Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12717
- Subject:
- NM_205836.3
- Aligned Length:
- 3564
- Identities:
- 2829
- Gaps:
- 735
Alignment
Query 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
Query 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
Query 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
Query 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
Query 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
Query 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGGCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGGCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
Query 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
Query 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
Query 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
Query 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
Query 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
Query 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
Query 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
Query 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
Query 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
Query 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
Query 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
Query 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
Query 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
Query 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
Query 1481 CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC 1554
Query 1555 TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA 1628
Query 1629 GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG 1702
Query 1703 CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA 1776
Query 1777 ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA 1850
Query 1851 CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATT----------- 1913
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGTAAGTG 1924
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 1925 GAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTCCCCTCGAG 1998
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 1999 GAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCTAGGGATAT 2072
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2073 TCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCACCGCCAGCACAGTGGGAAACTCCA 2146
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2147 GCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGC 2220
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2221 CCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAGGACTCTGAGGCCATGGAGGA 2294
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2295 GGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGAATCCCAAAGGAGAACTAGCA 2368
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2369 GGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCCCGGATGGTACGAGATCCGCC 2442
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2443 TTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGATGAGAGGACTAATGGGAGTGGCTC 2516
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2517 TGGGGCTACAGGTGAGGACAGGAGGGGGAGCTCCCAGCCTGAGAGTTGTGACGTGCAGTCTAATGAAGACTACC 2590
Query 1914 ----------------------------------------------------------GTCAGAAGTAGCCAAA 1929
||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTCGGAGGCCCCTAACCAGGGCCAGGAGCAGACTGTCCCATGTACTGCTGGTATCTGAGTCAGAAGTAGCCAAA 2664
Query 1930 ACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGTACAAGTGATCCTGTGATCGA 2003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGTACAAGTGATCCTGTGATCGA 2738
Query 2004 GGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCACTATGACCAATTGTGGAATCA 2077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCACTATGACCAATTGTGGAATCA 2812
Query 2078 CAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGTGCAGGGTACTAAAACATTTA 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGTGCAGGGTACTAAAACATTTA 2886
Query 2152 AAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAACTGAACATGGATCAGGTACT 2225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAACTGAACATGGATCAGGTACT 2960
Query 2226 AGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCCAATGCAGCAGGTGGACACTC 2299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCCAATGCAGCAGGTGGACACTC 3034
Query 2300 TAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTATCCATGAATTCAGTAACCCT 2373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTATCCATGAATTCAGTAACCCT 3108
Query 2374 CCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAACATCAATCAAGAGCTCATTAA 2447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAACATCAATCAAGAGCTCATTAA 3182
Query 2448 ATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAG 2521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAG 3256
Query 2522 AAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCA 2595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 AAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCA 3330
Query 2596 TTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAAGAAAGCACTATCTATGCTCC 2669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 TTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAAGAAAGCACTATCTATGCTCC 3404
Query 2670 TAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGAAATTTCAGAGATGCGTCAGA 2743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGAAATTTCAGAGATGCGTCAGA 3478
Query 2744 TGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAA 2817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAA 3552
Query 2818 GATGACTACATT 2829
||||||||||||
Sbjct 3553 GATGACTACATT 3564