Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12574
- Subject:
- NM_001308173.2
- Aligned Length:
- 1305
- Identities:
- 951
- Gaps:
- 354
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATGGATGAGCCGTGGTGGGAAGGGCGCGTCGCCTCGGACGTCCACTGCACCCTGCGCGAGAAGGAACTGAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCTGCCCACCTTCCGAGCCCACTCCCCACTCCTGAAGAGCCGCCGGTTCTTCGTGGACATCCTGACCCTGCTGA 148
Query 1 --------------------------------------------------------------ATGGATCGCTAC 12
||||||||||||
Sbjct 149 GCAGCCACTGCCAGCTCTGCCCTGCAGCCCGGCACCTGGCCGTCTACCTGCTGGACCACTTCATGGATCGCTAC 222
Query 13 AACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAGTTTCGCTCTT 86
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAA---------------- 280
Query 87 ATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 160
Sbjct 281 -------------------------------------------------------------------------- 280
Query 161 CTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTCGAGGATCGGGAA 234
||||||||||||||||||||
Sbjct 281 ------------------------------------------------------GTAAGTTCGAGGATCGGGAA 300
Query 235 GACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAA 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAA 374
Query 309 GGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACT 382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 GGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACT 448
Query 383 TCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCC 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 TCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCC 522
Query 457 CGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTA 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 CGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTA 596
Query 531 CAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACT 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 CAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACT 670
Query 605 GGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTA 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 GGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTA 744
Query 679 GTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCC 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 GTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCC 818
Query 753 CACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACCCTGGCACAGT 826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 CACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACCCTGGCACAGT 892
Query 827 TCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 TCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTC 966
Query 901 TCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGT 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 TCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGT 1040
Query 975 CCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCA 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 CCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCA 1114
Query 1049 GCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 1095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 GCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 1161