Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12686
• Subject: NM_001201573.1
• Aligned Length: 867
• Identities: 668
• Gaps: 198

Alignment

Query   1  ATGGTTTGTGGGCGCCAGTTGTCTGGCGCCGGGAGTGAGACCCTAAAACAAAGAAGAACACAAATCATGTCCCG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AGGACTTCCAAAGCAGAAACCGATAGAAGGTGTTAAACAAGTTATAGTTGTGGCTTCTGGAAAGGGTGGAGTCG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GAAAATCTACTACAGCAGTGAATCTTGCACTTGCACTAGCAGCGAACGATTCGTCCAAGGCCATTGGTTTGCTA  222
                                                           ||  ||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------AT--GTCCAAGGCCATTGGTTTGCTA  24

Query 223  GATGTGGATGTGTATGGACCTTCAGTTCCAAAGATGATGAATCTGAAAGGAAATCCGGAATTATCACAGAGCAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  25  GATGTGGATGTGTATGGACCTTCAGTTCCAAAGATGATGAATCTGAAAGGAAATCCGGAATTATCACAGAGCAA  98

Query 297  CCTAATGAGGCCTCTCTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAGAAAGTGAACCAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  99  CCTAATGAGGCCTCTCTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAGAAAGTGAACCAG  172

Query 371  TAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGGGGTCAACTGGAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173  TAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGGGGTCAACTGGAC  246

Query 445  TACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGACTATTCCTATAACAGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 247  TACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGAATATTCCTATAACAGG  320

Query 519  TGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGATGTTTCGCAGAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321  TGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGATGTTTCGCAGAG  394

Query 593  TCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAACACAAAACTCAT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395  TCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAACACAAAACTCAT  468

Query 667  ATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGACATTCCCTTACA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469  ATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGACATTCCCTTACA  542

Query 741  CCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTGATGAGGCCAAAG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543  CCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTGATGAGGCCAAAG  616

Query 815  CTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  867
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617  CTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  669