Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12492
- Subject:
- NM_001201545.1
- Aligned Length:
- 2907
- Identities:
- 2905
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAGGACTGCGGGGCGGGACCCTGTGCCGCGGCGGAGTCCAAGATGGCGGCGTGCGGTTCCGCTGTGTGAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGACTGCGGGGCGGGACCCTGTGCCGCGGCGGAGTCCAAGATGGCGGCGTGCGGTTCCGCTGTGTGAAAC 74
Query 75 GAGCGCGGGGCGGCGGGTTACTCAGCTCCGCGGAGACGACCTCCGACGACCCGCAACAATGAAGGGAAAAGAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGCGCGGGGCGGCGGGTTACTCAGCTCCGCGGAGACGACCTCCGACGACCCGCAACAATGAAGGGAAAAGAGC 148
Query 149 GCTCGCCAGTGAAGGCCAAACGCTCCCGTGGTGGTGAGGACTCGACTTCCCGCGGTGAGCGGAGCAAGAAGTTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTCGCCAGTGAAGGCCAAACGCTCCCGTGGTGGTGAGGACTCGACTTCCCGCGGTGAGCGGAGCAAGAAGTTA 222
Query 223 GGGGGCTCTGGTGGCAGCAATGGGAGCAGCAGCGGAAAGACCGATAGCGGCGGTGGGTCGCGGCGGAGTCTCCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGGGCTCTGGTGGCAGCAATGGGAGCAGCAGCGGAAAGACCGATAGCGGCGGTGGGTCGCGGCGGAGTCTCCA 296
Query 297 CCTGGACAAGTCCAGCAGTCGAGGTGGCAGCCGCGAGTATGATACCGGTGGGGGCAGCTCCAGTAGCCGCTTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGGACAAGTCCAGCAGTCGAGGTGGCAGCCGCGAGTATGATACCGGTGGGGGCAGCTCCAGTAGCCGCTTGC 370
Query 371 ATAGTTATAGCTCCCCGAGCACCAAAAATTCTTCGGGCGGGGGCGAGTCGCGCAGCAGCTCCCGGGGTGGAGGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATAGTTATAGCTCCCCGAGCACCAAAAATTCTTCGGGCGGGGGCGAGTCGCGCAGCAGCTCCCGGGGTGGAGGC 444
Query 445 GGGGAGTCACGTTCCTCTGGGGCCGCCTCCTCAGCTCCCGGCGGCGGGGACGGCGCGGAATACAAGACTCTGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGGAGTCACGTTCCTCTGGGGCCGCCTCCTCAGCTCCCGGCGGCGGGGACGGCGCGGAATACAAGACTCTGAA 518
Query 519 GATAAGCGAGTTGGGGTCCCAGCTTAGTGACGAAGCGGTGGAGGACGGCCTGTTTCATGAGTTCAAACGCTTCG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATAAGCGAGTTGGGGTCCCAGCTTAGTGACGAAGCGGTGGAGGACGGCCTGTTTCATGAGTTCAAACGCTTCG 592
Query 593 GTGATGTAAGTGTGAAAATCAGTCATCTGTCGGGTTCTGGCAGCGGGGATGAGCGGGTAGCCTTTGTGAACTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGATGTAAGTGTGAAAATCAGTCATCTGTCGGGTTCTGGCAGCGGGGATGAGCGGGTAGCCTTTGTGAACTTC 666
Query 667 CGGCGGCCAGAGAACGCGCGGGCGGCCAAGCATGCCAGAGGCCGCCTGGTGCTCTATGACCGGCCTCTGAAGAT 740
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGGCGGCCAGAGGACGCGCGGGCGGCCAAGCATGCCAGAGGCCGCCTGGTGCTCTATGACCGGCCTCTGAAGAT 740
Query 741 AGAAGCTGTGTATGTGAGCCGGCGCCGCAGCCGCTCCCCTTTAGACAAAGATACTTATCCTCCATCAGCCAGTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAAGCTGTGTATGTGAGCCGGCGCCGCAGCCGCTCCCCTTTAGACAAAGATACTTATCCTCCATCAGCCAGTG 814
Query 815 TGGTCGGGGCCTCTGTAGGTGGTCACCGGCACCCCCCTGGAGGTGGTGGAGGCCAGAGATCACTTTCCCCTGGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTCGGGGCCTCTGTAGGTGGTCACCGGCACCCCCCTGGAGGTGGTGGAGGCCAGAGATCACTTTCCCCTGGT 888
Query 889 GGCGCTGCTTTGGGATACAGAGACTACCGGCTGCAGCAGTTGGCTCTTGGCCGCCTGCCCCCTCCACCTCCGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCGCTGCTTTGGGATACAGAGACTACCGGCTGCAGCAGTTGGCTCTTGGCCGCCTGCCCCCTCCACCTCCGCC 962
