Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12422
• Subject: NR_135467.2
• Aligned Length: 1714
• Identities: 1313
• Gaps: 400

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GAGGAGGCTCTGGCAGCCTGGGCAGGGAGGCGGCGGGGGGCCGCGGAGCCGCTGGCCATCGATTCTCCCCGCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGTGACGCCGTCCTTAGCCCTGCGACCCCCAGCGCGTCCCGGGCCTGCGCCTCCGCCCCGCCGCGCAGCGCACG  148

Query    1  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCCCGGCCTCCGCCGGCAGGT  222

Query   75  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  296

Query  149  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  370

Query  223  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  444

Query  297  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  518

Query  371  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  592

Query  445  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  666

Query  519  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  740

Query  593  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  814

Query  667  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  888

Query  741  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  962

Query  815  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGAT---------------------------------------  849
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  963  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTGAATATGGTAATTTTTATGGCTTACTACCAGCATTT  1036

Query  850  -------------GGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGGAAAGATGGAATTCTTGTTAGCA  910
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTTTAAGTAAAGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGGAAAGATGGAATTCTTGTTAGCA  1110

Query  911  ACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCTGCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGC  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCTGCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGC  1184

Query  985  ATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCAAGGACTTCCGCGACTTGCAGCT  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCAAGGACTTCCGCGACTTGCAGCT  1258

Query 1059  GGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGACC  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGACC  1332

Query 1133  CCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATATCCTATATACAGTTCCATAGAA  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATATCCTATATACAGTTCCATAGAA  1406

Query 1207  GCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAATATGGATGAACAGTGGTTTGGA  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAATATGGATGAACAGTGGTTTGGA  1480

Query 1281  CACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC----------------------------------------  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct 1481  CACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTACTGAAAACCACATGCATCTTGATGCGATCGCACTTTCTGAA  1554

Query 1315  --------------------------------------------------------------------------  1314
                                                                                      
Sbjct 1555  GAAGGAAGGATCCCAAATGCCCCTCCAGTTCTGGTTCACCTGTACCTTCTATGAAGGAGAATTCGTCATGTCAT  1628

Query 1315  --------------------------------------------------------------------------  1314
                                                                                      
Sbjct 1629  TCAACACTCGTGAGGCCAGGAAGCTATTAAAGGGATGTTTCAAGCTGTTTCTAGCACATTCCAAAATAAATGAG  1702

Query 1315  ------------  1314
                        
Sbjct 1703  GAGGGAAGAGTC  1714