Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12497
- Subject:
- NM_022820.5
- Aligned Length:
- 1517
- Identities:
- 1140
- Gaps:
- 343
Alignment
Query 1 ATGGATCTCATTCCAAACTTTGCCATGGAAACATGGGTTCTTGTGGCTACCAGCCTGGTACTCCTCTATATTTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCTCATTCCAAACTTTGCCATGGAAACATGGGTTCTTGTGGCTACCAGCCTGGTACTCCTCTATATTTA 74
Query 75 TGGGACCCATTCACATAAACTTTTTAAGAAGCTGGGAATTCCTGGGCCAACCCCTCTGCCTTTTCTGGGAACTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGGACCCATTCACATAAACTTTTTAAGAAGCTGGGAATTCCTGGGCCAACCCCTCTGCCTTTTCTGGGAACTA 148
Query 149 TTTTGTTCTACCTTAGGAGGTCTCTG--------------------------AATA---AGA------------ 181
||||||||||||||||| |||||.|| |||| |||
Sbjct 149 TTTTGTTCTACCTTAGG-GGTCTTTGGAATTTTGACAGAGAATGTAATGAAAAATACGGAGAAATGTGGGGGCT 221
Query 182 --------------TTCCCA-GCTGGGCGTGGTGGCTCACG--------------------------------- 207
..|||| |||||.|.|..|||.||.||
Sbjct 222 GTATGAGGGGCAACAGCCCATGCTGGTCATCATGGATCCCGACATGATCAAAACAGTGTTAGTGAAAGAATGTT 295
Query 208 --CCTGTAATCCCA--------GCACTT---------TGGGA-----------------------GGCTGAAGC 239
.||||..||.|| || ||| ||||| .|||||||
Sbjct 296 ACTCTGTCTTCACAAACCAGATGC-CTTTAGGTCCAATGGGATTTCTGAAAAGTGCCTTAAGTTTTGCTGAAG- 367
Query 240 AGGAGGA-----------------------------------TCACC----TAA-------------GGT---- 257
|.||.|| ||||| ||| |||
Sbjct 368 ATGAAGAATGGAAGAGAATACGAACATTGCTATCTCCAGCTTTCACCAGTGTAAAATTCAAGGAAATGGTCCCC 441
Query 258 ------------------------------------------CAGGAGTTCGAGACCAG--------------- 274
|||||....||||.|||
Sbjct 442 ATCATTTCCCAATGTGGAGATATGTTGGTGAGAAGCCTGAGGCAGGAAGCAGAGAACAGCAAGTCCATCAACTT 515
Query 275 ---------CTTTG------CCAACATGG-----------------GTCTTTGGA----------ATTTTGACA 306
||||| .||.||||| .|.|||||| |||.|..||
Sbjct 516 GAAAGATTTCTTTGGGGCCTACACCATGGATGTAATCACTGGCACATTATTTGGAGTGAACTTGGATTCTCTCA 589
Query 307 GAGAAT------------GTAATGAAAAATACGGAG---------AAATGTGG-------GG------------ 340
|.||| .|..|||||||||.|.|| |||| ||| ||
Sbjct 590 -ACAATCCACAAGATCCCTTTCTGAAAAATATGAAGAAGCTTTTAAAAT-TGGATTTTTTGGATCCCTTTTTAC 661
Query 341 ---------CACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTT 405
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCTTAATATCACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTT 735
Query 406 ACCCATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 ACCCATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGA 809
Query 480 TTTCTTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 TTTCTTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC 883
Query 554 TTGTGGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTAT 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TTGTGGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTAT 957
Query 628 GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACC 1031
Query 702 TGTCACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAG 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 TGTCACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAG 1105
Query 776 TTGTTAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 TTGTTAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCA 1179
Query 850 GTGATGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAA-- 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 GTGATGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAG 1253
Query 922 -AGGTTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACT 994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TAGGTTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACT 1327
Query 995 GCATTGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAA 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 GCATTGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAA 1401
Query 1069 CCTTGTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCT 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 CCTTGTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCT 1475
Query 1143 AAAAGTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC 1179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 AAAAGTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC 1512