Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12695
• Subject: XM_011529367.1
• Aligned Length: 2439
• Identities: 2073
• Gaps: 366

Alignment

Query    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74

Query   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148

Query  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222

Query  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCA---GCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  293

Query  297  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCC  367

Query  371  CCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTAT  441

Query  445  TATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  TATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCT  515

Query  519  CACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCC  589

Query  593  AGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTG  663

Query  667  TTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  TTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCT  737

Query  741  TCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC------------  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  738  TCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCA  811

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  812  CGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTGCAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGAC  885

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  886  TCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGGCGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCG  959

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  960  CGCCGAGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACTCGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATG  1033

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1034  AGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGC  1107

Query  803  ----------------------------------------------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGC  824
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGC  1181

Query  825  CTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCT  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCT  1255

Query  899  GCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGC  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  GCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGC  1329

Query  973  TTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  TTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAA  1403

Query 1047  GCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCC  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCC  1477

Query 1121  ACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCA  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  ACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCA  1551

Query 1195  TGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCA  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  TGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCA  1625

Query 1269  GGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAG  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAG  1699

Query 1343  GGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCA  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  GGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCA  1773

Query 1417  GTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCT  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCT  1847

Query 1491  GGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCT  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  GGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCT  1921

Query 1565  GCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAAC  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  GCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAAC  1995

Query 1639  CATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAG  1712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAG  2069

Query 1713  TGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCC  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  TGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCC  2143

Query 1787  CAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGA  1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  CAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGA  2217

Query 1861  AGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGA  1934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  AGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGA  2291

Query 1935  GTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTG  2008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  GTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTG  2365

Query 2009  AGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA---AGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  AGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGCAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2436