Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12444
• Subject: XM_017007022.2
• Aligned Length: 2867
• Identities: 2775
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGCTGCCTGGGCGGCTGTGCTGGGTGCCGCTCCTGCTGGCGCTGGGCGTGGGGAGCGGCAGCGGCGGTGG-CG  73
                                             .|||||||                  ||     |.||| |.
Sbjct    1  ---------------------------------ATGCTGGC------------------CA-----GATGGCCA  18

Query   74  GGGACAGCCGGCAGCGCCGCCTCCTCGCGGCT-AAAGTCAATAAGCACAAGCCATGGATCGAGACTTCATATCA  146
            .|.|||                     .||.| |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   19  AGAACA---------------------AGGATGAGGGTCAATAAGCACAAGCCATGGATCGAGACTTCATATCA  71

Query  147  TGGAGTCATAACTGAGAACAATGACACAGTCATTTTGGACCCACCACTGGTAGCCCTGGATAAAGATGCACCGG  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  TGGAGTCATAACTGAGAACAATGACACAGTCATTTTGGACCCACCACTGGTAGCCCTGGATAAAGATGCACCGG  145

Query  221  TTCCTTTTGCAGGGGAAATCTGTGCGTTCAAGATCCATGGCCAGGAGCTGCCCTTTGAGGCTGTGGTGCTCAAC  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  TTCCTTTTGCAGGGGAAATCTGTGCGTTCAAGATCCATGGCCAGGAGCTGCCCTTTGAGGCTGTGGTGCTCAAC  219

Query  295  AAGACATCAGGAGAGGGCCGGCTCCGTGCCAAGAGCCCCATTGACTGTGAGTTGCAGAAGGAGTACACATTCAT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  AAGACATCAGGAGAGGGCCGGCTCCGTGCCAAGAGCCCCATTGACTGTGAGTTGCAGAAGGAGTACACATTCAT  293

Query  369  CATCCAGGCCTATGACTGTGGTGCTGGGCCCCACGAGACAGCCTGGAAAAAGTCACACAAGGCCGTGGTCCATA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CATCCAGGCCTATGACTGTGGTGCTGGGCCCCACGAGACAGCCTGGAAAAAGTCACACAAGGCCGTGGTCCATA  367

Query  443  TACAGGTGAAGGATGTCAACGAGTTTGCTCCCACCTTCAAAGAGCCAGCCTACAAGGCTGTTGTGACGGAGGGC  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TACAGGTGAAGGATGTCAACGAGTTTGCTCCCACCTTCAAAGAGCCAGCCTACAAGGCTGTTGTGACGGAGGGC  441

Query  517  AAGATCTATGACAGCATTCTGCAGGTGGAGGCCATTGACGAGGACTGCTCCCCACAGTACAGCCAGATCTGCAA  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  AAGATCTATGACAGCATTCTGCAGGTGGAGGCCATTGACGAGGACTGCTCCCCACAGTACAGCCAGATCTGCAA  515

Query  591  CTATGAAATCGTCACCACAGATGTGCCTTTTGCCATCGACAGAAATGGCAACATCAGGAACACTGAGAAGCTGA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CTATGAAATCGTCACCACAGATGTGCCTTTTGCCATCGACAGAAATGGCAACATCAGGAACACTGAGAAGCTGA  589

Query  665  GCTATGACAAACAACACCAGTATGAGATCCTGGTGACCGCCTACGACTGTGGACAGAAGCCCGCTGCTCAGGAC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  GCTATGACAAACAACACCAGTATGAGATCCTGGTGACCGCCTACGACTGTGGACAGAAGCCCGCTGCTCAGGAC  663

Query  739  ACCCTGGTGCAGGTGGATGTGAAGCCAGTTTGCAAGCCTGGCTGGCAAGACTGGACCAAGAGGATTGAGTACCA  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  ACCCTGGTGCAGGTGGATGTGAAGCCAGTTTGCAAGCCTGGCTGGCAAGACTGGACCAAGAGGATTGAGTACCA  737

Query  813  GCCTGGCTCCGGGAGCATGCCCCTGTTCCCCAGCATCCACCTGGAGACGTGCGATGGAGCCGTGTCTTCCCTCC  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GCCTGGCTCCGGGAGCATGCCCCTGTTCCCCAGCATCCACCTGGAGACGTGCGATGGAGCCGTGTCTTCCCTCC  811

Query  887  AGATCGTCACAGAGCTGCAGACTAATTACATTGGGAAGGGTTGTGACCGGGAGACCTACTCTGAGAAATCCCTT  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AGATCGTCACAGAGCTGCAGACTAATTACATTGGGAAGGGTTGTGACCGGGAGACCTACTCTGAGAAATCCCTT  885

