Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12714
- Subject:
- NM_001288752.2
- Aligned Length:
- 1380
- Identities:
- 1056
- Gaps:
- 321
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCCTGATGCTGGATGACCAACCCCCTATGGAGGCCCAGTATGCAGAGGAGGGCCCAGGACCTGGGATCTT 74
Query 1 -------------------------------ATGATTGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGAC 43
| ||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGAGCAGAGCCTGGAGACCAGCAGCATCCCA---------TTTCTCAGGCAGTGTGCTGGCGTTCCATGCGAC 139
Query 44 GTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTAT 117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 GTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTAT 213
Query 118 CTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGC 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 CTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGC 287
Query 192 CAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGC 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 CAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGC 361
Query 266 TGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTG 339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 TGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTG 435
Query 340 CAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAA 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 CAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAA 509
Query 414 CAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACA 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 CAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCC-------- 575
Query 488 ACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTT 561
Sbjct 576 -------------------------------------------------------------------------- 575
Query 562 GGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGG 635
Sbjct 576 -------------------------------------------------------------------------- 575
Query 636 GGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGT 709
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 ---------------------------------------------------CAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGT 598
Query 710 CCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGG 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 CCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGG 672
Query 784 ATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCT 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 ATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCT 746
Query 858 CAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCT 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 CAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCT 820
Query 932 GGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCC 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCC 894
Query 1006 CTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGG 1079
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGG 968
Query 1080 CTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACAT 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 CTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACAT 1042
Query 1154 GGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTA 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 GGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTA 1116
Query 1228 GCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 GCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC 1164