Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12686
• Subject: XM_011537182.2
• Aligned Length: 867
• Identities: 566
• Gaps: 300

Alignment

Query   1  ATGGTTTGTGGGCGCCAGTTGTCTGGCGCCGGGAGTGAGACCCTAAAACAAAGAAGAACACAAATCATGTCCCG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AGGACTTCCAAAGCAGAAACCGATAGAAGGTGTTAAACAAGTTATAGTTGTGGCTTCTGGAAAGGGTGGAGTCG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GAAAATCTACTACAGCAGTGAATCTTGCACTTGCACTAGCAGCGAACGATTCGTCCAAGGCCATTGGTTTGCTA  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  GATGTGGATGTGTATGGACCTTCAGTTCCAAAGATGATGAATCTGAAAGGAAATCCGGAATTATCACAGAGCAA  296
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 297  CCTAATGAGGCCTCTCTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAGAAAGTGAACCAG  370
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----ATGAGGCCTCTCTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAGAAAGTGAACCAG  70

Query 371  TAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGGGGTCAACTGGAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  71  TAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGGGGTCAACTGGAC  144

Query 445  TACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGACTATTCCTATAACAGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 145  TACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGAATATTCCTATAACAGG  218

Query 519  TGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGATGTTTCGCAGAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219  TGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGATGTTTCGCAGAG  292

Query 593  TCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAACACAAAACTCAT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293  TCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAACACAAAACTCAT  366

Query 667  ATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGACATTCCCTTACA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367  ATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGACATTCCCTTACA  440

Query 741  CCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTGATGAGGCCAAAG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  CCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTGATGAGGCCAAAG  514

Query 815  CTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  867
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515  CTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  567