Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12376
- Subject:
- XM_006539961.3
- Aligned Length:
- 3381
- Identities:
- 2390
- Gaps:
- 693
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTGGCGGTAAGAGCCTCTCTCCTCAGTCGTCTCTCAACAGCACATGCCATCCTGCACCTGCAGGATCTGTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CACATCCAGGTGGGATTCGCCAGAGGGGCACCCATCACAGAGCTCCCCCAGAAGAGACTTCTTTCATTTTCCAC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACTATGTCTCAGAGATCTTCCCAGCCTATGTTTCCGATGAGTTAAAGGCAGCTGCCTTGGTAGAAGATGACGTA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAGCCGGAGGAACAAGCGGCAGATGGAGAGCCCTCAGCCAAGTACATGTGTCCAGAGAAGGAACTCAGCAAGGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CTGCCCTAGCTACCAGAACTCACCGGCCGCTGAGTTCTCCAGCCATGAAATGGACAGCGAGTCTCACATCAGTG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AGACGAGTGACCGGATGGCTGACTTTGAAAGCAGTTCCATCAAGAATGAGGAGGAGACCAAGGAGGTCCAGGTG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CCCCTGGAGGACACCATCGTGTCTGATAGCCTGGAGCAGATGAAGGCCGTGTACAACAACTTCCTGTCCAATTC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CTATTGGTCCAACCTCAACCTGAACCTGCACCAGCCCTCCTCCGAGAACAATGGTGGCAGCAGTAGCAGCAGCA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCAGTAGCAGCAGCAGCTGTGGCAGCGGGAGCTTTGACTGGCACCAGAGTGCCATGGCGAAGACCCTGCAGCAG 666
Query 1 ---------------ATGCTCCCGGAGCCCAGCCTCTTCAGCACCGTGCAGCTGTACCGGCAGAGCAGCAAGCT 59
|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GTGTCCCAGAACCGAATGCTGCCGGAGCCCAGCCTGTTCAGCACCGTGCAGCTGTACCGCCAGAGCAGCAAGCT 740
Query 60 CTATGGCTCCATCTTCACGGGGGCCAGCAAGTTCCGCTGTAAGGACTGCAGCGCTGCCTACGACACCCTGGTGG 133
.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 741 GTACGGCTCCATTTTCACCGGGGCCAGCAAGTTCCGTTGCAAAGACTGTAGCGCCGCCTACGACACCCTGGTAG 814
Query 134 AGTTGACGGTGCACATGAACGAGACGGGGCATTACCGCGACGACAACCATGAGACCGATAACAACAACCCCAAG 207
||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTGACCGTGCACATGAATGAGACAGGTCACTATCGCGATGACAACCACGAGACCGACAACAACAACCCCAAG 888
Query 208 CGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGCTCCTTGCTGGAAATGGAAGGGAAGGAAGACGCCCAGAAGGTGCTGAAGTG 281
|||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 889 CGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGGTCTTTGTTGGAGATGGAGGGGAAGGAGGATGCTCAGAAGGTGCTCAAGTG 962
Query 282 CATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAGTCCCTGCAGGATTTGAGTGTCCATATGATCAAAACAAAACACTACCAAA 355
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 TATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAGTCCCTCCAAGACCTGAGCGTCCATATGATCAAAACTAAACACTACCAAA 1036
Query 356 AAGTGCCTCTGAAGGAACCCGTCACTCCTGTCGCCGCCAAAATCATCCCTGCCACTCGGAAGAAAGCTTCCCTG 429
||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||.||||.|||
Sbjct 1037 AAGTGCCTCTCAAGGAACCTGTCACACCCGTTGCAGCCAAAATCATCCCTGCTGCTCGGAAGAAACCTTCTCTG 1110
Query 430 GAGCTGGAGCTCCCCAGCTCCCCAGATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCATCTCAGACACCAACGATGC 503
|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||..|||.|||.||
Sbjct 1111 GAGCTGGAGCTGCCTAGCTCCCCTGATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCCTGTCTGATGCCAGCGACGC 1184
Query 504 ACTTCAGAAGAACTCCAACCCTTACATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAATGGGGCCAGCTATGCAT 577
.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGCAGAAGAACTCCAACCCTTACATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAACGGGGCCAGCTATGCAT 1258
Query 578 GGCACTTTGAGGCCCGGAAGTCGCAGATCCTGAAGTGCATGGAGTGTGGGAGCTCGCATGACACCCTGCAGGAG 651
|||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1259 GGCACTTCGAGGCCCGAAAGTCTCAGATCCTCAAATGCATGGAGTGTGGAAGCTCCCATGACACGCTCCAGGAG 1332
Query 652 CTCACTGCCCACATGATGGTCACTGGCCACTTCATCAAGGTCACCAACTCTGCTATGAAAAAGGGGAAGCCCAT 725
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCACAGCTCACATGATGGTCACTGGCCACTTTATCAAGGTCACAAACTCGGCCATGAAGAAGGGGAAGCCCAT 1406
Query 726 TGTGGAGACGCCTGTCACACCTACCATCACAACCCTGCTGGATGAGAAGGTCCAGTCCGTGCCCCTGGCAGCCA 799
..|||||||.||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1407 CATGGAGACACCGGTCACGCCCACCATCACCACCTTGCTGGACGAGAAGGTGCAGTCTGTGCCACTGGCAGCCA 1480
Query 800 CCACCTTCACGTCCCCCTCCAATACACCTGCCAGCATCTCCCCAAAACTGAATGTGGAGGTCAAGAAGGAAGTC 873
||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||..|||||||.||.|||...||||||.||||.||||||||.
