Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12542
- Subject:
- XM_011528283.2
- Aligned Length:
- 1493
- Identities:
- 1411
- Gaps:
- 70
Alignment
Query 1 ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA 74
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Sbjct 1 ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA 74
Query 75 GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG 148
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Sbjct 75 GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG 148
Query 149 CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT 222
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Sbjct 149 CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT 222
Query 223 CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT 296
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Sbjct 223 CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT 296
Query 297 CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA 370
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Sbjct 297 CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA 370
Query 371 GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA 444
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Sbjct 371 GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA 444
Query 445 AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA 518
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Sbjct 445 AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA 518
Query 519 TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTGAAATCCCAGC 592
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Sbjct 519 TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTAAAATCCCAGC 592
Query 593 ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC 666
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Sbjct 593 ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC 666
Query 667 TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG 740
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Sbjct 667 TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG 740
Query 741 GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA 814
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Sbjct 741 GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA 814
Query 815 TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA 888
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Sbjct 815 TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA 888
Query 889 CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA 962
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Sbjct 889 CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA 962
Query 963 GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC 1036
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Sbjct 963 GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC 1036
Query 1037 CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG 1110
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Sbjct 1037 CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG 1110
Query 1111 CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA 1184
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Sbjct 1111 CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA 1184
Query 1185 TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG 1258
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Sbjct 1185 TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG 1258
Query 1259 ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG 1332
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Sbjct 1259 ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG 1332
Query 1333 GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAGGCTGGAGTACAGTGGCTCGATTTCAGATCACTG-----CAACC 1401
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Sbjct 1333 GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAG------------------GATTTC--ATCA-TGTTGCCCAGGC 1385
Query 1402 TCTGCCTTCCA-------GGTTCAAGCGATTCTCCTGCC-TCAGCCTCC---------------AGAG------ 1446
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Sbjct 1386 TCATC--TCGAACTCGTGGGGTCAAGGAATTCGCCAGCCTTCAGCCTCCCAACGTGCTGGGATTACAGGAAGCC 1457
Query 1447 ------------- 1446
Sbjct 1458 GGTGGTCATGCCA 1470