Query 963 ACCATTGCCTCGAGACCTGGAGAGAGAAAGAGACTACCCGTTCTATGAGAGAGTGCGCCCTGCATACAGTCTTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCATTGCCTCGAGACCTGGAGAGAGAAAGAGACTACCCGTTCTATGAGAGAGTGCGCCCTGCATACAGTCTTG 1036
Query 1037 AGCCAAGGGTGGGAGCTGGAGCAGGTGCTGCTCCTTTCAGAGAAGTGGATGAGATTTCACCCGAGGATGATCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCCAAGGGTGGGAGCTGGAGCAGGTGCTGCTCCTTTCAGAGAAGTGGATGAGATTTCACCCGAGGATGATCAG 1110
Query 1111 CGAGCTAACCGGACGCTCTTCTTGGGCAACCTAGACATCACTGTAACGGAGAGTGATTTAAGAAGGGCGTTTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGAGCTAACCGGACGCTCTTCTTGGGCAACCTAGACATCACTGTAACGGAGAGTGATTTAAGAAGGGCGTTTGA 1184
Query 1185 TCGCTTTGGAGTCATCACAGAAGTAGATATCAAGAGGCCTTCTCGCGGCCAGACTAGTACTTACGGCTTTCTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCGCTTTGGAGTCATCACAGAAGTAGATATCAAGAGGCCTTCTCGCGGCCAGACTAGTACTTACGGCTTTCTCA 1258
Query 1259 AATTTGAGAACTTAGATATGTCTCACCGGGCCAAATTAGCAATGTCTGGCAAAATTATAATTCGGAATCCTATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AATTTGAGAACTTAGATATGTCTCACCGGGCCAAATTAGCAATGTCTGGCAAAATTATAATTCGGAATCCTATC 1332
Query 1333 AAAATTGGTTATGGTAAAGCTACACCCACCACCCGCCTCTGGGTGGGAGGCCTGGGACCTTGGGTTCCTCTTGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAAATTGGTTATGGTAAAGCTACACCCACCACCCGCCTCTGGGTGGGAGGCCTGGGACCTTGGGTTCCTCTTGC 1406
Query 1407 TGCCCTGGCACGAGAATTTGATCGATTTGGCACCATACGCACCATAGACTACCGAAAAGGTGATAGTTGGGCAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCCCTGGCACGAGAATTTGATCGATTTGGCACCATACGCACCATAGACTACCGAAAAGGTGATAGTTGGGCAT 1480
Query 1481 ATATCCAGTATGAAAGCCTGGATGCAGCGCATGCTGCCTGGACCCATATGCGGGGCTTCCCTCTTGGTGGCCCA 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 ATATCCAGTATGAAAGCCTGGATGCAGCGCATGCTGCCTGGACCCATATGCGGGGCTTCCCACTTGGTGGCCCA 1554
Query 1555 GATCGACGCCTTAGAGTAGACTTTGCCGACACCGAACATCGTTACCAGCAGCAGTATCTGCAGCCTCTGCCCTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GATCGACGCCTTAGAGTAGACTTTGCCGACACCGAACATCGTTACCAGCAGCAGTATCTGCAGCCTCTGCCCTT 1628
Query 1629 GACTCATTATGAGCTGGTGACAGATGCTTTTGGACATCGGGCACCAGACCCTTTGAGGGGTGCTCGGGATAGGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACTCATTATGAGCTGGTGACAGATGCTTTTGGACATCGGGCACCAGACCCTTTGAGGGGTGCTCGGGATAGGA 1702
Query 1703 CACCACCCTTACTATACAGAGATCGTGATAGGGACCTTTATCCTGACTCTGATTGGGTGCCACCCCCACCCCCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACCACCCTTACTATACAGAGATCGTGATAGGGACCTTTATCCTGACTCTGATTGGGTGCCACCCCCACCCCCA 1776
Query 1777 GTCCGAGAACGCAGCACTCGGACTGCAGCTACTTCTGTGCCTGCTTACGAGCCACTGGATAGCCTAGATCGCAG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTCCGAGAACGCAGCACTCGGACTGCAGCTACTTCTGTGCCTGCTTACGAGCCACTGGATAGCCTAGATCGCAG 1850
Query 1851 GCGGGATGGTTGGTCCTTGGACCGGGACAGAGGTGATCGAGATCTGCCCAGCAGCAGAGACCAGCCTAGGAAGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCGGGATGGTTGGTCCTTGGACCGGGACAGAGGTGATCGAGATCTGCCCAGCAGCAGAGACCAGCCTAGGAAGC 1924
