGTCCAAGAAGGCAGACCACCTCGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAACGACCAGCCCA  1819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCCGCCGCCCCTGCAGTCCAAGAAGGCAGACCACCTCGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAACGACCAGCCCA  2368

Query 1820  TAGACTTGACAAAAGGGAAGAGTGACAAAGGCTGCTCCTTGGGTTCAGTGCTTCTGTCACCCACGTCCACAGCC  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TAGACTTGACAAAAGGGAAGAGTGACAAAGGCTGCTCCTTGGGTTCAGTGCTTCTGTCACCCACGTCCACAGCC  2442

Query 1894  CCGGCAACCTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAAGACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCT  1967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCGGCAACCTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAAGACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCT  2516

Query 1968  ACGCGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGCTGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCA  2041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACGCGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGCTGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCA  2590

Query 2042  CTCCTTCCAGCATCTCCGAGAAGTCTGACATTGACGGGGCCACTCTGGAGGAGGCTGAGGAGTCGACGCCCGCC  2115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTCCTTCCAGCATCTCCGAGAAGTCTGACATTGACGGGGCCACTCTGGAGGAGGCTGAGGAGTCGACGCCCGCC  2664

Query 2116  CAGAAGAGGAAGGGCCGCCAGTCAAACTGGAACCCCCAGCACCTCCTGATCCTCCAGGCCCAGTTTGCCGCCAG  2189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAGAAGAGGAAGGGCCGCCAGTCAAACTGGAACCCCCAGCACCTCCTGATCCTCCAGGCCCAGTTTGCCGCCAG  2738

Query 2190  CCTCCGGCAGACCTCAGAAGGGAAGTACATCATGTCAGACCTGAGCCCCCAGGAGCGGATGCATATCTCCAGGT  2263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCTCCGGCAGACCTCAGAAGGGAAGTACATCATGTCAGACCTGAGCCCCCAGGAGCGGATGCATATCTCCAGGT  2812

Query 2264  TCACCGGGCTGTCCATGACCACCATCAGCCACTGGCTGGCCAACGTGAAATACCAGCTTCGAAGGACAGGTGGA  2337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TCACCGGGCTGTCCATGACCACCATCAGCCACTGGCTGGCCAACGTGAAATACCAGCTTCGAAGGACAGGTGGA  2886

Query 2338  ACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGCCACCCCGTCTTCTTTTGTAACGATTGTGCGTCCCAAATCAGGAC  2411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGCCACCCCGTCTTCTTTTGTAACGATTGTGCGTCCCAAATCAGGAC  2960

Query 2412  TCCTTCCACGTACATCAGTCACCTAGAGTCACACTTAGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCCAAACTGTCCACCG  2485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TCCTTCCACGTACATCAGTCACCTAGAGTCACACTTAGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCCAAACTGTCCACCG  3034

Query 2486  AACAGATTAACAGTCAGATAGCACAAACCAAGTCACCGTCAGAAAAAATGGTGACGTCCTCCCCCGAGGAAGAC  2559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AACAGATTAACAGTCAGATAGCACAAACCAAGTCACCGTCAGAAAAAATGGTGACGTCCTCCCCCGAGGAAGAC  3108

Query 2560  CTGGGGACTTCCTATCAGTGCAAACTTTGCAATCGGACCTTTGCCAGCAAGCACGCTGTTAAACTTCACCTTAG  2633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CTGGGGACTTCCTATCAGTGCAAACTTTGCAATCGGACCTTTGCCAGCAAGCACGCTGTTAAACTTCACCTTAG  3182

Query 2634  CAAAACACACGGGAAATCTCCGGAAGACCACCTTCTGTATGTCTCTGAGTTAGAGAAGCAG  2694
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CAAAACACACGGGAAATCTCCGGAAGACCACCTTCTGTATGTCTCTGAGTTAGAGAAGCAG  3243