Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12488
• Subject: XM_005260806.4
• Aligned Length: 1109
• Identities: 903
• Gaps: 196

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74

Query   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148

Query  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCA--------------------  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGGGGGAGCTGAGCTTTGAA  222

Query  203  --------------------------------------------------------------------------  202
                                                                                      
Sbjct  223  CAGGACCAGCTGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGTGAGGTCCGCCAGTT  296

Query  203  -----------------------------------------------------------AGTACCTTGAGGATG  217
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTACTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATG  370

Query  218  TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA  444

Query  292  TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC  518

Query  366  AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG  592

Query  440  AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG  666

Query  514  GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT  740

Query  588  CCACTGGGACCAGCATGTACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAG  661
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |
Sbjct  741  CCACTGGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCAT---------------------G  793

Query  662  TGGAGGACTTCT--------------------CGATGCCACCCCACTTAGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTG  715
            |||..|||..||                    ||..||.|.|||.||  |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TGGCTGACGCCTGGGGCGTGGAGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCT--GGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTG  865

Query  716  TGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCATGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGG  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  TGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCATGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGG  939

Query  790  GGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGAGAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAG  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  GGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGAGAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAG  1013

Query  864  ACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGGCCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  936
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  ACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGGCCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  1086