Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12622
- Subject:
- XM_011532252.3
- Aligned Length:
- 1899
- Identities:
- 1896
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGAAAGCCATAAAGAAAAGTCTTACAGAAGAAGAATACCTGTACCTGGACTTTTCTCACCAAACAGAAGGATG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAGCCATAAAGAAAAGTCTTACAGAAGAAGAATACCTGTACCTGGACTTTTCTCACCAAACAGAAGGATG 74
Query 75 CATCTTTCCTCTTCATACATCTGTAACTTTATTTCTGTTATCTTACTGTGACTGTAAAATCTTTAAAATTTGCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCTTTCCTCTTCATACATCTGTAACTTTATTTCTGTTATCTTACTGTGACTGTAAAATCTTTAAAATTTGCT 148
Query 149 TAGTTGTCACCAAAGAGGTGAGTAGAGATAGTTCACTACTAAGAGATGACCTGATCCAGGATGTTGAAATACAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAGTTGTCACCAAAGAGGTGAGTAGAGATAGTTCACTACTAAGAGATGACCTGATCCAGGATGTTGAAATACAG 222
Query 223 ATTATTTCAAGGCAGGAGCTCCCACCAATAGTCCAAAATTGCTGTTTGCCTGCAGTAGTAGAACGATCAGACAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTATTTCAAGGCAGGAGCTCCCACCAATAGTCCAAAATTGCTGTTTGCCTGCAGTAGTAGAACGATCAGACAA 296
Query 297 TTTTTGTAGAGCAGGACTTGCTGTTGTATTGAGACACATAATCCAGAAATCCTATGAAGCAGACCCCTTAAAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTTTGTAGAGCAGGACTTGCTGTTGTATTGAGACACATAATCCAGAAATCCTATGAAGCAGACCCCTTAAAGA 370
Query 371 AGGAACTTTTGGAACTTCTGGGCTTTAAAAAGACTTGCTTGAAAGCCTGTGCTGAAGTTAGTCAGTGGACCAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGAACTTTTGGAACTTCTGGGCTTTAAAAAGACTTGCTTGAAAGCCTGTGCTGAAGTTAGTCAGTGGACCAGG 444
Query 445 CTATGTGAACTCACCATCCCTTTGGCTATTGAGAATTTTCTCAGAGAATCTTCTGACCAGCCCCCAACTATACC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTATGTGAACTCACCATCCCTTTGGCTATTGAGAATTTTCTCAGAGAATCTTCTGACCAGCCCCCAACTATACC 518
Query 519 TGTAGAAATACTACAGCTAGAGAAAAAGCTTAGTGAGCCTGTTAGAGTGCATAATGATGATAAACTCCGCAGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTAGAAATACTACAGCTAGAGAAAAAGCTTAGTGAGCCTGTTAGAGTGCATAATGATGATAAACTCCGCAGGC 592
Query 593 AGAAGCTCAAGCAACAGAAGGCTGATGGAGTTGGGCCTCCCCTTACTAAGGGAAAGGCAAAGAGCAAGGTCCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAGCTCAAGCAACAGAAGGCTGATGGAGTTGGGCCTCCCCTTACTAAGGGAAAGGCAAAGAGCAAGGTCCAC 666
Query 667 ACACAGGAAACATCTGAAGGGTTGGATTCTTCATCCAAGAGTCTGGAACTGAAAGTGGCATTCTCAAAGCTCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACACAGGAAACATCTGAAGGGTTGGATTCTTCATCCAAGAGTCTGGAACTGAAAGTGGCATTCTCAAAGCTCAC 740
Query 741 AGTACAGGAAGAACCAGCTACTACCAACAGAGAGCCTTCTCACATCAGAAAAGCAAAAGCCTCCGACCTTCCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTACAGGAAGAACCAGCTACTACCAACAGAGAGCCTTCTCACATCAGAAAAGCAAAAGCCTCCGACCTTCCAC 814
Query 815 CTCTGGAGCATGTGTTTGCAGAAGGGCTTTACTTCACTCTGGCAGATATTGTGCTCTTGCCCTGTATCCATCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCTGGAGCATGTGTTTGCAGAAGGGCTTTACTTCACTCTGGCAGATATTGTGCTCTTGCCCTGTATCCATCAT 888
Query 889 TTCTTGGTAATTATCAGCAGGAAATTTTCTGAGAAGCTGGTAGAATTTCCATTGCTAGCCTCTTGGTACCAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCTTGGTAATTATCAGCAGGAAATTTTCTGAGAAGCTGGTAGAATTTCCATTGCTAGCCTCTTGGTACCAGAG 962
