Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12676
• Subject: NM_001319307.2
• Aligned Length: 1011
• Identities: 836
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGCCCGTCCTATGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCCAAGGACCAAGTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAG  148
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAG  22

Query  149  AATCTGCAGCTCTCTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  AATCTGCAGCTCTCTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGA  96

Query  223  GGACACATGGCTTCCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  GGACACATGGCTTCCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCAC  170

Query  297  AGCATCTGGGGTCTTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  AGCATCTGGGGTCTTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATA  244

Query  371  CCCAGACAGTTTATGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  CCCAGACAGTTTATGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAA  318

Query  445  GAGTTTGTGAAACACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  GAGTTTGTGAAACACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTT  392

Query  519  AGATATATCAAACCAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  AGATATATCAAACCAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGA  466

Query  593  CATCAGAAGGACTCTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  467  CATCAGAAGGACTCTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGT  540

Query  667  GGTTATACAAGTCGCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GGTTATACAAGTCGCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGA  614

Query  741  GTCTTTAATATTTATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  GTCTTTAATATTTATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAA  688

Query  815  GCCTCATTATAGTGGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  GCCTCATTATAGTGGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATT  762

Query  889  TGGCCTGGTTGTGAAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  TGGCCTGGTTGTGAAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAG  836

Query  963  G------------------------------------------------  963
            .                                                
Sbjct  837  ACAAGCCATCTATGATGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC  885