Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12376
Subject:
XM_006539964.3
Aligned Length:
3282
Identities:
2390
Gaps:
594

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGAGAGGCCTCGCACACACCACTTCATCTTGCAAACCTGCCTTTTCCCCAGAGTCTCCAAGCAGCATTAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTATGTTTCCGATGAGTTAAAGGCAGCTGCCTTGGTAGAAGATGACGTAGAGCCGGAGGAACAAGCGGCAGATG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GAGAGCCCTCAGCCAAGTACATGTGTCCAGAGAAGGAACTCAGCAAGGCCTGCCCTAGCTACCAGAACTCACCG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GCCGCTGAGTTCTCCAGCCATGAAATGGACAGCGAGTCTCACATCAGTGAGACGAGTGACCGGATGGCTGACTT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TGAAAGCAGTTCCATCAAGAATGAGGAGGAGACCAAGGAGGTCCAGGTGCCCCTGGAGGACACCATCGTGTCTG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  ATAGCCTGGAGCAGATGAAGGCCGTGTACAACAACTTCCTGTCCAATTCCTATTGGTCCAACCTCAACCTGAAC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  CTGCACCAGCCCTCCTCCGAGAACAATGGTGGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCTGTGGCAG  518

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGCTCCCGG  10
                                                                            |||||.||||
Sbjct  519  CGGGAGCTTTGACTGGCACCAGAGTGCCATGGCGAAGACCCTGCAGCAGGTGTCCCAGAACCGAATGCTGCCGG  592

Query   11  AGCCCAGCCTCTTCAGCACCGTGCAGCTGTACCGGCAGAGCAGCAAGCTCTATGGCTCCATCTTCACGGGGGCC  84
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  593  AGCCCAGCCTGTTCAGCACCGTGCAGCTGTACCGCCAGAGCAGCAAGCTGTACGGCTCCATTTTCACCGGGGCC  666

Query   85  AGCAAGTTCCGCTGTAAGGACTGCAGCGCTGCCTACGACACCCTGGTGGAGTTGACGGTGCACATGAACGAGAC  158
            |||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  AGCAAGTTCCGTTGCAAAGACTGTAGCGCCGCCTACGACACCCTGGTAGAGCTGACCGTGCACATGAATGAGAC  740

Query  159  GGGGCATTACCGCGACGACAACCATGAGACCGATAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGCT  232
            .||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  AGGTCACTATCGCGATGACAACCACGAGACCGACAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGGT  814

Query  233  CCTTGCTGGAAATGGAAGGGAAGGAAGACGCCCAGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAG  306
            |.|||.||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTTGTTGGAGATGGAGGGGAAGGAGGATGCTCAGAAGGTGCTCAAGTGTATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAG  888

Query  307  TCCCTGCAGGATTTGAGTGTCCATATGATCAAAACAAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTGAAGGAACCCGTCAC  380
            |||||.||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  TCCCTCCAAGACCTGAGCGTCCATATGATCAAAACTAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTCAAGGAACCTGTCAC  962

Query  381  TCCTGTCGCCGCCAAAATCATCCCTGCCACTCGGAAGAAAGCTTCCCTGGAGCTGGAGCTCCCCAGCTCCCCAG  454
            .||.||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  963  ACCCGTTGCAGCCAAAATCATCCCTGCTGCTCGGAAGAAACCTTCTCTGGAGCTGGAGCTGCCTAGCTCCCCTG  1036

Query  455  ATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCATCTCAGACACCAACGATGCACTTCAGAAGAACTCCAACCCTTAC  528
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||..|||.|||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTCCACAGGTGGAACCCCCAAAGCCACCCTGTCTGATGCCAGCGACGCCCTGCAGAAGAACTCCAACCCTTAC  1110

Query  529  ATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAATGGGGCCAGCTATGCATGGCACTTTGAGGCCCGGAAGTCGCA  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  ATCACGCCAAATAATCGGTACGGCCACCAGAACGGGGCCAGCTATGCATGGCACTTCGAGGCCCGAAAGTCTCA  1184

Query  603  GATCCTGAAGTGCATGGAGTGTGGGAGCTCGCATGACACCCTGCAGGAGCTCACTGCCCACATGATGGTCACTG  676
            ||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  GATCCTCAAATGCATGGAGTGTGGAAGCTCCCATGACACGCTCCAGGAGCTCACAGCTCACATGATGGTCACTG  1258

Query  677  GCCACTTCATCAAGGTCACCAACTCTGCTATGAAAAAGGGGAAGCCCATTGTGGAGACGCCTGTCACACCTACC  750
            |||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1259  GCCACTTTATCAAGGTCACAAACTCGGCCATGAAGAAGGGGAAGCCCATCATGGAGACACCGGTCACGCCCACC  1332