Query 963 GATTCAGGAAGTGCCAGGAGTAAAAA---CAGCTTCTAAGTGTGGGATCCAATTTCTCCATTTACCAAAGTTGT 1033
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GATTCAGGAAGTGCCAGGAGTAAAAACAGCAGCTTCTAAGTGTGGGATCCAATTTCTCCATTTACCAAAGTTGT 1036
Query 1034 TGACAACCTCAACTGAACAGCATCCAAACTTATGTGAAGTCCCAGGTGTAGAAGAGCAAAGCGATCCTTTATTT 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGACAACCTCAACTGAACAGCATCCAAACTTATGTGAAGTCCCAGGTGTAGAAGAGCAAAGCGATCCTTTATTT 1110
Query 1108 ATAGGAGGACCAAGACCAACCATGGCCAAGTTAATGGAAAAGGGCATTGAAGTGATGTTTTCTCCCCACCCTTG 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATAGGAGGACCAAGACCAACCATGGCCAAGTTAATGGAAAAGGGCATTGAAGTGATGTTTTCTCCCCACCCTTG 1184
Query 1182 CCCTACTTGGACTCTTGATTGGAATGTTCTCCCTGCAGCAGTCAGCCCAAAGGAAGGTAAAATGTCCAGTGATC 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCTACTTGGACTCTTGATTGGAATGTTCTCCCTGCAGCAGTCAGCCCAAAGGAAGGTAAAATGTCCAGTGATC 1258
Query 1256 GAGCTTTGAGGAAGCAGCAACAGTTGAACAACCTTGTCTATGTGGTAACAAATCAGGCCAAACCTGGTGACAGA 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGCTTTGAGGAAGCAGCAACAGTTGAACAACCTTGTCTATGTGGTAACAAATCAGGCCAAACCTGGTGACAGA 1332
Query 1330 ATTGTGGATTTCTGCAGCGGTGGGGGCCATGTTGGAATTGTCCTTGCTCACATGCTGCCATCATGTCAGGTTAC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTGTGGATTTCTGCAGCGGTGGGGGCCATGTTGGAATTGTCCTTGCTCACATGCTGCCATCATGTCAGGTTAC 1406
Query 1404 ATTAATAGAAAACAAGGAATTATCATTAATTCGTGCTAAGAAGAGAAGTGATGAACTGGGTTTAAGCAACATTT 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATTAATAGAAAACAAGGAATTATCATTAATTCGTGCTAAGAAGAGAAGTGATGAACTGGGTTTAAGCAACATTT 1480
Query 1478 GGTTCATTCAAGCAAATATGGAATATTTTACTGGGATGTTTAATATTGGAGTAGCATTGCATGCTTGTGGAGTG 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGTTCATTCAAGCAAATATGGAATATTTTACTGGGATGTTTAATATTGGAGTAGCATTGCATGCTTGTGGAGTG 1554
Query 1552 GCAACAGACATGGTGATTGAGCACTGTATCAAAACACGGGCTTCCTTCGTCACATGCCCTTGCTGTTATGGTTT 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAACAGACATGGTGATTGAGCACTGTATCAAAACACGGGCTTCCTTCGTCACATGCCCTTGCTGTTATGGTTT 1628
Query 1626 CATTCAGAACACCTCAAAGTTCAATTTTCCAAAAAGTGAACAATTCAAGAAAACTTTATCATACAAGGAACACA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CATTCAGAACACCTCAAAGTTCAATTTTCCAAAAAGTGAACAATTCAAGAAAACTTTATCATACAAGGAACACA 1702
Query 1700 TGATTCTGTGCAGATTTGCAGACCAGACAGCTGTCCAGCTCCCACCCCAACGAAGGCTCATAGGAAAACAGTGC 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGATTCTGTGCAGATTTGCAGACCAGACAGCTGTCCAGCTCCCACCCCAACGAAGGCTCATAGGAAAACAGTGC 1776
Query 1774 ATGTGCTTGGTGGATCTGGATCGAGCAAGAGCTGCAGAAGAATGTGGATACTCCGTTCAAGTGATATCCATGGA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATGTGCTTGGTGGATCTGGATCGAGCAAGAGCTGCAGAAGAATGTGGATACTCCGTTCAAGTGATATCCATGGA 1850
Query 1848 GCCAGAGAGCTGCTCTCCCAAAAATAACATGATTGTGGGAGTCCCCATT 1896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCAGAGAGCTGCTCTCCCAAAAATAACATGATTGTGGGAGTCCCCATT 1899