Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12376
• Subject: XM_006539966.3
• Aligned Length: 3114
• Identities: 2390
• Gaps: 426

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGTCCAGAGAAGGAACTCAGCAAGGCCTGCCCTAGCTACCAGAACTCACCGGCCGCTGAGTTCTCCAGCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAAATGGACAGCGAGTCTCACATCAGTGAGACGAGTGACCGGATGGCTGACTTTGAAAGCAGTTCCATCAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATGAGGAGGAGACCAAGGAGGTCCAGGTGCCCCTGGAGGACACCATCGTGTCTGATAGCCTGGAGCAGATGAAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GCCGTGTACAACAACTTCCTGTCCAATTCCTATTGGTCCAACCTCAACCTGAACCTGCACCAGCCCTCCTCCGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GAACAATGGTGGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCTGTGGCAGCGGGAGCTTTGACTGGCACC  370

Query    1  --------------------------------------------ATGCTCCCGGAGCCCAGCCTCTTCAGCACC  30
                                                        |||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  AGAGTGCCATGGCGAAGACCCTGCAGCAGGTGTCCCAGAACCGAATGCTGCCGGAGCCCAGCCTGTTCAGCACC  444

Query   31  GTGCAGCTGTACCGGCAGAGCAGCAAGCTCTATGGCTCCATCTTCACGGGGGCCAGCAAGTTCCGCTGTAAGGA  104
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  445  GTGCAGCTGTACCGCCAGAGCAGCAAGCTGTACGGCTCCATTTTCACCGGGGCCAGCAAGTTCCGTTGCAAAGA  518

Query  105  CTGCAGCGCTGCCTACGACACCCTGGTGGAGTTGACGGTGCACATGAACGAGACGGGGCATTACCGCGACGACA  178
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct  519  CTGTAGCGCCGCCTACGACACCCTGGTAGAGCTGACCGTGCACATGAATGAGACAGGTCACTATCGCGATGACA  592

Query  179  ACCATGAGACCGATAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGCTCCTTGCTGGAAATGGAAGGG  252
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.|||
Sbjct  593  ACCACGAGACCGACAACAACAACCCCAAGCGCTGGTCCAAGCCTCGCAAACGGTCTTTGTTGGAGATGGAGGGG  666

Query  253  AAGGAAGACGCCCAGAAGGTGCTGAAGTGCATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAGTCCCTGCAGGATTTGAGTGT  326
            |||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||
Sbjct  667  AAGGAGGATGCTCAGAAGGTGCTCAAGTGTATGTACTGTGGCCACTCCTTTGAGTCCCTCCAAGACCTGAGCGT  740

Query  327  CCATATGATCAAAACAAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTGAAGGAACCCGTCACTCCTGTCGCCGCCAAAATCA  400
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  CCATATGATCAAAACTAAACACTACCAAAAAGTGCCTCTCAAGGAACCTGTCACACCCGTTGCAGCCAAAATCA  814

Query  401  TCCCTGCCACTCGGAAGAAAGCTTCCCTGGAGCTGGAGCTCCCCAGCTCCCCAGATTCCACAGGTGGAACCCCC  474
            |||||||..|||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCTGCTGCTCGGAAGAAACCTTCTCTGGAGCTGGAGCTGCCTAGCTCCCCTGATTCCACAGGTGGAACCCCC  888

Query  475  AAAGCCACCATCTCAGACACCAACGATGCACTTCAGAAGAACTCCAACCCTTACATCACGCCAAATAATCGGTA  548
            |||||||||.|.||.||..|||.|||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGCCACCCTGTCTGATGCCAGCGACGCCCTGCAGAAGAACTCCAACCCTTACATCACGCCAAATAATCGGTA  962

Query  549  CGGCCACCAGAATGGGGCCAGCTATGCATGGCACTTTGAGGCCCGGAAGTCGCAGATCCTGAAGTGCATGGAGT  622
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  963  CGGCCACCAGAACGGGGCCAGCTATGCATGGCACTTCGAGGCCCGAAAGTCTCAGATCCTCAAATGCATGGAGT  1036

Query  623  GTGGGAGCTCGCATGACACCCTGCAGGAGCTCACTGCCCACATGATGGTCACTGGCCACTTCATCAAGGTCACC  696
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  GTGGAAGCTCCCATGACACGCTCCAGGAGCTCACAGCTCACATGATGGTCACTGGCCACTTTATCAAGGTCACA  1110

Query  697  AACTCTGCTATGAAAAAGGGGAAGCCCATTGTGGAGACGCCTGTCACACCTACCATCACAACCCTGCTGGATGA  770
            |||||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||.||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct 1111  AACTCGGCCATGAAGAAGGGGAAGCCCATCATGGAGACACCGGTCACGCCCACCATCACCACCTTGCTGGACGA  1184

