Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12501
• Subject: NM_001351693.2
• Aligned Length: 1345
• Identities: 767
• Gaps: 557

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTGSARPSRLERVAREIVETERAYVRDLRSIVEDYLGPLL  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  DGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLENSSSAGGIAECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELS  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  LSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYIN  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  DMKRKQEHAARLQEVQRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  YKGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPASIPAKAKQVLLEN  370

Query    1  -------------------------------------------------------------MFPQNAKPGFKHA  13
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  371  SLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSVIRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKPGFKHA  444

Query   14  GSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGD  87
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGD  518

Query   88  SETLTFQALPSRDSSEEEEEEEEGLEMDERGPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSHCEIP  161
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  SETLTFQALPSRDSSEEEEEEEEGLEMDERGPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRCEIP  592

Query  162  EGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFSGSNPGKLGEPP  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  EGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFSGSNPGKLGEPP  666

Query  236  SGGKAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDELAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGD  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  SGGKAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDELAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGD  740

Query  310  SGSGKAGAPSSERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFG  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  SGSGKAGAPSSERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFG  814

Query  384  HVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGGSRHV  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  HVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGGSRHV  888

Query  458  QAPAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHKSHMVIPAPSTAFCPEQGHCADIHVPTTPA  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  QAPAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCADIHVPTTPA  962

Query  532  LPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLP  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  LPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLP  1036

Query  606  PLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTPLPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSL  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  PLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTPLPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSL  1110

Query  680  PDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLIDAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLSKPGGS  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  PDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLIDAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLSKPGGS  1184

Query  754  LASHVAR------------LESSDLTPPHSPPPSSRQLLGP------NAAALSRYLAASYISQSLARRQGPGGG  809
            |||||||            ...|...|.|.  .|..|...|      |....||.                   
Sbjct 1185  LASHVARNLWAFTGPRGLLMPPSTCEPGHE--ASLKQGFQPDAIDPQNLTWKSRH-------------------  1237

Query  810  APAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPAARRLSYATTVNIHVGGGGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGL  883
                                                                                      
Sbjct 1238  --------------------------------------------------------------------------  1237

Query  884  HRAQGAPDAPFHM  896
                         
Sbjct 1238  -------------  1237