Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12622
- Subject:
- NM_024751.3
- Aligned Length:
- 1899
- Identities:
- 1635
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 ATGAAAGCCATAAAGAAAAGTCTTACAGAAGAAGAATACCTGTACCTGGACTTTTCTCACCAAACAGAAGGATG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAGCCATAAAGAAAAGTCTTACAGAAGAAGAATACCTGTACCTGGACTTTTCTCACCAAACAGAAGGATG 74
Query 75 CATCTTTCCTCTTCATACATCTGTAACTTTATTTCTGTTATCTTACTGTGACTGTAAAATCTTTAAAATTTGCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCTTTCCTCTTCATACATCTGTAACTTTATTTCTGTTATCTTACTGTGACTGTAAAATCTTTAAAATTTGCT 148
Query 149 TAGTTGTCACCAAAGAGGTGAGTAGAGATAGTTCACTACTAAGAGATGACCTGATCCAGGATGTTGAAATACAG 222
|||||||||||||||||
Sbjct 149 TAGTTGTCACCAAAGAG--------------------------------------------------------- 165
Query 223 ATTATTTCAAGGCAGGAGCTCCCACCAATAGTCCAAAATTGCTGTTTGCCTGCAGTAGTAGAACGATCAGACAA 296
Sbjct 166 -------------------------------------------------------------------------- 165
Query 297 TTTTTGTAGAGCAGGACTTGCTGTTGTATTGAGACACATAATCCAGAAATCCTATGAAGCAGACCCCTTAAAGA 370
Sbjct 166 -------------------------------------------------------------------------- 165
Query 371 AGGAACTTTTGGAACTTCTGGGCTTTAAAAAGACTTGCTTGAAAGCCTGTGCTGAAGTTAGTCAGTGGACCAGG 444
||||||||||||||||||
Sbjct 166 --------------------------------------------------------GTTAGTCAGTGGACCAGG 183
Query 445 CTATGTGAACTCACCATCCCTTTGGCTATTGAGAATTTTCTCAGAGAATCTTCTGACCAGCCCCCAACTATACC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 CTATGTGAACTCACCATCCCTTTGGCTATTGAGAATTTTCTCAGAGAATCTTCTGACCAGCCCCCAACTATACC 257
Query 519 TGTAGAAATACTACAGCTAGAGAAAAAGCTTAGTGAGCCTGTTAGAGTGCATAATGATGATAAACTCCGCAGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 TGTAGAAATACTACAGCTAGAGAAAAAGCTTAGTGAGCCTGTTAGAGTGCATAATGATGATAAACTCCGCAGGC 331
Query 593 AGAAGCTCAAGCAACAGAAGGCTGATGGAGTTGGGCCTCCCCTTACTAAGGGAAAGGCAAAGAGCAAGGTCCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 AGAAGCTCAAGCAACAGAAGGCTGATGGAGTTGGGCCTCCCCTTACTAAGGGAAAGGCAAAGAGCAAGGTCCAC 405
Query 667 ACACAGGAAACATCTGAAGGGTTGGATTCTTCATCCAAGAGTCTGGAACTGAAAGTGGCATTCTCAAAGCTCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 ACACAGGAAACATCTGAAGGGTTGGATTCTTCATCCAAGAGTCTGGAACTGAAAGTGGCATTCTCAAAGCTCAC 479
Query 741 AGTACAGGAAGAACCAGCTACTACCAACAGAGAGCCTTCTCACATCAGAAAAGCAAAAGCCTCCGACCTTCCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 AGTACAGGAAGAACCAGCTACTACCAACAGAGAGCCTTCTCACATCAGAAAAGCAAAAGCCTCCGACCTTCCAC 553
Query 815 CTCTGGAGCATGTGTTTGCAGAAGGGCTTTACTTCACTCTGGCAGATATTGTGCTCTTGCCCTGTATCCATCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 CTCTGGAGCATGTGTTTGCAGAAGGGCTTTACTTCACTCTGGCAGATATTGTGCTCTTGCCCTGTATCCATCAT 627
Query 889 TTCTTGGTAATTATCAGCAGGAAATTTTCTGAGAAGCTGGTAGAATTTCCATTGCTAGCCTCTTGGTACCAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 TTCTTGGTAATTATCAGCAGGAAATTTTCTGAGAAGCTGGTAGAATTTCCATTGCTAGCCTCTTGGTACCAGAG 701
