Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12376
- Subject:
- XM_006539963.1
- Aligned Length:
- 3282
- Identities:
- 2390
- Gaps:
- 594
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGAGAGGCCTCGCACACACCACTTCATCTTGCAAACCTGCCTTTTCCCCAGAGTCTCCAAGCAGCATTAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTATGTTTCCGATGAGTTAAAGGCAGCTGCCTTGGTAGAAGATGACGTAGAGCCGGAGGAACAAGCGGCAGATG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GAGAGCCCTCAGCCAAGTACATGTGTCCAGAGAAGGAACTCAGCAAGGCCTGCCCTAGCTACCAGAACTCACCG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GCCGCTGAGTTCTCCAGCCATGAAATGGACAGCGAGTCTCACATCAGTGAGACGAGTGACCGGATGGCTGACTT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGAAAGCAGTTCCATCAAGAATGAGGAGGAGACCAAGGAGGTCCAGGTGCCCCTGGAGGACACCATCGTGTCTG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ATAGCCTGGAGCAGATGAAGGCCGTGTACAACAACTTCCTGTCCAATTCCTATTGGTCCAACCTCAACCTGAAC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CTGCACCAGCCCTCCTCCGAGAACAATGGTGGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCTGTGGCAG 518
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGCTCCCGG 10
|||||.||||
Sbjct 519 CGGGAGCTTTGACTGGCACCAGAGTGCCATGGCGAAGACCCTGCAGCAGGTGTCCCAGAACCGAATGCTGCCGG 592
Query 11 AGCCCAGCCTCTTCAGCACCGTGCAGCTGTACCGGCAGAGCAGCAAGCTCTATGGCTCCATCTTCACGGGGGCC 84
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 593 AGCCCAGCCTGTTCAGCACCGTGCAGCTGTACCGCCAGAGCAGCAAGCTGTACGGCTCCATTTTCACCGGGGCC 666
Query 85 AGCAAGTTCCGCTGTAAGGACTGCAGCGCTGCCTACGACACCCTGGTGGAGTTGACGGTGCACATGAACGAGAC 158
|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 667 AGCAAGTTCCGTTGCAAAGACTGTAGCGCCGCCTACGACACCCTGGTAGAGCTGACCGTGCACATGAATGAGAC 740
Query 159 GGGGCATTACCGCGACGACAACCATGAGACCGATAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGCT 232
.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 AGGTCACTATCGCGATGACAACCACGAGACCGACAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGGT 814
Query 233 CCTTGCTGGAAATGGAAGGGAAGGAAGACGCCCAGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAG 306
|.|||.||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTTTGTTGGAGATGGAGGGGAAGGAGGATGCTCAGAAGGTGCTCAAGTGTATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAG 888
Query 307 TCCCTGCAGGATTTGAGTGTCCATATGATCAAAACAAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTGAAGGAACCCGTCAC 380
|||||.||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 889 TCCCTCCAAGACCTGAGCGTCCATATGATCAAAACTAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTCAAGGAACCTGTCAC 962
Query 381 TCCTGTCGCCGCCAAAATCATCCCTGCCACTCGGAAGAAAGCTTCCCTGGAGCTGGAGCTCCCCAGCTCCCCAG 454
.||.||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 963 ACCCGTTGCAGCCAAAATCATCCCTGCTGCTCGGAAGAAACCTTCTCTGGAGCTGGAGCTGCCTAGCTCCCCTG 1036
Query 455 ATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCATCTCAGACACCAACGATGCACTTCAGAAGAACTCCAACCCTTAC 528
|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||..|||.|||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCCTGTCTGATGCCAGCGACGCCCTGCAGAAGAACTCCAACCCTTAC 1110
Query 529 ATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAATGGGGCCAGCTATGCATGGCACTTTGAGGCCCGGAAGTCGCA 602
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 ATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAACGGGGCCAGCTATGCATGGCACTTCGAGGCCCGAAAGTCTCA 1184
Query 603 GATCCTGAAGTGCATGGAGTGTGGGAGCTCGCATGACACCCTGCAGGAGCTCACTGCCCACATGATGGTCACTG 676
