Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12708
• Subject: XM_005256181.2
• Aligned Length: 1860
• Identities: 1758
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGGCAAGTGTTGCCCAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAAGTTGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCC  148
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------ATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCC  46

Query  149  CACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  CACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTG  120

Query  223  GCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGA  194

Query  297  GCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  GCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACT  268

Query  371  TTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  TTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATG  342

Query  445  GAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  GAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAA  416

Query  519  CCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAA  490

Query  593  GCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  GCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCAC  564

Query  667  CCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAG  638

Query  741  TGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  TGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCG  712

Query  815  AGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  AGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCC  786

Query  889  GACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGC  860

Query  963  CAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  CAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACG  934

Query 1037  TGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  TGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGAT  1008

Query 1111  GGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  GGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCA  1082

Query 1185  CATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  CATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCA  1156

Query 1259  TGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  TGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGAC  1230

Query 1333  AACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  AACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCT  1304

Query 1407  GTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  GTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGT  1378

Query 1481  CCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  CCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTC  1452

Query 1555  ACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  ACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCAC  1526

Query 1629  TCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  TCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGA  1600

Query 1703  CCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  CCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACC  1674

Query 1777  AAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  AAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACAC  1748

Query 1851  CGAAGCCTGG  1860
            ||||||||||
Sbjct 1749  CGAAGCCTGG  1758