Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12574
- Subject:
- XM_011534647.3
- Aligned Length:
- 1100
- Identities:
- 960
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGGATCG---CTACAACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAA 71
|||..|.| ||||...| .|||||| |.|||| ||.||.|
Sbjct 1 ATGTGTTGTATCTACTGTG-----------GAGCAGC------CTGTGG---------------TGGTTAC--- 39
Query 72 CGGAGTTTCGCTCTTATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAG 145
||| ||||||.||| ||.| ||| |||||| .|| ||.|.|| |.|
Sbjct 40 ------TTC---CTTATCTCCC---CTAA---GCA---GCATGA---GAG---ATGGGAA-----------CTG 78
Query 146 GTTC--AAGCAATTCTCCTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTA 217
|.|| |.|||.|| |.|||||.|| .||||||
Sbjct 79 GGTCAGAGGCACTT-----------------------------------------GCAGCTGGGA--GCAGGTA 109
Query 218 AGTTCGAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAAC 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 AGTTCGAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAAC 183
Query 292 TTCACCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCT 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TTCACCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCT 257
Query 366 GCCCACGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCT 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 GCCCACGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCT 331
Query 440 GGCCCACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTG 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 GGCCCACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTG 405
Query 514 CAAGATCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCT 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 CAAGATCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCT 479
Query 588 GCAGCTTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTA 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GCAGCTTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTA 553
Query 662 TTGAAATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATG 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 TTGAAATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATG 627
Query 736 GTGCCCGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGC 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 GTGCCCGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGC 701
Query 810 GACCACCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACC 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GACCACCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACC 775
Query 884 GTTCAGGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGAT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 GTTCAGGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGAT 849
Query 958 ATGTGTCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGC 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ATGTGTCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGC 923
Query 1032 CACCACCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 CACCACCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 987