Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12695
- Subject:
- XM_011529366.1
- Aligned Length:
- 2478
- Identities:
- 2073
- Gaps:
- 405
Alignment
Query 1 ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT 74
Query 75 GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC 148
Query 149 CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC 222
Query 223 CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC 296
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCA---GCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC 293
Query 297 AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACAC-------------------------------------- 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGTGAGATGCTTCCATGGGCTCTGGGATGCACCGCCAG 367
Query 333 -GGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG 405
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 AGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG 441
Query 406 ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA 515
Query 480 CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG 589
Query 554 GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG 663
Query 628 AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA 737
Query 702 ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG 811
Query 776 GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC----------------------------------------------- 802
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCACGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTG 885
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 886 CAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGACTCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGG 959
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 960 CGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCGCGCCGAGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACT 1033
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1034 CGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATGAGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCC 1107
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1108 GACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGCTGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCC 1181
Query 803 -----------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCA 859
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCA 1255
Query 860 ATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGT 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 ATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGT 1329
Query 934 GACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCA 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCA 1403
Query 1008 GTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTG 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 GTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTG 1477
Query 1082 ACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCA 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 ACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCA 1551
Query 1156 CCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTG 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 CCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTG 1625
Query 1230 GGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACT 1699
Query 1304 GCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAG 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 GCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAG 1773
Query 1378 GGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGT 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGT 1847
Query 1452 GACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCA 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCA 1921
Query 1526 CCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGC 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 CCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGC 1995
Query 1600 CTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACC 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 CTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACC 2069
Query 1674 CTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCC 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCC 2143
Query 1748 TGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTC 1821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 TGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTC 2217
Query 1822 CCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCC 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 CCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCC 2291
Query 1896 ACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCC 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 ACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCC 2365
Query 1970 TGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA- 2042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 TGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAA 2439
Query 2043 --AGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 GCAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2475