||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 GATCCTCAAATGCATGGAGTGTGGAAGCTCCCATGACACGCTCCAGGAGCTCACAGCTCACATGATGGTCACTG 1258
Query 677 GCCACTTCATCAAGGTCACCAACTCTGCTATGAAAAAGGGGAAGCCCATTGTGGAGACGCCTGTCACACCTACC 750
|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1259 GCCACTTTATCAAGGTCACAAACTCGGCCATGAAGAAGGGGAAGCCCATCATGGAGACACCGGTCACGCCCACC 1332
Query 751 ATCACAACCCTGCTGGATGAGAAGGTCCAGTCCGTGCCCCTGGCAGCCACCACCTTCACGTCCCCCTCCAATAC 824
|||||.|||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 ATCACCACCTTGCTGGACGAGAAGGTGCAGTCTGTGCCACTGGCAGCCACCACATTCACGTCTCCCTCCAATAC 1406
Query 825 ACCTGCCAGCATCTCCCCAAAACTGAATGTGGAGGTCAAGAAGGAAGTCGACAAGGAGAAAGCGGTCACTGACG 898
.||.||.||..|||||||.||.|||...||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.|
Sbjct 1407 GCCCGCGAGTGTCTCCCCGAAGCTGGCGGTGGAGATCAAAAAGGAAGTGGACAAGGAGAAAGCAGTCCCGGATG 1480
Query 899 AGAAACCTAAGCAAAAAGACAAGCCTGGCGAAGAAGAGGAGAAGTGTGACATCTCTTCCAAATACCATTACTTG 972
|||||||.|||.|.|.|||.|||||..|.|||||.||||||||||.|||.||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1481 AGAAACCCAAGGAGAGAGAGAAGCCCAGTGAAGAGGAGGAGAAGTATGATATTTCTTCCAAGTACCACTATTTG 1554
Query 973 ACTGAAAATGACTTAGAAGAGAGTCCCAAGGGGGGGCTTGATATCCTCAAATCCTTGGAAAACACAGTGACATC 1046
||||||||.|||.||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.||.||
Sbjct 1555 ACTGAAAACGACCTAGAAGAGAGCCCTAAAGGTGGACTAGATATCCTCAAATCCCTTGAGAACACAGTAACGTC 1628
Query 1047 CGCAATCAACAAGGCCCAGAACGGCACTCCTAGCTGGGGGGGCTATCCCAGCATCCATGCCGCCTACCAACTTC 1120
.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1629 TGCCATCAACAAGGCTCAGAATGGCACTCCCAGCTGGGGCGGCTATCCCAGCATCCACGCTGCCTACCAGCTCC 1702
Query 1121 CCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGCTCGTCGGGGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGTGAG 1194
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1703 CCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGTTCCTCGGGGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGCGAA 1776
Query 1195 AT--TGTCTCCCCGACGAAAAACCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAGCCAGACGTCCCCCATGCCCAAGACA 1266
|| |||||||| ||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1777 ATCGTGTCTCCC--ACAAAAACCCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAGCCAGACCTCTCCCATGCCCAAGACA 1848
Query 1267 AACTTTCATGCCATGGAGGAGCTGGTGAAAAAGGTCACTGAGAAAGTTGCCAAAGTGGAGGAGAAGATGAAGGA 1340
||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1849 AACTTTCACGCCATGGAGGAACTGGTGAAAAAAGTCACGGAGAAAGTTGCCAAAGTTGAGGAGAAAATGAAAGA 1922
Query 1341 GCCGGATGGGAAGCTTTCCCCGCCCAAGCGGGCCACTCCCTCCCCATGTAGCAGCGA--AGTCGGGGAACCCAT 1412
|||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||| || .|.||||||||
Sbjct 1923 GCCAGAAGGCAAGCTCTCGCCACCCAAGCGGGCCACGCCGTCCCCGTGCAGCAGCGAGCAG--AGCGAACCCAT 1994
Query 1413 CAAGATGGAGGCATCCAGCGATGGGGGCTTCCGCAGCCAGGAGAACAGCCCCAGCCCCCCGCGGGATGGGTGCA 1486
||||||||||||.||||||||.||..|||||...||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||.|||||
Sbjct 1995 CAAGATGGAGGCCTCCAGCGACGGCAGCTTCAAAAGTCAGGAGAATAGCCCCAGCCCACCAAGAGATGCGTGCA 2068
Query 1487 AGGATGGGAGCCCCCTCGCTGAGCCGGTGGAGAATGGCAAGGAGCTGGTGAAGCCCCT-AGCCAGCA-GTTTGA 1558
||||.|.|||||||..|||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| |.| ||.|.|
Sbjct 2069 AGGAGGCGAGCCCCTCCGCAGAGCCCGTAGAGAATGGCAAGGAGCTGGTGAAGCCCCTGAGC--GGAGGTCTCA 2140
Query 1559 GTGGCAGCACGGCCATCATCACCGACCACCCGCCTGAACAGCCTTTTGTTAACCCTTTGAGCGCCCTGCAGTCA 1632
|.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.
