Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12686
• Subject: XM_011537181.2
• Aligned Length: 867
• Identities: 638
• Gaps: 225

Alignment

Query   1  ATGGTTTGTGGGCGCCAGTTGTCTGGCGCCGGGAGTGAGACCCTAAAACAAAGAAGAACACAAATCATGTCCCG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AGGACTTCCAAAGCAGAAACCGATAGAAGGTGTTAAACAAGTTATAGTTGTGGCTTCTGGAAAGGGTGGAGTCG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GAAAATCTACTACAGCAGTGAATCTTGCACTTGCACTAGCAGCGAACGATTCGTCCAAGGCCATTGGTTTGCTA  222
               ||..|||    ||||.|||                             ||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----ATGAACT----CAGTAAAT-----------------------------GTCCAAGGCCATTGGTTTGCTA  37

Query 223  GATGTGGATGTGTATGGACCTTCAGTTCCAAAGATGATGAATCTGAAAGGAAATCCGGAATTATCACAGAGCAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  38  GATGTGGATGTGTATGGACCTTCAGTTCCAAAGATGATGAATCTGAAAGGAAATCCGGAATTATCACAGA----  107

Query 297  CCTAATGAGGCCTCTCTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAGAAAGTGAACCAG  370
                                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108  ------------------------------------TATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAGAAAGTGAACCAG  145

Query 371  TAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGGGGTCAACTGGAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146  TAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGGGGTCAACTGGAC  219

Query 445  TACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGACTATTCCTATAACAGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 220  TACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGAATATTCCTATAACAGG  293

Query 519  TGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGATGTTTCGCAGAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294  TGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGATGTTTCGCAGAG  367

Query 593  TCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAACACAAAACTCAT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368  TCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAACACAAAACTCAT  441

Query 667  ATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGACATTCCCTTACA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442  ATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGACATTCCCTTACA  515

Query 741  CCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTGATGAGGCCAAAG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516  CCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTGATGAGGCCAAAG  589

Query 815  CTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  867
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590  CTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  642