Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12376
• Subject: NM_172298.2
• Aligned Length: 1081
• Identities: 862
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MPRRKQQAPRRAAAYVSDELKAAALVEDDVEPEEQAADGEPSAKYMCPEKELSKACPSYQNSPAAEFSSHEMDS  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ESHISETSDRMADFESSSIKNEEETKEVQVPLEDTIVSDSLEQMKAVYNNFLSNSYWSNLNLNLHQPSSENNGG  148

Query    1  -----------------------------------MLPEPSLFSTVQLYRQSSKLYGSIFTGASKFRCKDCSAA  39
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  SSSSSSSSSSSCGSGSFDWHQSAMAKTLQQVSQNRMLPEPSLFSTVQLYRQSSKLYGSIFTGASKFRCKDCSAA  222

Query   40  YDTLVELTVHMNETGHYRDDNHETDNNNPKRWSKPRKRSLLEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIK  113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  YDTLVELTVHMNETGHYRDDNHETDNNNPKRWSKPRKRSLLEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIK  296

Query  114  TKHYQKVPLKEPVTPVAAKIIPATRKKASLELELPSSPDSTGGTPKATISDTNDALQKNSNPYITPNNRYGHQN  187
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TKHYQKVPLKEPVTPVAAKIIPAARKKPSLELELPSSPDSTGGTPKATLSDASDALQKNSNPYITPNNRYGHQN  370

Query  188  GASYAWHFEARKSQILKCMECGSSHDTLQELTAHMMVTGHFIKVTNSAMKKGKPIVETPVTPTITTLLDEKVQS  261
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GASYAWHFEARKSQILKCMECGSSHDTLQELTAHMMVTGHFIKVTNSAMKKGKPIMETPVTPTITTLLDEKVQS  444

Query  262  VPLAATTFTSPSNTPASISPKLNVEVKKEVDKEKAVTDEKPKQKDKPGEEEEKCDISSKYHYLTENDLEESPKG  335
            |||||||||||||||||.||||.||.||||||||||.|||||...||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  VPLAATTFTSPSNTPASVSPKLAVEIKKEVDKEKAVPDEKPKEREKPSEEEEKYDISSKYHYLTENDLEESPKG  518

Query  336  GLDILKSLENTVTSAINKAQNGTPSWGGYPSIHAAYQLPNMMKLSLGSSGKSTPLKPMFGNSEIVSPTKNQTLV  409
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GLDILKSLENTVTSAINKAQNGTPSWGGYPSIHAAYQLPNMMKLSLGSSGKSTPLKPMFGNSEIVSPTKTQTLV  592

Query  410  SPPSSQTSPMPKTNFHAMEELVKKVTEKVAKVEEKMKEPDGKLSPPKRATPSPCSSEVGEPIKMEASSDGGFRS  483
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||.|.|
Sbjct  593  SPPSSQTSPMPKTNFHAMEELVKKVTEKVAKVEEKMKEPEGKLSPPKRATPSPCSSEQSEPIKMEASSDGSFKS  666

Query  484  QENSPSPPRDGCKDGSPLAEPVENGKELVKPLASSLSGSTAIITDHPPEQPFVNPLSALQSVMNIHLGKAAKPS  557
            ||||||||||.||..||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  QENSPSPPRDACKEASPSAEPVENGKELVKPLSGGLSGSTAIITDHPPEQPFVNPLSALQSVMNIHLGKAAKPS  740

Query  558  LPALDPMSMLFKMSNSLAEKAAVATPPPLQSKKADHLDRYFYHVNNDQPIDLTKGKSDKGCSLGSVLLSPTSTA  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  741  LPALDPMSMLFKMSNSLAEKAAVATPPPLQAKKAEHLDRYFYHVNNDQPIDLTKGKSDKGCSLGSGLLSPTSTS  814

Query  632  PATSSSTVTTAKTSAVVSFMSNSPLRENALSDISDMLKNLTESHTSKSSTPSSISEKSDIDGATLEEAEESTPA  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  PATSSSTVTTAKTSAVVSFMSNSPLRENALSDISDMLKNLTESHTSKSSTPSSISEKSDIDGATLEEAEESTPA  888

Query  706  QKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFAASLRQTSEGKYIMSDLSPQERMHISRFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGG  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  QKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFAASLRQTSEGKYIMSDLSPQERMHISRFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGG  962

Query  780  TKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQIRTPSTYISHLESHLGFRLRDLSKLSTEQINSQIAQTKSPSEKMVTSSPEED  853
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  963  TKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQIRTPSTYISHLESHLGFRLRDLSKLSTEQINNQIAQTKSPSEKLVTSSPEED  1036

Query  854  LGTSYQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLLYVSELEKQ  898
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1037  LGTTYQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLLFVSELEKQ  1081