Query  771  GAAGGTCCAGTCCGTGCCCCTGGCAGCCACCACCTTCACGTCCCCCTCCAATACACCTGCCAGCATCTCCCCAA  844
            ||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||..|||||||.|
Sbjct 1185  GAAGGTGCAGTCTGTGCCACTGGCAGCCACCACATTCACGTCTCCCTCCAATACGCCCGCGAGTGTCTCCCCGA  1258

Query  845  AACTGAATGTGGAGGTCAAGAAGGAAGTCGACAAGGAGAAAGCGGTCACTGACGAGAAACCTAAGCAAAAAGAC  918
            |.|||...||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||.|.|.|||.
Sbjct 1259  AGCTGGCGGTGGAGATCAAAAAGGAAGTGGACAAGGAGAAAGCAGTCCCGGATGAGAAACCCAAGGAGAGAGAG  1332

Query  919  AAGCCTGGCGAAGAAGAGGAGAAGTGTGACATCTCTTCCAAATACCATTACTTGACTGAAAATGACTTAGAAGA  992
            |||||..|.|||||.||||||||||.|||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1333  AAGCCCAGTGAAGAGGAGGAGAAGTATGATATTTCTTCCAAGTACCACTATTTGACTGAAAACGACCTAGAAGA  1406

Query  993  GAGTCCCAAGGGGGGGCTTGATATCCTCAAATCCTTGGAAAACACAGTGACATCCGCAATCAACAAGGCCCAGA  1066
            |||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407  GAGCCCTAAAGGTGGACTAGATATCCTCAAATCCCTTGAGAACACAGTAACGTCTGCCATCAACAAGGCTCAGA  1480

Query 1067  ACGGCACTCCTAGCTGGGGGGGCTATCCCAGCATCCATGCCGCCTACCAACTTCCCAACATGATGAAGTTGTCC  1140
            |.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGGCACTCCCAGCTGGGGCGGCTATCCCAGCATCCACGCTGCCTACCAGCTCCCCAACATGATGAAGTTGTCC  1554

Query 1141  CTGGGCTCGTCGGGGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGTGAGAT--TGTCTCCCCGACGAAA  1212
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||  ||||||||  ||.|||
Sbjct 1555  CTGGGTTCCTCGGGGAAGAGCACGCCCCTGAAACCCATGTTTGGCAACAGCGAAATCGTGTCTCCC--ACAAAA  1626

Query 1213  AACCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAGCCAGACGTCCCCCATGCCCAAGACAAACTTTCATGCCATGGAGGA  1286
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1627  ACCCAGACCCTGGTCTCTCCACCCAGCAGCCAGACCTCTCCCATGCCCAAGACAAACTTTCACGCCATGGAGGA  1700

Query 1287  GCTGGTGAAAAAGGTCACTGAGAAAGTTGCCAAAGTGGAGGAGAAGATGAAGGAGCCGGATGGGAAGCTTTCCC  1360
            .|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1701  ACTGGTGAAAAAAGTCACGGAGAAAGTTGCCAAAGTTGAGGAGAAAATGAAAGAGCCAGAAGGCAAGCTCTCGC  1774

Query 1361  CGCCCAAGCGGGCCACTCCCTCCCCATGTAGCAGCGA--AGTCGGGGAACCCATCAAGATGGAGGCATCCAGCG  1432
            |.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||  ||  .|.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1775  CACCCAAGCGGGCCACGCCGTCCCCGTGCAGCAGCGAGCAG--AGCGAACCCATCAAGATGGAGGCCTCCAGCG  1846

Query 1433  ATGGGGGCTTCCGCAGCCAGGAGAACAGCCCCAGCCCCCCGCGGGATGGGTGCAAGGATGGGAGCCCCCTCGCT  1506
            |.||..|||||...||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||.|||||||||.|.|||||||..|||.
Sbjct 1847  ACGGCAGCTTCAAAAGTCAGGAGAATAGCCCCAGCCCACCAAGAGATGCGTGCAAGGAGGCGAGCCCCTCCGCA  1920

Query 1507  GAGCCGGTGGAGAATGGCAAGGAGCTGGTGAAGCCCCT-AGCCAGCA-GTTTGAGTGGCAGCACGGCCATCATC  1578
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||| |||  |.| ||.|.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1921  GAGCCCGTAGAGAATGGCAAGGAGCTGGTGAAGCCCCTGAGC--GGAGGTCTCAGCGGCAGCACAGCCATTATC  1992

Query 1579  ACCGACCACCCGCCTGAACAGCCTTTTGTTAACCCTTTGAGCGCCCTGCAGTCAGTCATGAACATTCACCTGGG  1652
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1993  ACGGACCACCCACCAGAACAGCCTTTTGTGAACCCCCTGAGTGCCCTGCAGTCGGTCATGAACATCCACCTGGG  2066

Query 1653  CAAGGCCGCCAAGCCCTCCCTGCCTGCCCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAAGATGAGCAACAGCCTGGCGG  1726
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2067  CAAGGCCGCCAAGCCCTCGCTGCCTGCGCTGGACCCCATGAGCATGCTTTTCAAGATGAGCAACAGTCTGGCCG  2140