Sbjct 1481 CCACATTCACGTCTCCCTCCAATACGCCCGCGAGTGTCTCCCCGAAGCTGGCGGTGGAGATCAAAAAGGAAGTG 1554
Query 874 GACAAGGAGAAAGCGGTCACTGACGAGAAACCTAAGCAAAAAGACAAGCCTGGCGAAGAAGAGGAGAAGTGTGA 947
||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||.|.|.|||.|||||..|.|||||.||||||||||.|||
Sbjct 1555 GACAAGGAGAAAGCAGTCCCGGATGAGAAACCCAAGGAGAGAGAGAAGCCCAGTGAAGAGGAGGAGAAGTATGA 1628
Query 948 CATCTCTTCCAAATACCATTACTTGACTGAAAATGACTTAGAAGAGAGTCCCAAGGGGGGGCTTGATATCCTCA 1021
.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1629 TATTTCTTCCAAGTACCACTATTTGACTGAAAACGACCTAGAAGAGAGCCCTAAAGGTGGACTAGATATCCTCA 1702
Query 1022 AATCCTTGGAAAACACAGTGACATCCGCAATCAACAAGGCCCAGAACGGCACTCCTAGCTGGGGGGGCTATCCC 1095
|||||.|.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1703 AATCCCTTGAGAACACAGTAACGTCTGCCATCAACAAGGCTCAGAATGGCACTCCCAGCTGGGGCGGCTATCCC 1776
Query 1096 AGCATCCATGCCGCCTACCAACTTCCCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGCTCGTCGGGGAAGAGCACGCCCCT 1169
||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGCATCCACGCTGCCTACCAGCTCCCCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGTTCCTCGGGGAAGAGCACGCCCCT 1850
Query 1170 GAAACCCATGTTTGGCAACAGTGAGAT--TGTCTCCCCGACGAAAAACCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAG 1241
|||||||||||||||||||||.||.|| |||||||| ||.||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAAACCCATGTTTGGCAACAGCGAAATCGTGTCTCCC--ACAAAAACCCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAG 1922
Query 1242 CCAGACGTCCCCCATGCCCAAGACAAACTTTCATGCCATGGAGGAGCTGGTGAAAAAGGTCACTGAGAAAGTTG 1315
||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1923 CCAGACCTCTCCCATGCCCAAGACAAACTTTCACGCCATGGAGGAACTGGTGAAAAAAGTCACGGAGAAAGTTG 1996
Query 1316 CCAAAGTGGAGGAGAAGATGAAGGAGCCGGATGGGAAGCTTTCCCCGCCCAAGCGGGCCACTCCCTCCCCATGT 1389
|||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 1997 CCAAAGTTGAGGAGAAAATGAAAGAGCCAGAAGGCAAGCTCTCGCCACCCAAGCGGGCCACGCCGTCCCCGTGC 2070
Query 1390 AGCAGCGA--AGTCGGGGAACCCATCAAGATGGAGGCATCCAGCGATGGGGGCTTCCGCAGCCAGGAGAACAGC 1461
|||||||| || .|.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||...||.||||||||.|||
Sbjct 2071 AGCAGCGAGCAG--AGCGAACCCATCAAGATGGAGGCCTCCAGCGACGGCAGCTTCAAAAGTCAGGAGAATAGC 2142
Query 1462 CCCAGCCCCCCGCGGGATGGGTGCAAGGATGGGAGCCCCCTCGCTGAGCCGGTGGAGAATGGCAAGGAGCTGGT 1535
||||||||.||..|.||||.|||||||||.|.|||||||..|||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 CCCAGCCCACCAAGAGATGCGTGCAAGGAGGCGAGCCCCTCCGCAGAGCCCGTAGAGAATGGCAAGGAGCTGGT 2216
Query 1536 GAAGCCCCT-AGCCAGCA-GTTTGAGTGGCAGCACGGCCATCATCACCGACCACCCGCCTGAACAGCCTTTTGT 1607
||||||||| ||| |.| ||.|.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2217 GAAGCCCCTGAGC--GGAGGTCTCAGCGGCAGCACAGCCATTATCACGGACCACCCACCAGAACAGCCTTTTGT 2288
Query 1608 TAACCCTTTGAGCGCCCTGCAGTCAGTCATGAACATTCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCCCTGCCTGCCC 1681
.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2289 GAACCCCCTGAGTGCCCTGCAGTCGGTCATGAACATCCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCGCTGCCTGCGC 2362
Query 1682 TGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAAGATGAGCAACAGCCTGGCGGAGAAGGCTGCTGTGGCCACCCCGCCGCCC 1755
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2363 TGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAAGATGAGCAACAGTCTGGCCGAGAAGGCAGCTGTGGCCACCCCACCACCC 2436