Query  961  CAAAAGTTATGTGGAGCCTCCTCTGGCATCATTGACCTCTTGCCATCCCCTAGCGCTGCCACCAACTGGACTGC  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CAAAAGTTATGTGGAGCCTCCTCTGGCATCATTGACCTCTTGCCATCCCCTAGCGCTGCCACCAACTGGACTGC  959

Query 1035  AGGACTGCTGGTGGACAGCAGTGAGATGATCTTCAAGTTTGACGGCAGGCAGGGTGCCAAAGTCCCCGATGGGA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  AGGACTGCTGGTGGACAGCAGTGAGATGATCTTCAAGTTTGACGGCAGGCAGGGTGCCAAAGTCCCCGATGGGA  1033

Query 1109  TTGTGCCCAAGAACCTGACCGATCAGTTCACCATCACCATGTGGATGAAACACGGCCCCAGCCCTGGTGTGAGA  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  TTGTGCCCAAGAACCTGACCGATCAGTTCACCATCACCATGTGGATGAAACACGGCCCCAGCCCTGGTGTGAGA  1107

Query 1183  GCCGAGAAGGAAACCATCCTCTGCAACTCAGACAAAACCGAAATGAACCGGCATCACTATGCCCTGTATGTGCA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GCCGAGAAGGAAACCATCCTCTGCAACTCAGACAAAACCGAAATGAACCGGCATCACTATGCCCTGTATGTGCA  1181

Query 1257  CAACTGCCGCCTCGTCTTTCTCTTGCGGAAGGACTTCGACCAGGCTGACACCTTTCGCCCCGCGGAGTTCCACT  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CAACTGCCGCCTCGTCTTTCTCTTGCGGAAGGACTTCGACCAGGCTGACACCTTTCGCCCCGCGGAGTTCCACT  1255

Query 1331  GGAAGCTGGATCAGATTTGTGACAAAGAGTGGCACTACTATGTCATCAATGTGGAGTTTCCTGTGGTAACCTTA  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  GGAAGCTGGATCAGATTTGTGACAAAGAGTGGCACTACTATGTCATCAATGTGGAGTTTCCTGTGGTAACCTTA  1329

Query 1405  TACATGGATGGAGCAACATATGAACCATACCTGGTGACCAACGACTGGCCCATTCATCCATCTCACATAGCCAT  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  TACATGGATGGAGCAACATATGAACCATACCTGGTGACCAACGACTGGCCCATTCATCCATCTCACATAGCCAT  1403

Query 1479  GCAACTCACAGTCGGCGCTTGTTGGCAAGGAGGAGAAGTCACCAAACCACAGTTTGCTCAGTTCTTTCATGGAA  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GCAACTCACAGTCGGCGCTTGTTGGCAAGGAGGAGAAGTCACCAAACCACAGTTTGCTCAGTTCTTTCATGGAA  1477

Query 1553  GCCTGGCCAGTCTCACCATCCGCCCTGGCAAAATGGAAAGCCAGAAGGTGATCTCCTGCCTGCAGGCCTGCAAG  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  GCCTGGCCAGTCTCACCATCCGCCCTGGCAAAATGGAAAGCCAGAAGGTGATCTCCTGCCTGCAGGCCTGCAAG  1551

Query 1627  GAAGGGCTGGACATTAATTCCTTGGAAAGCCTTGGCCAAGGAATAAAGTATCACTTCAACCCCTCGCAGTCCAT  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GAAGGGCTGGACATTAATTCCTTGGAAAGCCTTGGCCAAGGAATAAAGTATCACTTCAACCCCTCGCAGTCCAT  1625

Query 1701  CCTGGTGATGGAAGGTGACGACATTGGGAACATTAACCGTGCTCTCCAGAAAGTCTCCTACATCAACTCCAGGC  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CCTGGTGATGGAAGGTGACGACATTGGGAACATTAACCGTGCTCTCCAGAAAGTCTCCTACATCAACTCCAGGC  1699

Query 1775  AGTTCCCAACGGCGGGTGTGCGGCGCCTCAAAGTATCCTCCAAAGTCCAGTGCTTTGGGGAAGACGTATGCATC  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  AGTTCCCAACGGCGGGTGTGCGGCGCCTCAAAGTATCCTCCAAAGTCCAGTGCTTTGGGGAAGACGTATGCATC  1773

Query 1849  AGTATCCCTGAGGTAGATGCCTATGTGATGGTCCTCCAGGCCATCGAGCCCCGGATCACCCTCCGGGGCACAGA  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  AGTATCCCTGAGGTAGATGCCTATGTGATGGTCCTCCAGGCCATCGAGCCCCGGATCACCCTCCGGGGCACAGA  1847