Query 1727  AGAAGGCTGCTGTGGCCACCCCGCCGCCCCTGCAGTCCAAGAAGGCAGACCACCTCGACCGCTATTTCTACCAC  1800
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2141  AGAAGGCAGCTGTGGCCACCCCACCACCCCTTCAGGCCAAGAAGGCGGAGCATCTGGACCGCTATTTCTACCAC  2214

Query 1801  GTCAACAACGACCAGCCCATAGACTTGACAAAAGGGAAGAGTGACAAAGGCTGCTCCTTGGGTTCAGTGCTTCT  1874
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||.||||.|
Sbjct 2215  GTCAACAATGACCAGCCCATAGACTTGACAAAAGGGAAGAGCGACAAAGGTTGCTCTTTAGGTTCAGGGCTTTT  2288

Query 1875  GTCACCCACGTCCACAGCCCCGGCAACCTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAAGACATCTGCCGTCGTATCAT  1948
            |||.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289  GTCCCCCACGTCCACATCCCCGGCAACTTCCTCATCCACGGTGACAACGGCAAAGACATCTGCCGTCGTATCAT  2362

Query 1949  TCATGTCAAACTCGCCGCTACGCGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGCTGAAGAACTTGACAGAGAGC  2022
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2363  TCATGTCAAACTCGCCGCTGCGTGAGAATGCCTTGTCAGATATATCCGATATGTTGAAGAACTTGACAGAGAGC  2436

Query 2023  CACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAGCATCTCCGAGAAGTCTGACATTGACGGGGCCACTCTGGAGGAGGC  2096
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2437  CACACGTCAAAATCCTCCACTCCTTCCAGCATCTCTGAGAAGTCTGACATTGACGGGGCCACCCTGGAAGAGGC  2510

Query 2097  TGAGGAGTCGACGCCCGCCCAGAAGAGGAAGGGCCGCCAGTCAAACTGGAACCCCCAGCACCTCCTGATCCTCC  2170
            .|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2511  CGAGGAGTCGACTCCGGCGCAGAAGAGGAAAGGCCGCCAGTCAAACTGGAATCCTCAGCACCTGCTAATCCTGC  2584

Query 2171  AGGCCCAGTTTGCCGCCAGCCTCCGGCAGACCTCAGAAGGGAAGTACATCATGTCAGACCTGAGCCCCCAGGAG  2244
            ||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2585  AGGCGCAGTTTGCAGCTAGCCTGCGGCAGACTTCAGAAGGGAAGTACATCATGTCCGATCTGAGCCCCCAGGAG  2658

Query 2245  CGGATGCATATCTCCAGGTTCACCGGGCTGTCCATGACCACCATCAGCCACTGGCTGGCCAACGTGAAATACCA  2318
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2659  CGCATGCACATCTCCAGGTTCACCGGTCTCTCCATGACCACCATCAGCCATTGGCTGGCCAATGTGAAGTACCA  2732

Query 2319  GCTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGCCACCCCGTCTTCTTTTGTAACGATT  2392
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2733  ACTTCGAAGGACAGGTGGAACAAAGTTCCTCAAAAACTTGGACACTGGACACCCAGTGTTCTTTTGTAACGACT  2806

Query 2393  GTGCGTCCCAAATCAGGACTCCTTCCACGTACATCAGTCACCTAGAGTCACACTTAGGCTTCCGGCTACGGGAC  2466
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||||||||
Sbjct 2807  GTGCGTCACAAATCAGGACTCCTTCCACGTACATCAGCCACCTAGAGTCACATCTGGGCTTCCGGCTACGGGAC  2880

Query 2467  TTATCCAAACTGTCCACCGAACAGATTAACAGTCAGATAGCACAAACCAAGTCACCGTCAGAAAAAATGGTGAC  2540
            |||||.|||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||
Sbjct 2881  TTATCAAAATTGTCCACCGAACAGATTAACAATCAAATAGCACAAACCAAGTCGCCGTCTGAAAAACTGGTGAC  2954

Query 2541  GTCCTCCCCCGAGGAAGACCTGGGGACTTCCTATCAGTGCAAACTTTGCAATCGGACCTTTGCCAGCAAGCACG  2614
            .||||||||.|||||.||.||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2955  ATCCTCCCCGGAGGAGGATCTGGGGACCACCTACCAGTGCAAACTTTGTAATCGGACCTTTGCGAGCAAGCATG  3028

Query 2615  CTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACACACGGGAAATCTCCGGAAGACCACCTTCTGTATGTCTCTGAGTTAGAG  2688
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||.||.|||
Sbjct 3029  CTGTTAAACTTCACCTTAGCAAAACCCACGGGAAATCACCGGAAGACCACCTCCTGTTCGTTTCTGAATTGGAG  3102

Query 2689  AAGCAG  2694
            ||||||
Sbjct 3103  AAGCAG  3108