Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12639
• Subject: XM_011522043.3
• Aligned Length: 2096
• Identities: 1459
• Gaps: 634

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAAGAAAAGGAACATGTCCTGAGGTTACAGAAAGGGAAAGGAGAGCTATCCCATTGCTGGGCAGAGGACTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCAGAATAGATGTCTGTGTGAAGGGGAGTTAAATGTTCCTTCTCTGATCAGTGTGTTCTATTCATCCATCCTAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGAGGGAACCTCAAGAGGAAGATGTTCAGCTCATATGGAGCATTGGCTGTGATGACTACTTAGGCTCCGACAAA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGCTGTCAGGTTGTGTCGGGCGTGTTTAAGCATGC  296

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGT  4
                                                                                  ||||
Sbjct  297  CCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGAGGGAGCCACGAAAATCAACATCACGGAGATGT  370

Query    5  ACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGAT  78
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGAT  444

Query   79  CGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGG  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGG  518

Query  153  AGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAG  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAG  592

Query  227  GCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGG  666

Query  301  GAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGA  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGA  740

Query  375  GAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATC  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATC  814

Query  449  CAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGAT  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGAT  888

Query  523  CACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCG  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCG  962

Query  597  CTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGG  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGG  1036

Query  671  AGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGT  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGT  1110

Query  745  GGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTA  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTA  1184

Query  819  CCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCC  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCC  1258

Query  893  GGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAAC  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAAC  1332

Query  967  ATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGG  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGG  1406

Query 1041  ACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGA  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGA  1480

Query 1115  CACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCA  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCA  1554

Query 1189  GAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTC  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTC  1628

Query 1263  CATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGT  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGT  1702

Query 1337  TGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCC  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCC  1776

Query 1411  AAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCCATGCTCACCAGG-------------CC---AA  1468
            ||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|.||||||  ||    |||||             ||   ||
Sbjct 1777  AAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC--TG----CCAGGGTGGCTTTCGGGTCCGGGAA  1842

Query 1469  GT------------------------------------------------------------------------  1470
            ||                                                                        
Sbjct 1843  GTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGTGACCCTCAGTTGAAACCAGAAGAGAGAGAATC  1916

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1917  TTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTGCAAGGACAAGTACTACAACTGCAACGTGGTGG  1990

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1991  TCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCTGCTGTGCCTCCTGCACCCGTGTGGCCAACAGG  2064

Query 1471  ------------------------  1470
                                    
Sbjct 2065  CAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA  2088