Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12408
Subject:
XM_011509828.1
Aligned Length:
1044
Identities:
888
Gaps:
156

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTTCCCCAACATGCCTCACCCTCATCTATATCCTTTGGCAGCTCACAGGGTCAGCAGCCTCTGGACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGTTCCCCAACATGCCTCACCCTCATCTATATCCTTTGGCAGCTCACAGGGTCAGCAGCCTCTGGACC  74

Query   75  CGTGAAAGAGCTGGTCGGTTCCGTTGGTGGGGCCGTGACTTTCCCCCTGAAGTCCAAAGTAAAGCAAGTTGACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGAAAGAGCTGGTCGGTTCCGTTGGTGGGGCCGTGACTTTCCCCCTGAAGTCCAAAGTAAAGCAAGTTGACT  148

Query  149  CTATTGTCTGGACCTTCAACACAACCCCTCTTGTCACCATACAGCCAGAAGGGGGCACTATCATAGTGACCCAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTATTGTCTGGACCTTCAACACAACCCCTCTTGTCACCATACAGCCAGAAGGGGGCACTATCATAGTGACCCAA  222

Query  223  AATCGTAATAGGGAGAGAGTAGACTTCCCAGATGGAGGCTACTCCCTGAAGCTCAGCAAACTGAAGAAGAATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATCGTAATAGGGAGAGAGTAGACTTCCCAGATGGAGGCTACTCCCTGAAGCTCAGCAAACTGAAGAAGAATGA  296

Query  297  CTCAGGGATCTACTATGTGGGGATATACAGCTCATCACTCCAGCAGCCCTCCACCCAGGAGTACGTGCTGCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGGGATCTACTATGTGGGGATATACAGCTCATCACTCCAGCAGCCCTCCACCCAGGAGTACGTGCTGCATG  370

Query  371  TCTACGAGCACCTGTCAAAGCCTAAAGTCACCATGGGTCTGCAGAGCAATAAGAATGGCACCTGTGTGACCAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTACGAGCACCTGTCAAAGCCTAAAGTCACCATGGGTCTGCAGAGCAATAAGAATGGCACCTGTGTGACCAAT  444

Query  445  CTGACATGCTGCATGGAACATGGGGAAGAGGATGTGATTTATACCTGGAAGGCCCTGGGGCAAGCAGCCAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGACATGCTGCATGGAACATGGGGAAGAGGATGTGATTTATACCTGGAAGGCCCTGGGGCAAGCAGCCAATGA  518

Query  519  GTCCCATAATGGGTCCATCCTCCCCATCTCCTGGAGATGGGGAGAAAGTGATATGACCTTCATCTGCGTTGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCCCATAATGGGTCCATCCTCCCCATCTCCTGGAGATGGGGAGAAAGTGATATGACCTTCATCTGCGTTGCCA  592

Query  593  GGAACCCTGTCAGCAGAAACTTCTCAAGCCCCATCCTTGCCAGGAAGCTCTGTGA-------------------  647
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  593  GGAACCCTGTCAGCAGAAACTTCTCAAGCCCCATCCTTGCCAGGAAGCTCTGTGAAGGTGACTGCCTCTCCCCT  666

Query  648  --------------------AGGTGCTGCTGATGACCCAGATTCCTCCATGGTCCTCCTGTGTCTCCTGTTGGT  701
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCCACAGGAGACTCTGCCCAGGTGCTGCTGATGACCCAGATTCCTCCATGGTCCTCCTGTGTCTCCTGTTGGT  740

Query  702  GCCCCTCCTGCTCAGTCTCTTTGTACTGGGGCTATTTCTTTGGTTTCTGAAGAGAGAGAGACAAGAAG------  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  741  GCCCCTCCTGCTCAGTCTCTTTGTACTGGGGCTATTTCTTTGGTTTCTGAAGAGAGAGAGACAAGAAGAGTACA  814

Query  770  --------------------------------------------------------------------------  769
                                                                                      
Sbjct  815  TTGAAGAGAAGAAGAGAGTGGACATTTGTCGGGAAACTCCTAACATATGCCCCCATTCTGGAGAGAACACAGAG  888

Query  770  ------------------------AGAACAATCCTAAAGGAAGATCCAGCAAATACGGTTTACTCCACTGTGGA  819
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACGACACAATCCCTCACACTAATAGAACAATCCTAAAGGAAGATCCAGCAAATACGGTTTACTCCACTGTGGA  962

Query  820  AATACCGAAAAAGATGGAAAATCCCCACTCACTGCTCACGATGCCAGACACACCAAGGCTATTTGCCTA-----  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  963  AATACCGAAAAAGATGGAAAATCCCCACTCACTGCTCACGATGCCAGACACACCAAGGCTATTTGCCTATGAGA  1036

Query  889  --------  888
                    
Sbjct 1037  ATGTTATC  1044