Query  751  ATCACAACCCTGCTGGATGAGAAGGTCCAGTCCGTGCCCCTGGCAGCCACCACCTTCACGTCCCCCTCCAATAC  824
            |||||.|||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  ATCACCACCTTGCTGGACGAGAAGGTGCAGTCTGTGCCACTGGCAGCCACCACATTCACGTCTCCCTCCAATAC  1406

Query  825  ACCTGCCAGCATCTCCCCAAAACTGAATGTGGAGGTCAAGAAGGAAGTCGACAAGGAGAAAGCGGTCACTGACG  898
            .||.||.||..|||||||.||.|||...||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.|
Sbjct 1407  GCCCGCGAGTGTCTCCCCGAAGCTGGCGGTGGAGATCAAAAAGGAAGTGGACAAGGAGAAAGCAGTCCCGGATG  1480

Query  899  AGAAACCTAAGCAAAAAGACAAGCCTGGCGAAGAAGAGGAGAAGTGTGACATCTCTTCCAAATACCATTACTTG  972
            |||||||.|||.|.|.|||.|||||..|.|||||.||||||||||.|||.||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1481  AGAAACCCAAGGAGAGAGAGAAGCCCAGTGAAGAGGAGGAGAAGTATGATATTTCTTCCAAGTACCACTATTTG  1554

Query  973  ACTGAAAATGACTTAGAAGAGAGTCCCAAGGGGGGGCTTGATATCCTCAAATCCTTGGAAAACACAGTGACATC  1046
            ||||||||.|||.||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.||.||
Sbjct 1555  ACTGAAAACGACCTAGAAGAGAGCCCTAAAGGTGGACTAGATATCCTCAAATCCCTTGAGAACACAGTAACGTC  1628

Query 1047  CGCAATCAACAAGGCCCAGAACGGCACTCCTAGCTGGGGGGGCTATCCCAGCATCCATGCCGCCTACCAACTTC  1120
            .||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1629  TGCCATCAACAAGGCTCAGAATGGCACTCCCAGCTGGGGCGGCTATCCCAGCATCCACGCTGCCTACCAGCTCC  1702

Query 1121  CCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGCTCGTCGGGGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGTGAG  1194
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1703  CCAACATGATGAAGTTGTCCCTGGGTTCCTCGGGGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGCGAA  1776

Query 1195  AT--TGTCTCCCCGACGAAAAACCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAGCCAGACGTCCCCCATGCCCAAGACA  1266
            ||  ||||||||  ||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1777  ATCGTGTCTCCC--ACAAAAACCCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAGCCAGACCTCTCCCATGCCCAAGACA  1848

Query 1267  AACTTTCATGCCATGGAGGAGCTGGTGAAAAAGGTCACTGAGAAAGTTGCCAAAGTGGAGGAGAAGATGAAGGA  1340
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1849  AACTTTCACGCCATGGAGGAACTGGTGAAAAAAGTCACGGAGAAAGTTGCCAAAGTTGAGGAGAAAATGAAAGA  1922

Query 1341  GCCGGATGGGAAGCTTTCCCCGCCCAAGCGGGCCACTCCCTCCCCATGTAGCAGCGA--AGTCGGGGAACCCAT  1412
            |||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||  ||  .|.||||||||
Sbjct 1923  GCCAGAAGGCAAGCTCTCGCCACCCAAGCGGGCCACGCCGTCCCCGTGCAGCAGCGAGCAG--AGCGAACCCAT  1994

Query 1413  CAAGATGGAGGCATCCAGCGATGGGGGCTTCCGCAGCCAGGAGAACAGCCCCAGCCCCCCGCGGGATGGGTGCA  1486
            ||||||||||||.||||||||.||..|||||...||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||.|||||
Sbjct 1995  CAAGATGGAGGCCTCCAGCGACGGCAGCTTCAAAAGTCAGGAGAATAGCCCCAGCCCACCAAGAGATGCGTGCA  2068

Query 1487  AGGATGGGAGCCCCCTCGCTGAGCCGGTGGAGAATGGCAAGGAGCTGGTGAAGCCCCT-AGCCAGCA-GTTTGA  1558
            ||||.|.|||||||..|||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||| |||  |.| ||.|.|
Sbjct 2069  AGGAGGCGAGCCCCTCCGCAGAGCCCGTAGAGAATGGCAAGGAGCTGGTGAAGCCCCTGAGC--GGAGGTCTCA  2140

Query 1559  GTGGCAGCACGGCCATCATCACCGACCACCCGCCTGAACAGCCTTTTGTTAACCCTTTGAGCGCCCTGCAGTCA  1632
            |.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.
Sbjct 2141  GCGGCAGCACAGCCATTATCACGGACCACCCACCAGAACAGCCTTTTGTGAACCCCCTGAGTGCCCTGCAGTCG  2214

