Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12497
- Subject:
- XM_017012544.1
- Aligned Length:
- 1217
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 175
Alignment
Query 1 ATGGATCTCATTCCAAACTTTGCCA---TGGAAACATGGGTTCTT-GTGGCTACCAGCCTG------------- 57
||||..|.||| || |||.||| ||||.|.||| || ||| |..||||||
Sbjct 1 ATGGTCCCCAT--CA---TTTCCCAATGTGGAGATATG-----TTGGTG---AGAAGCCTGAGGCAGGAAGCAG 61
Query 58 -GTACTCCTCTATATTTATGGGACCCATTCACATAAACTTTTTAAGAAGCTGGGAATTCCT--GGGCCAACCCC 128
|.|| |.|.|.|| |||.||||| ||| .||.|||.| |||||.||.||
Sbjct 62 AGAAC-----------------AGCAAGTC-CATCAACTT-----GAA----AGATTTCTTTGGGGCCTACACC 108
Query 129 TCTGCCT----TTTCTGGGA-ACTATTT----TGTTCTACCTTAGGAGGTCTCTGAATAAGATTCCCAGCTGGG 193
.||..| |..||||.| |.||||| || |.||| ||| .|||||.||.|| ||
Sbjct 109 -ATGGATGTAATCACTGGCACATTATTTGGAGTG----AACTT-GGA-TTCTCTCAACAA---TC--------- 163
Query 194 CGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATCACCTAAGGTCAGGAGTTCG 267
|.||.| |||| |||| ||||| .||..|.|.||
Sbjct 164 --------CACAAG------ATCC-----CTTT------CTGAA--------------AAATATGAAGA----- 193
Query 268 AGACCAGCTTTGCCAACATGGG--TCTTTGGA---ATTTTGACAGAGAAT-GTAATGAAAAATACGGAGAAATG 335
|||||| .||.||.|| |.|||||| .||||.|| | .|||| ||
Sbjct 194 -----AGCTTT--TAAAATTGGATTTTTTGGATCCCTTTTTAC------TCTTAAT-----AT----------- 238
Query 336 TGGGGCACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCC 409
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 -----CACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCC 307
Query 410 ATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTC 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 ATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTC 381
Query 484 TTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGT 557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 TTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGT 455
Query 558 GGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAAC 631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 GGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAAC 529
Query 632 TGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTC 705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 TGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTC 603
Query 706 ACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 ACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGT 677
Query 780 TAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGA 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 TAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGA 751
Query 854 TGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAA---AGG 924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 752 TGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAGTAGG 825
Query 925 TTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCAT 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 TTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCAT 899
Query 999 TGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTT 973
Query 1073 GTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAA 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 GTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAA 1047
Query 1147 GTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC 1179
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 GTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC 1080