Query 1925 GAAGGCTGCCTGAGGAGAGTGGAGGACGTCATCTGGATAGGTCTCCTGAGAGTGACCGCCCACGAAAACGTCAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GAAGGCTGCCTGAGGAGAGTGGAGGACGTCATCTGGATAGGTCTCCTGAGAGTGACCGCCCACGAAAACGTCAC 1998
Query 1999 TGCGCTCCTTCTCCTGACCGCAGTCCAGAATTGAGCAGTAGCCGGGATCGTTACAACAGCGACAATGATCGATC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCGCTCCTTCTCCTGACCGCAGTCCAGAATTGAGCAGTAGCCGGGATCGTTACAACAGCGACAATGATCGATC 2072
Query 2073 TTCCCGTCTTCTCTTGGAAAGGCCCTCTCCAATCAGAGACAGACGAGGTAGTTTGGAGAAGAGCCAGGGTGACA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTCCCGTCTTCTCTTGGAAAGGCCCTCTCCAATCAGAGACAGACGAGGTAGTTTGGAGAAGAGCCAGGGTGACA 2146
Query 2147 AGCGAGACCGTAAAAACTCTGCATCAGCTGAACGAGATAGGAAGCACCGGACAACTGCTCCCACTGAGGGAAAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGCGAGACCGTAAAAACTCTGCATCAGCTGAACGAGATAGGAAGCACCGGACAACTGCTCCCACTGAGGGAAAA 2220
Query 2221 AGCCCTCTGAAAAAAGAAGACCGCTCTGATGGGAGTGCACCTAGCACCAGCACTGCTTCCTCCAAGCTGAAGTC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGCCCTCTGAAAAAAGAAGACCGCTCTGATGGGAGTGCACCTAGCACCAGCACTGCTTCCTCCAAGCTGAAGTC 2294
Query 2295 CCCGTCCCAGAAACAGGATGGGGGGACAGCCCCTGTGGCATCAGCCTCTCCCAAACTCTGTTTGGCCTGGCAGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCCGTCCCAGAAACAGGATGGGGGGACAGCCCCTGTGGCATCAGCCTCTCCCAAACTCTGTTTGGCCTGGCAGG 2368
Query 2369 GCATGCTTCTACTGAAGAACAGCAACTTTCCTTCCAACATGCATCTGTTGCAGGGTGACCTCCAAGTGGCTAGT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCATGCTTCTACTGAAGAACAGCAACTTTCCTTCCAACATGCATCTGTTGCAGGGTGACCTCCAAGTGGCTAGT 2442
Query 2443 AGTCTTCTTGTGGAGGGTTCAACTGGAGGCAAAGTGGCCCAGCTCAAGATCACTCAGCGTCTCCGTTTGGACCA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGTCTTCTTGTGGAGGGTTCAACTGGAGGCAAAGTGGCCCAGCTCAAGATCACTCAGCGTCTCCGTTTGGACCA 2516
Query 2517 GCCCAAGTTGGATGAAGTAACTCGACGCATCAAAGTAGCAGGGCCCAATGGTTATGCCATTCTTTTGGCTGTGC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCCCAAGTTGGATGAAGTAACTCGACGCATCAAAGTAGCAGGGCCCAATGGTTATGCCATTCTTTTGGCTGTGC 2590
Query 2591 CTGGAAGTTCTGACAGCCGGTCCTCCTCTTCCTCAGCTGCATCAGACACTGCCACTTCTACTCAGAGGCCACTT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTGGAAGTTCTGACAGCCGGTCCTCCTCTTCCTCAGCTGCATCAGACACTGCCACTTCTACTCAGAGGCCACTT 2664
Query 2665 AGGAACCTTGTGTCCTATTTAAAGCAAAAGCAGGCAGCCGGGGTGATCAGCCTCCCTGTGGGGGGCAACAAAGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGGAACCTTGTGTCCTATTTAAAGCAAAAGCAGGCAGCCGGGGTGATCAGCCTCCCTGTGGGGGGCAACAAAGA 2738
Query 2739 CAAGGAAAACACCGGGGTCCTTCATGCCTTCCCACCTTGTGAGTTCTCCCAGCAGTTCCTGGATTCCCCTGCCA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CAAGGAAAACACCGGGGTCCTTCATGCCTTCCCACCTTGTGAGTTCTCCCAGCAGTTCCTGGATTCCCCTGCCA 2812
Query 2813 AGGCACTGGCCAAATCTGAAGAAGATTACCTGGTCATGATCATTGTCCGTGCAAAACTGGTTGAACAGCGGATG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGGCACTGGCCAAATCTGAAGAAGATTACCTGGTCATGATCATTGTCCGTGCAAAACTGGTTGAACAGCGGATG 2886
Query 2887 AAGATATGGAATTCAAAGCTC 2907
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AAGATATGGAATTCAAAGCTC 2907