Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12409
- Subject:
- NM_021196.3
- Aligned Length:
- 1137
- Identities:
- 1018
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 MKVKEEKAGVGKLDHTNHRRRFPDQK------------------------------------------------ 26
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Sbjct 1 MKVKEEKAGVGKLDHTNHRRRFPDQKECPPIHIGLPVPTYPQRKTDQKGHLSGLQKVHWGLRPDQPQQELTGPG 74
Query 27 ----------------GSPAAEQLQDILGEEDEAPNPTLFTEMDTLQHDGDQMEWKESARWIKFEEKVEEGGER 84
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Sbjct 75 SGASSQDSSMDLISRTRSPAAEQLQDILGEEDEAPNPTLFTEMDTLQHDGDQMEWKESARWIKFEEKVEEGGER 148
Query 85 WSKPHVSTLSLHSLFELRTCLQTGTVLLDLDSGSLPQIIDDVIEKQIEDGLLRPELRERVSYVLLRRHRHQTKK 158
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Sbjct 149 WSKPHVSTLSLHSLFELRTCLQTGTVLLDLDSGSLPQIIDDVIEKQIEDGLLRPELRERVSYVLLRRHRHQTKK 222
Query 159 PIHRSLADIGKSVSTTNRSPARSPGAGPSLHHSTEDLRMRQSANYGRLCHAQSRSMNDISLTPNTDQRKNKFMK 232
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Sbjct 223 PIHRSLADIGKSVSTTNRSPARSPGAGPSLHHSTEDLRMRQSANYGRLCHAQSRSMNDISLTPNTDQRKNKFMK 296
Query 233 KIPKDSEASNVLVGEVDFLDQPFIAFVRLIQSAMLGGVTEVPVPTRFLFILLGPSGRAKSYNEIGRAIATLMVD 306
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Sbjct 297 KIPKDSEASNVLVGEVDFLDQPFIAFVRLIQSAMLGGVTEVPVPTRFLFILLGPSGRAKSYNEIGRAIATLMVD 370
Query 307 DLFSDVAYKARNREDLIAGIDEFLDEVIVLPPGEWDPNIRIEPPKKVPSADKRKSVFSLAELGQMNGSVGGGGG 380
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Sbjct 371 DLFSDVAYKARNREDLIAGIDEFLDEVIVLPPGEWDPNIRIEPPKKVPSADKRKSVFSLAELGQMNGSVGGGGG 444
Query 381 APGGGNGGGGGGGSGGGAGSGGAGGTSSGDDGEMPAMHEIGEELIWTGRFFGGLCLDIKRKLPWFPSDFYDGFH 454
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Sbjct 445 APGGGNGGGGGGGSGGGAGSGGAGGTSSGDDGEMPAMHEIGEELIWTGRFFGGLCLDIKRKLPWFPSDFYDGFH 518
Query 455 IQSISAILFIYLGCITNAITFGGLLGDATDNYQGVMESFLGTAMAGSLFCLFSGQPLIILSSTGPILIFEKLLF 528
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Sbjct 519 IQSISAILFIYLGCITNAITFGGLLGDATDNYQGVMESFLGTAMAGSLFCLFSGQPLIILSSTGPILIFEKLLF 592
Query 529 DFSKGNGLDYMEFRLWIGLHSAVQCLILVATDASFIIKYITRFTEEGFSTLISFIFIYDAIKKMIGAFKYYPIN 602
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Sbjct 593 DFSKGNGLDYMEFRLWIGLHSAVQCLILVATDASFIIKYITRFTEEGFSTLISFIFIYDAIKKMIGAFKYYPIN 666
Query 603 MDFKPNFITTYKCECVAPDTVNTTVFNASAPLAPDTNASLYNLLNLTALDWSLLSKKECLSYGGRLLGNSCKFI 676
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Sbjct 667 MDFKPNFITTYKCECVAPDTVNTTVFNASAPLAPDTNASLYNLLNLTALDWSLLSKKECLSYGGRLLGNSCKFI 740
Query 677 PDLALMSFILFFGTYSMTLTLKKFKFSRYFPT--------------------------------------KPTR 712
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Sbjct 741 PDLALMSFILFFGTYSMTLTLKKFKFSRYFPTKVRALVADFSIVFSILMFCGIDACFGLETPKLHVPSVIKPTR 814
Query 713 PDRGWFVAPFGKNPWWVYPASILPALLVTILIFMDQQITAVIVNRKENKLKKAAGYHLDLFWVGILMALCSFMG 786
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Sbjct 815 PDRGWFVAPFGKNPWWVYPASILPALLVTILIFMDQQITAVIVNRKENKLKKAAGYHLDLFWVGILMALCSFMG 888
Query 787 LPWYVAATVISIAHIDSLKMETETSAPGEQPQFLGVREQRVTGIIVFILTGISVFLAPILKCIPLPVLYGVFLY 860
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Sbjct 889 LPWYVAATVISIAHIDSLKMETETSAPGEQPQFLGVREQRVTGIIVFILTGISVFLAPILKCIPLPVLYGVFLY 962
Query 861 MGVASLNGIQ----------------FWERCKLFLMPAKHQPDHAFLRHVPLRRIHLFTLVQILCLAVLWILKS 918
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Sbjct 963 MGVASLNGIQMGTGGSEFKIQKKLTPFWERCKLFLMPAKHQPDHAFLRHVPLRRIHLFTLVQILCLAVLWILKS 1036
Query 919 TVAAIIFPVMILGLIIVRRLLDFIFSQHDLAWIDNILPEKEKKETDKKRKRKKGAHEDCDEEPQFPPPSVIKIP 992
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Sbjct 1037 TVAAIIFPVMILGLIIVRRLLDFIFSQHDLAWIDNILPEKEKKETDKKRKRKKGAHEDCDEEPQFPPPSVIKIP 1110
Query 993 MESVQSDPQNGIHCIARKRSSSWSYSL 1019
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Sbjct 1111 MESVQSDPQNGIHCIARKRSSSWSYSL 1137