Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12408
• Subject: NM_001282590.2
• Aligned Length: 1005
• Identities: 567
• Gaps: 438

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTTCCCCAACATGCCTCACCCTCATCTATATCCTTTGGCAGCTCACAGGGTCAGCAGCCTCTGGACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct    1  ATGGCTGGTTCCCCAACATGCCTCACCCTCATCTATATCCTTTGGCAGCTCACA--------------------  54

Query   75  CGTGAAAGAGCTGGTCGGTTCCGTTGGTGGGGCCGTGACTTTCCCCCTGAAGTCCAAAGTAAAGCAAGTTGACT  148
                                                                                      
Sbjct   55  --------------------------------------------------------------------------  54

Query  149  CTATTGTCTGGACCTTCAACACAACCCCTCTTGTCACCATACAGCCAGAAGGGGGCACTATCATAGTGACCCAA  222
                                                                                      
Sbjct   55  --------------------------------------------------------------------------  54

Query  223  AATCGTAATAGGGAGAGAGTAGACTTCCCAGATGGAGGCTACTCCCTGAAGCTCAGCAAACTGAAGAAGAATGA  296
                                                                                      
Sbjct   55  --------------------------------------------------------------------------  54

Query  297  CTCAGGGATCTACTATGTGGGGATATACAGCTCATCACTCCAGCAGCCCTCCACCCAGGAGTACGTGCTGCATG  370
                                                                                      
Sbjct   55  --------------------------------------------------------------------------  54

Query  371  TCTACGAGCACCTGTCAAAGCCTAAAGTCACCATGGGTCTGCAGAGCAATAAGAATGGCACCTGTGTGACCAAT  444
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  -----GAGCACCTGTCAAAGCCTAAAGTCACCATGGGTCTGCAGAGCAATAAGAATGGCACCTGTGTGACCAAT  123

Query  445  CTGACATGCTGCATGGAACATGGGGAAGAGGATGTGATTTATACCTGGAAGGCCCTGGGGCAAGCAGCCAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  CTGACATGCTGCATGGAACATGGGGAAGAGGATGTGATTTATACCTGGAAGGCCCTGGGGCAAGCAGCCAATGA  197

Query  519  GTCCCATAATGGGTCCATCCTCCCCATCTCCTGGAGATGGGGAGAAAGTGATATGACCTTCATCTGCGTTGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  GTCCCATAATGGGTCCATCCTCCCCATCTCCTGGAGATGGGGAGAAAGTGATATGACCTTCATCTGCGTTGCCA  271

Query  593  GGAACCCTGTCAGCAGAAACTTCTCAAGCCCCATCCTTGCCAGGAAGCTCTGTGAAGGTGCTGCTGATGACCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  GGAACCCTGTCAGCAGAAACTTCTCAAGCCCCATCCTTGCCAGGAAGCTCTGTGAAGGTGCTGCTGATGACCCA  345

Query  667  GATTCCTCCATGGTCCTCCTGTGTCTCCTGTTGGTGCCCCTCCTGCTCAGTCTCTTTGTACTGGGGCTATTTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  GATTCCTCCATGGTCCTCCTGTGTCTCCTGTTGGTGCCCCTCCTGCTCAGTCTCTTTGTACTGGGGCTATTTCT  419

Query  741  TTGGTTTCTGAAGAGAGAGAGACAAGAAG---------------------------------------------  769
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  420  TTGGTTTCTGAAGAGAGAGAGACAAGAAGAGTACATTGAAGAGAAGAAGAGAGTGGACATTTGTCGGGAAACTC  493

Query  770  -----------------------------------------------------------AGAACAATCCTAAAG  784
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  494  CTAACATATGCCCCCATTCTGGAGAGAACACAGAGTACGACACAATCCCTCACACTAATAGAACAATCCTAAAG  567

Query  785  GAAGATCCAGCAAATACGGTTTACTCCACTGTGGAAATACCGAAAAAGATGGAAAATCCCCACTCACTGCTCAC  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568  GAAGATCCAGCAAATACGGTTTACTCCACTGTGGAAATACCGAAAAAGATGGAAAATCCCCACTCACTGCTCAC  641

Query  859  GATGCCAGACACACCAAGGCTATTTGCCTA-------------  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  642  GATGCCAGACACACCAAGGCTATTTGCCTATGAGAATGTTATC  684