Query 1756 CTGCAGTCCAAGAAGGCAGACCACCTCGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAACGACCAGCCCATAGACTTGAC 1829
||.|||.||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 CTTCAGGCCAAGAAGGCGGAGCATCTGGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAATGACCAGCCCATAGACTTGAC 2510
Query 1830 AAAAGGGAAGAGTGACAAAGGCTGCTCCTTGGGTTCAGTGCTTCTGTCACCCACGTCCACAGCCCCGGCAACCT 1903
||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||.||||.||||.||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 2511 AAAAGGGAAGAGCGACAAAGGTTGCTCTTTAGGTTCAGGGCTTTTGTCCCCCACGTCCACATCCCCGGCAACTT 2584
Query 1904 CCTCATCCACGGTGACAACGGCAAAGACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCTACGCGAGAAT 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2585 CCTCATCCACGGTGACAACGGCAAAGACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCTGCGTGAGAAT 2658
Query 1978 GCCTTGTCAGATATATCCGATATGCTGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAG 2051
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659 GCCTTGTCAGATATATCCGATATGTTGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAG 2732
Query 2052 CATCTCCGAGAAGTCTGACATTGACGGGGCCACTCTGGAGGAGGCTGAGGAGTCGACGCCCGCCCAGAAGAGGA 2125
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 2733 CATCTCTGAGAAGTCTGACATTGACGGGGCCACCCTGGAAGAGGCCGAGGAGTCGACTCCGGCGCAGAAGAGGA 2806
Query 2126 AGGGCCGCCAGTCAAACTGGAACCCCCAGCACCTCCTGATCCTCCAGGCCCAGTTTGCCGCCAGCCTCCGGCAG 2199
|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2807 AAGGCCGCCAGTCAAACTGGAATCCTCAGCACCTGCTAATCCTGCAGGCGCAGTTTGCAGCTAGCCTGCGGCAG 2880
Query 2200 ACCTCAGAAGGGAAGTACATCATGTCAGACCTGAGCCCCCAGGAGCGGATGCATATCTCCAGGTTCACCGGGCT 2273
||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2881 ACTTCAGAAGGGAAGTACATCATGTCCGATCTGAGCCCCCAGGAGCGCATGCACATCTCCAGGTTCACCGGTCT 2954
Query 2274 GTCCATGACCACCATCAGCCACTGGCTGGCCAACGTGAAATACCAGCTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCC 2347
.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2955 CTCCATGACCACCATCAGCCATTGGCTGGCCAATGTGAAGTACCAACTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCC 3028
Query 2348 TCAAAAACTTGGACACTGGCCACCCCGTCTTCTTTTGTAACGATTGTGCGTCCCAAATCAGGACTCCTTCCACG 2421
|||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3029 TCAAAAACTTGGACACTGGACACCCAGTGTTCTTTTGTAACGACTGTGCGTCACAAATCAGGACTCCTTCCACG 3102
Query 2422 TACATCAGTCACCTAGAGTCACACTTAGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCCAAACTGTCCACCGAACAGATTAA 2495
||||||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 3103 TACATCAGCCACCTAGAGTCACATCTGGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCAAAATTGTCCACCGAACAGATTAA 3176
Query 2496 CAGTCAGATAGCACAAACCAAGTCACCGTCAGAAAAAATGGTGACGTCCTCCCCCGAGGAAGACCTGGGGACTT 2569
||.|||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||.||.||||||||..
Sbjct 3177 CAATCAAATAGCACAAACCAAGTCGCCGTCTGAAAAACTGGTGACATCCTCCCCGGAGGAGGATCTGGGGACCA 3250
Query 2570 CCTATCAGTGCAAACTTTGCAATCGGACCTTTGCCAGCAAGCACGCTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACACAC 2643
||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3251 CCTACCAGTGCAAACTTTGTAATCGGACCTTTGCGAGCAAGCATGCTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACCCAC 3324
Query 2644 GGGAAATCTCCGGAAGACCACCTTCTGTATGTCTCTGAGTTAGAGAAGCAG 2694
||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 3325 GGGAAATCACCGGAAGACCACCTCCTGTTCGTTTCTGAATTGGAGAAGCAG 3375
