Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12422
- Subject:
- XM_024452126.1
- Aligned Length:
- 1314
- Identities:
- 1026
- Gaps:
- 288
Alignment
Query 1 ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC 296
|||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGTGTAGTTC 11
Query 297 CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 12 CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCC---AGGTGCTGGACG 82
Query 371 AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC 156
Query 445 AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA 230
Query 519 GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA 304
Query 593 GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA 378
Query 667 TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC 452
Query 741 AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA 526
Query 815 TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG 600
Query 889 AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT 674
Query 963 GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA 748
Query 1037 AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG 822
Query 1111 GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA 896
Query 1185 TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA 970
Query 1259 TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC 1026