Query 1923  CCACTTCTGGAGACCTGCTGCCCAGTTTGAAAGTGCCAGGGGAGTGACCCTCTTCCCTGATATCAAGATTGTGA  1996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  CCACTTCTGGAGACCTGCTGCCCAGTTTGAAAGTGCCAGGGGAGTGACCCTCTTCCCTGATATCAAGATTGTGA  1921

Query 1997  GCACCTTCGCCAAAACCGAAGCCCCCGGGGACGTGAAAACCACAGACCCCAAATCAGAAGTCTTAGAGGAAATG  2070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  GCACCTTCGCCAAAACCGAAGCCCCCGGGGACGTGAAAACCACAGACCCCAAATCAGAAGTCTTAGAGGAAATG  1995

Query 2071  CTTCATAACTTAGATTTCTGTGACATTTTGGTGATCGGAGGGGACTTGGACCCAAGGCAGGAGTGCTTGGAGCT  2144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CTTCATAACTTAGATTTCTGTGACATTTTGGTGATCGGAGGGGACTTGGACCCAAGGCAGGAGTGCTTGGAGCT  2069

Query 2145  CAACCACAGTGAGCTCCACCAACGACACCTGGATGCCACTAATTCTACTGCAGGCTACTCCATCTACGGTGTGG  2218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CAACCACAGTGAGCTCCACCAACGACACCTGGATGCCACTAATTCTACTGCAGGCTACTCCATCTACGGTGTGG  2143

Query 2219  GCTCCATGAGCCGCTATGAGCAGGTGCTACATCACATCCGCTACCGCAACTGGCGTCCGGCTTCTCTTGAGGCC  2292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2144  GCTCCATGAGCCGCTATGAGCAGGTGCTACATCACATCCGCTACCGCAACTGGCGTCCGGCTTCCCTTGAGGCC  2217

Query 2293  CGGCGTTTCCGGATTAAGTGCTCAGAACTCAATGGGCGCTACACTAGCAATGAGTTCAACTTGGAGGTCAGCAT  2366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  CGGCGTTTCCGGATTAAGTGCTCAGAACTCAATGGGCGCTACACTAGCAATGAGTTCAACTTGGAGGTCAGCAT  2291

Query 2367  CCTTCATGAAGACCAAGTCTCAGATAAGGAGCATGTCAATCATCTGATTGTGCAGCCTCCCTTCCTCCAGTCTG  2440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  CCTTCATGAAGACCAAGTCTCAGATAAGGAGCATGTCAATCATCTGATTGTGCAGCCTCCCTTCCTCCAGTCTG  2365

Query 2441  TCCATCATCCTGAGTCCCGGAGTAGCATCCAGCACAGTTCAGTGGTCCCAAGCATTGCCACAGTGGTCATCATC  2514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  TCCATCATCCTGAGTCCCGGAGTAGCATCCAGCACAGTTCAGTGGTCCCAAGCATTGCCACAGTGGTCATCATC  2439

Query 2515  ATCTCCGTGTGCATGCTTGTGTTTGATGTGGCCATGGGTGTGTACCGGGTCCGGATCGCCCACCAGCACTTCAT  2588
            |||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  ATCTCCGTGTGCATGCTTGTGTTTGTCGTGGCCATGGGTGTGTACCGGGTCCGGATCGCCCACCAGCACTTCAT  2513

Query 2589  CCAGGAGACTGAGGCTGCCAAGGAATCTGAGATGGACTGGGACGATTCTGCGCTGACTATCACAGTCAACCCCA  2662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  CCAGGAGACTGAGGCTGCCAAGGAATCTGAGATGGACTGGGACGATTCTGCGCTGACTATCACAGTCAACCCCA  2587

Query 2663  TGGAGAAACATGAAGGACCAGGGCATGGGGAAGATGAGACTGAGGGAGAAGAGGAGGAAGAAGCCGAGGAAGAA  2736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588  TGGAGAAACATGAAGGACCAGGGCATGGGGAAGATGAGACTGAGGGAGAAGAGGAGGAAGAAGCCGAGGAAGAA  2661

Query 2737  ATGAGCTCCAGCAGTGGCTCTGACGACAGCGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGGATGGGCAGAGGCAGACATGG  2810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  ATGAGCTCCAGCAGTGGCTCTGACGACAGCGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGGATGGGCAGAGGCAGACATGG  2735

Query 2811  GCAGAATGGAGCCAGGCAAGCCCAGCCGGAGTGGGATGACTCCACCCTCCCCTAC  2865
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  GCAGAATGGAGCCAGGCAAGCCCAGCTGGAGTGGGATGACTCCACCCTCCCCTAC  2790