Query 963 GATTCAGGAAGTGCCAGGAGTAAAAA---CAGCTTCTAAGTGTGGGATCCAATTTCTCCATTTACCAAAGTTGT 1033
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GATTCAGGAAGTGCCAGGAGTAAAAACAGCAGCTTCTAAGTGTGGGATCCAATTTCTCCATTTACCAAAGTTGT 775
Query 1034 TGACAACCTCAACTGAACAGCATCCAAACTTATGTGAAGTCCCAGGTGTAGAAGAGCAAAGCGATCCTTTATTT 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 TGACAACCTCAACTGAACAGCATCCAAACTTATGTGAAGTCCCAGGTGTAGAAGAGCAAAGCGATCCTTTATTT 849
Query 1108 ATAGGAGGACCAAGACCAACCATGGCCAAGTTAATGGAAAAGGGCATTGAAGTGATGTTTTCTCCCCACCCTTG 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ATAGGAGGACCAAGACCAACCATGGCCAAGTTAATGGAAAAGGGCATTGAAGTGATGTTTTCTCCCCACCCTTG 923
Query 1182 CCCTACTTGGACTCTTGATTGGAATGTTCTCCCTGCAGCAGTCAGCCCAAAGGAAGGTAAAATGTCCAGTGATC 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 CCCTACTTGGACTCTTGATTGGAATGTTCTCCCTGCAGCAGTCAGCCCAAAGGAAGGTAAAATGTCCAGTGATC 997
Query 1256 GAGCTTTGAGGAAGCAGCAACAGTTGAACAACCTTGTCTATGTGGTAACAAATCAGGCCAAACCTGGTGACAGA 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 GAGCTTTGAGGAAGCAGCAACAGTTGAACAACCTTGTCTATGTGGTAACAAATCAGGCCAAACCTGGTGACAGA 1071
Query 1330 ATTGTGGATTTCTGCAGCGGTGGGGGCCATGTTGGAATTGTCCTTGCTCACATGCTGCCATCATGTCAGGTTAC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 ATTGTGGATTTCTGCAGCGGTGGGGGCCATGTTGGAATTGTCCTTGCTCACATGCTGCCATCATGTCAGGTTAC 1145
Query 1404 ATTAATAGAAAACAAGGAATTATCATTAATTCGTGCTAAGAAGAGAAGTGATGAACTGGGTTTAAGCAACATTT 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 ATTAATAGAAAACAAGGAATTATCATTAATTCGTGCTAAGAAGAGAAGTGATGAACTGGGTTTAAGCAACATTT 1219
Query 1478 GGTTCATTCAAGCAAATATGGAATATTTTACTGGGATGTTTAATATTGGAGTAGCATTGCATGCTTGTGGAGTG 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 GGTTCATTCAAGCAAATATGGAATATTTTACTGGGATGTTTAATATTGGAGTAGCATTGCATGCTTGTGGAGTG 1293
Query 1552 GCAACAGACATGGTGATTGAGCACTGTATCAAAACACGGGCTTCCTTCGTCACATGCCCTTGCTGTTATGGTTT 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 GCAACAGACATGGTGATTGAGCACTGTATCAAAACACGGGCTTCCTTCGTCACATGCCCTTGCTGTTATGGTTT 1367
Query 1626 CATTCAGAACACCTCAAAGTTCAATTTTCCAAAAAGTGAACAATTCAAGAAAACTTTATCATACAAGGAACACA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 CATTCAGAACACCTCAAAGTTCAATTTTCCAAAAAGTGAACAATTCAAGAAAACTTTATCATACAAGGAACACA 1441
Query 1700 TGATTCTGTGCAGATTTGCAGACCAGACAGCTGTCCAGCTCCCACCCCAACGAAGGCTCATAGGAAAACAGTGC 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 TGATTCTGTGCAGATTTGCAGACCAGACAGCTGTCCAGCTCCCACCCCAACGAAGGCTCATAGGAAAACAGTGC 1515
Query 1774 ATGTGCTTGGTGGATCTGGATCGAGCAAGAGCTGCAGAAGAATGTGGATACTCCGTTCAAGTGATATCCATGGA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 ATGTGCTTGGTGGATCTGGATCGAGCAAGAGCTGCAGAAGAATGTGGATACTCCGTTCAAGTGATATCCATGGA 1589
Query 1848 GCCAGAGAGCTGCTCTCCCAAAAATAACATGATTGTGGGAGTCCCCATT 1896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 GCCAGAGAGCTGCTCTCCCAAAAATAACATGATTGTGGGAGTCCCCATT 1638