Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12695
• Subject: XM_006723640.1
• Aligned Length: 2469
• Identities: 2076
• Gaps: 393

Alignment

Query    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74

Query   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148

Query  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222

Query  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  296

Query  297  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACAC--------------------------------------  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  297  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGTGAGATGCTTCCATGGGCTCTGGGATGCACCGCCAG  370

Query  333  -GGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG  405
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG  444

Query  406  ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA  518

Query  480  CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG  592

Query  554  GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG  666

Query  628  AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA  740

Query  702  ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG  814

Query  776  GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC-----------------------------------------------  802
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  815  GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCACGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTG  888

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  889  CAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGACTCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGG  962

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  963  CGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCGCGCCGAGAGCTCGGGAGGCGACCACTCGGAGCTCC  1036

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1037  CCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATGAGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGC  1110

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1111  TGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGCTGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTT  1184

Query  803  --------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGG  868
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGG  1258

Query  869  ACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGC  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGC  1332

Query  943  CCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCA  1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCA  1406

Query 1017  CGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACC  1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACC  1480

Query 1091  TCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCC  1164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCC  1554

Query 1165  AGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGG  1238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGG  1628

Query 1239  CTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGG  1312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGG  1702

Query 1313  ACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAG  1386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAG  1776

Query 1387  CCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCG  1460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCG  1850

Query 1461  GGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTG  1534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTG  1924

Query 1535  GACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCC  1608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCC  1998

Query 1609  TGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGA  1682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGA  2072

Query 1683  CAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCA  1756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCA  2146

Query 1757  TGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCC  1830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCC  2220

Query 1831  CATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGA  1904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGA  2294

Query 1905  CCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTG  1978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTG  2368

Query 1979  AGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA---AGATCAA  2049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
Sbjct 2369  AGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGCAGATCAA  2442

Query 2050  GTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2076
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2469