Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12639
- Subject:
- XM_017022585.1
- Aligned Length:
- 2030
- Identities:
- 1459
- Gaps:
- 568
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGACCCAATTATGTATGTCCAGAAAGCAGTAGAAGTATCCGGGAGGTACAGTGTGCATCCTACAACAAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAGCCATTCATGGGCCGGTTTTATGAGTGGGAACCATTTGCAGAAGAGCATTGGCTGTGATGACTACTTAGGCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCGACAAAGTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGCTGTCAGGTTGTGTCGGGCGTGTTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AAGCATGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGAGGGAGCCACGAAAATCAACATCAC 296
Query 1 ----ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGG 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGG 370
Query 71 CAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGC 144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGC 444
Query 145 ACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCC 218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCC 518
Query 219 AAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGA 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGA 592
Query 293 GACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGG 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGG 666
Query 367 AACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGT 740
Query 441 CAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCA 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCA 814
Query 515 GCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCT 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCT 888
Query 589 ATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGAC 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGAC 962
Query 663 CCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCA 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCA 1036
Query 737 AGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTG 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTG 1110
Query 811 CAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTG 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTG 1184
Query 885 GCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTG 1258
Query 959 TGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGC 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGC 1332
Query 1033 GACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGG 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGG 1406
Query 1107 AGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACC 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACC 1480
Query 1181 GGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGT 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGT 1554
Query 1255 CAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTT 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTT 1628
Query 1329 TGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTT 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTT 1702
Query 1403 GCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCCATGCTCACCAGG------------ 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|.|.|||||| || |||||
Sbjct 1703 GCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC--TG----CCAGGGTGGCTTTCGGG 1768
Query 1465 -CC---AAGT---------------------------------------------------------------- 1470
|| ||||
Sbjct 1769 TCCGGGAAGTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGTGACCCTCAGTTGAAACCAGAAGAG 1842
Query 1471 -------------------------------------------------------------------------- 1470
Sbjct 1843 AGAGAATCTTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTGCAAGGACAAGTACTACAACTGCAA 1916
Query 1471 -------------------------------------------------------------------------- 1470
Sbjct 1917 CGTGGTGGTCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCTGCTGTGCCTCCTGCACCCGTGTGG 1990
Query 1471 -------------------------------- 1470
Sbjct 1991 CCAACAGGCAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA 2022