Sbjct 2141 GCGGCAGCACAGCCATTATCACGGACCACCCACCAGAACAGCCTTTTGTGAACCCCCTGAGTGCCCTGCAGTCG 2214
Query 1633 GTCATGAACATTCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCCCTGCCTGCCCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAA 1706
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 GTCATGAACATCCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCGCTGCCTGCGCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAA 2288
Query 1707 GATGAGCAACAGCCTGGCGGAGAAGGCTGCTGTGGCCACCCCGCCGCCCCTGCAGTCCAAGAAGGCAGACCACC 1780
||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.|
Sbjct 2289 GATGAGCAACAGTCTGGCCGAGAAGGCAGCTGTGGCCACCCCACCACCCCTTCAGGCCAAGAAGGCGGAGCATC 2362
Query 1781 TCGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAACGACCAGCCCATAGACTTGACAAAAGGGAAGAGTGACAAAGGCTGC 1854
|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2363 TGGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAATGACCAGCCCATAGACTTGACAAAAGGGAAGAGCGACAAAGGTTGC 2436
Query 1855 TCCTTGGGTTCAGTGCTTCTGTCACCCACGTCCACAGCCCCGGCAACCTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAA 1928
||.||.|||||||.||||.||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 TCTTTAGGTTCAGGGCTTTTGTCCCCCACGTCCACATCCCCGGCAACTTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAA 2510
Query 1929 GACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCTACGCGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGC 2002
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2511 GACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCTGCGTGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGT 2584
Query 2003 TGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAGCATCTCCGAGAAGTCTGACATTGAC 2076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2585 TGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAGCATCTCTGAGAAGTCTGACATTGAC 2658
Query 2077 GGGGCCACTCTGGAGGAGGCTGAGGAGTCGACGCCCGCCCAGAAGAGGAAGGGCCGCCAGTCAAACTGGAACCC 2150
||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2659 GGGGCCACCCTGGAAGAGGCCGAGGAGTCGACTCCGGCGCAGAAGAGGAAAGGCCGCCAGTCAAACTGGAATCC 2732
Query 2151 CCAGCACCTCCTGATCCTCCAGGCCCAGTTTGCCGCCAGCCTCCGGCAGACCTCAGAAGGGAAGTACATCATGT 2224
.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2733 TCAGCACCTGCTAATCCTGCAGGCGCAGTTTGCAGCTAGCCTGCGGCAGACTTCAGAAGGGAAGTACATCATGT 2806
Query 2225 CAGACCTGAGCCCCCAGGAGCGGATGCATATCTCCAGGTTCACCGGGCTGTCCATGACCACCATCAGCCACTGG 2298
|.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2807 CCGATCTGAGCCCCCAGGAGCGCATGCACATCTCCAGGTTCACCGGTCTCTCCATGACCACCATCAGCCATTGG 2880
Query 2299 CTGGCCAACGTGAAATACCAGCTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGCCACCC 2372
||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2881 CTGGCCAATGTGAAGTACCAACTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGACACCC 2954
Query 2373 CGTCTTCTTTTGTAACGATTGTGCGTCCCAAATCAGGACTCCTTCCACGTACATCAGTCACCTAGAGTCACACT 2446
.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..
Sbjct 2955 AGTGTTCTTTTGTAACGACTGTGCGTCACAAATCAGGACTCCTTCCACGTACATCAGCCACCTAGAGTCACATC 3028
Query 2447 TAGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCCAAACTGTCCACCGAACAGATTAACAGTCAGATAGCACAAACCAAGTCA 2520
|.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.
Sbjct 3029 TGGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCAAAATTGTCCACCGAACAGATTAACAATCAAATAGCACAAACCAAGTCG 3102
Query 2521 CCGTCAGAAAAAATGGTGACGTCCTCCCCCGAGGAAGACCTGGGGACTTCCTATCAGTGCAAACTTTGCAATCG 2594
|||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 3103 CCGTCTGAAAAACTGGTGACATCCTCCCCGGAGGAGGATCTGGGGACCACCTACCAGTGCAAACTTTGTAATCG 3176
Query 2595 GACCTTTGCCAGCAAGCACGCTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACACACGGGAAATCTCCGGAAGACCACCTTC 2668
|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 3177 GACCTTTGCGAGCAAGCATGCTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACCCACGGGAAATCACCGGAAGACCACCTCC 3250
Query 2669 TGTATGTCTCTGAGTTAGAGAAGCAG 2694
|||..||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 3251 TGTTCGTTTCTGAATTGGAGAAGCAG 3276