Query 1633  GTCATGAACATTCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCCCTGCCTGCCCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAA  1706
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215  GTCATGAACATCCACCTGGGCAAGGCCGCCAAGCCCTCGCTGCCTGCGCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAA  2288

Query 1707  GATGAGCAACAGCCTGGCGGAGAAGGCTGCTGTGGCCACCCCGCCGCCCCTGCAGTCCAAGAAGGCAGACCACC  1780
            ||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.|
Sbjct 2289  GATGAGCAACAGTCTGGCCGAGAAGGCAGCTGTGGCCACCCCACCACCCCTTCAGGCCAAGAAGGCGGAGCATC  2362

Query 1781  TCGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAACGACCAGCCCATAGACTTGACAAAAGGGAAGAGTGACAAAGGCTGC  1854
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2363  TGGACCGCTATTTCTACCACGTCAACAATGACCAGCCCATAGACTTGACAAAAGGGAAGAGCGACAAAGGTTGC  2436

Query 1855  TCCTTGGGTTCAGTGCTTCTGTCACCCACGTCCACAGCCCCGGCAACCTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAA  1928
            ||.||.|||||||.||||.||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437  TCTTTAGGTTCAGGGCTTTTGTCCCCCACGTCCACATCCCCGGCAACTTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAA  2510

Query 1929  GACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCTACGCGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGC  2002
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2511  GACATCTGCCGTCGTATCATTCATGTCAAACTCGCCGCTGCGTGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGT  2584

Query 2003  TGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAGCATCTCCGAGAAGTCTGACATTGAC  2076
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2585  TGAAGAACTTGACAGAGAGCCACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAGCATCTCTGAGAAGTCTGACATTGAC  2658

Query 2077  GGGGCCACTCTGGAGGAGGCTGAGGAGTCGACGCCCGCCCAGAAGAGGAAGGGCCGCCAGTCAAACTGGAACCC  2150
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2659  GGGGCCACCCTGGAAGAGGCCGAGGAGTCGACTCCGGCGCAGAAGAGGAAAGGCCGCCAGTCAAACTGGAATCC  2732

Query 2151  CCAGCACCTCCTGATCCTCCAGGCCCAGTTTGCCGCCAGCCTCCGGCAGACCTCAGAAGGGAAGTACATCATGT  2224
            .||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2733  TCAGCACCTGCTAATCCTGCAGGCGCAGTTTGCAGCTAGCCTGCGGCAGACTTCAGAAGGGAAGTACATCATGT  2806

Query 2225  CAGACCTGAGCCCCCAGGAGCGGATGCATATCTCCAGGTTCACCGGGCTGTCCATGACCACCATCAGCCACTGG  2298
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2807  CCGATCTGAGCCCCCAGGAGCGCATGCACATCTCCAGGTTCACCGGTCTCTCCATGACCACCATCAGCCATTGG  2880

Query 2299  CTGGCCAACGTGAAATACCAGCTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGCCACCC  2372
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2881  CTGGCCAATGTGAAGTACCAACTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGACACCC  2954

Query 2373  CGTCTTCTTTTGTAACGATTGTGCGTCCCAAATCAGGACTCCTTCCACGTACATCAGTCACCTAGAGTCACACT  2446
            .||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..
Sbjct 2955  AGTGTTCTTTTGTAACGACTGTGCGTCACAAATCAGGACTCCTTCCACGTACATCAGCCACCTAGAGTCACATC  3028

Query 2447  TAGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCCAAACTGTCCACCGAACAGATTAACAGTCAGATAGCACAAACCAAGTCA  2520
            |.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.
Sbjct 3029  TGGGCTTCCGGCTACGGGACTTATCAAAATTGTCCACCGAACAGATTAACAATCAAATAGCACAAACCAAGTCG  3102

Query 2521  CCGTCAGAAAAAATGGTGACGTCCTCCCCCGAGGAAGACCTGGGGACTTCCTATCAGTGCAAACTTTGCAATCG  2594
            |||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 3103  CCGTCTGAAAAACTGGTGACATCCTCCCCGGAGGAGGATCTGGGGACCACCTACCAGTGCAAACTTTGTAATCG  3176

Query 2595  GACCTTTGCCAGCAAGCACGCTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACACACGGGAAATCTCCGGAAGACCACCTTC  2668
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 3177  GACCTTTGCGAGCAAGCATGCTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACCCACGGGAAATCACCGGAAGACCACCTCC  3250

Query 2669  TGTATGTCTCTGAGTTAGAGAAGCAG  2694
            |||..||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 3251  TGTTCGTTTCTGAATTGGAGAAGCAG  3276